RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589969.1

NFIC-209, Transcript of nuclear factor I C, humanhuman

TSL 3

Gene NFIC, Length 614 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIC-209ENST00000589969 SLC27A3Q5K4L6 730 aa28.56■■■□□ 2.16
NFIC-209ENST00000589969 TATP17735 454 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
NFIC-209ENST00000589969 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
NFIC-209ENST00000589969 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
NFIC-209ENST00000589969 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
NFIC-209ENST00000589969 KAT6BQ8WYB5 2073 aa28.55■■■□□ 2.16
NFIC-209ENST00000589969 ZBTB7AO95365 584 aa28.54■■■□□ 2.16
NFIC-209ENST00000589969 USHBP1Q8N6Y0 703 aa28.54■■■□□ 2.16
NFIC-209ENST00000589969 POLR3GLQ9BT43 218 aa28.54■■■□□ 2.16
NFIC-209ENST00000589969 RGPD2P0DJD1 1756 aa28.53■■■□□ 2.16
NFIC-209ENST00000589969 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa28.52■■■□□ 2.16
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NFIC-209ENST00000589969 LRRC4BQ9NT99 713 aa28.51■■■□□ 2.15
NFIC-209ENST00000589969 DCAF8L1A6NGE4 600 aa28.49■■■□□ 2.15
NFIC-209ENST00000589969 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
NFIC-209ENST00000589969 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
NFIC-209ENST00000589969 PAPPAQ13219 1627 aa28.49■■■□□ 2.15
NFIC-209ENST00000589969 WASHC2AQ641Q2 1341 aa28.48■■■□□ 2.15
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NFIC-209ENST00000589969 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa28.48■■■□□ 2.15
NFIC-209ENST00000589969 PTGER2P43116 358 aa28.48■■■□□ 2.15
NFIC-209ENST00000589969 SHANK3Q9BYB0 1731 aa28.46■■■□□ 2.15
NFIC-209ENST00000589969 NSD2O96028 1365 aa28.46■■■□□ 2.15
NFIC-209ENST00000589969 ZNF827Q17R98 1081 aa28.45■■■□□ 2.14
NFIC-209ENST00000589969 AKT1S1Q96B36 256 aa28.45■■■□□ 2.14
NFIC-209ENST00000589969 DOT1LQ8TEK3 1739 aa28.44■■■□□ 2.14
NFIC-209ENST00000589969 POLKQ9UBT6 870 aa28.43■■■□□ 2.14
NFIC-209ENST00000589969 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
NFIC-209ENST00000589969 NCAPD2Q15021 1401 aa28.42■■■□□ 2.14
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NFIC-209ENST00000589969 SLC16A10Q8TF71 515 aa28.41■■■□□ 2.14
NFIC-209ENST00000589969 PANK3Q9H999 370 aa28.41■■■□□ 2.14
NFIC-209ENST00000589969 SGIP1Q9BQI5 828 aa28.4■■■□□ 2.14
NFIC-209ENST00000589969 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
NFIC-209ENST00000589969 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa28.39■■■□□ 2.14
NFIC-209ENST00000589969 SPG7Q9UQ90 795 aa28.39■■■□□ 2.14
NFIC-209ENST00000589969 CYP27B1O15528 508 aa28.38■■■□□ 2.13
NFIC-209ENST00000589969 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP28.38■■■□□ 2.13
NFIC-209ENST00000589969 EYA1Q99502 592 aa28.37■■■□□ 2.13
NFIC-209ENST00000589969 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
NFIC-209ENST00000589969 LY75O60449 1722 aa28.35■■■□□ 2.13
NFIC-209ENST00000589969 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
NFIC-209ENST00000589969 KCNQ4P56696 695 aa28.35■■■□□ 2.13
NFIC-209ENST00000589969 ARXQ96QS3 562 aa28.35■■■□□ 2.13
NFIC-209ENST00000589969 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
NFIC-209ENST00000589969 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
NFIC-209ENST00000589969 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa28.34■■■□□ 2.13
NFIC-209ENST00000589969 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa28.33■■■□□ 2.13
NFIC-209ENST00000589969 SYT17Q9BSW7 474 aa28.33■■■□□ 2.13
NFIC-209ENST00000589969 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
NFIC-209ENST00000589969 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
NFIC-209ENST00000589969 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa28.32■■■□□ 2.12
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NFIC-209ENST00000589969 PKD1L3Q7Z443 1732 aa28.32■■■□□ 2.12
NFIC-209ENST00000589969 POLD1P28340 1107 aa28.3■■■□□ 2.12
NFIC-209ENST00000589969 PALLDQ8WX93 1383 aa28.29■■■□□ 2.12
NFIC-209ENST00000589969 MAP3K5Q99683 1374 aa28.29■■■□□ 2.12
NFIC-209ENST00000589969 KNSTRNQ9Y448 316 aa28.29■■■□□ 2.12
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NFIC-209ENST00000589969 TMOD3Q9NYL9 352 aa28.22■■■□□ 2.11
NFIC-209ENST00000589969 MSH5O43196 834 aa28.21■■■□□ 2.11
NFIC-209ENST00000589969 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa28.21■■■□□ 2.11
NFIC-209ENST00000589969 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
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NFIC-209ENST00000589969 ITGB4P16144 1822 aa28.18■■■□□ 2.1
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NFIC-209ENST00000589969 AMOTQ4VCS5 1084 aa28.17■■■□□ 2.1
NFIC-209ENST00000589969 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
NFIC-209ENST00000589969 AK7Q96M32 723 aa28.16■■■□□ 2.1
NFIC-209ENST00000589969 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa28.15■■■□□ 2.1
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NFIC-209ENST00000589969 ERVV-2B6SEH9 535 aa28.14■■■□□ 2.1
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NFIC-209ENST00000589969 TAF1LQ8IZX4 1826 aa28.11■■■□□ 2.09
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NFIC-209ENST00000589969 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
NFIC-209ENST00000589969 GPR162Q16538 588 aa28.09■■■□□ 2.09
NFIC-209ENST00000589969 ATG3Q9NT62 314 aa28.09■■■□□ 2.09
NFIC-209ENST00000589969 UTRNP46939 3433 aa28.09■■■□□ 2.09
NFIC-209ENST00000589969 SSFA2P28290 1259 aa28.08■■■□□ 2.09
NFIC-209ENST00000589969 IL13P35225 146 aa28.08■■■□□ 2.09
NFIC-209ENST00000589969 ATP6V1AP38606 617 aa28.08■■■□□ 2.09
NFIC-209ENST00000589969 SULT6B1Q6IMI4 303 aa28.08■■■□□ 2.09
NFIC-209ENST00000589969 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
NFIC-209ENST00000589969 C1orf141Q5JVX7 400 aa28.07■■■□□ 2.08
NFIC-209ENST00000589969 MSL1Q68DK7 614 aa28.07■■■□□ 2.08
NFIC-209ENST00000589969 AEBP1Q8IUX7 1158 aa28.07■■■□□ 2.08
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