RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589853.3

GTF3C2-AS1-207, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C2-AS1, Length 537 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ZFAND3Q9H8U3 227 aa10.03□□□□□ -0.8
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TIMP2P16035 220 aa10.02□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 EML3Q32P44 896 aa10.02□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PEG3Q9GZU2 1588 aa10.01□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LILRA1O75019 489 aa10.01□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ERVK-9P63128 1117 aa10.01□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MYT1Q01538 1121 aa10.01□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 USP4Q13107 963 aa10.01□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CBLBQ13191 982 aa10.01□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa10.01□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 DGAT1O75907 488 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ADD1P35611 737 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LAPTM4AQ15012 233 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CDCA8Q53HL2 280 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MYCP01106 439 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 WIZO95785 1651 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 AVPP01185 164 aa9.98□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NOD1Q9Y239 953 aa9.98□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 HMGXB3Q12766 1538 aa9.97□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SIRT1Q96EB6 747 aa9.97□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 OSBPL3Q9H4L5 887 aa9.97□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 VRTNQ9H8Y1 702 aa9.97□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SMARCA2P51531 1590 aa9.97□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TRIM52Q96A61 297 aa9.96□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 Q6ZVU0 165 aa9.95□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 AGBL1Q96MI9 1066 aa9.95□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NESP48681 1621 aa9.95□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa9.94□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RASA1P20936 1047 aa9.94□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GTF2IP78347 998 aa9.94□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CLDN10P78369 228 aa9.94□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PBXIP1Q96AQ6 731 aa9.94□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa9.94□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 AXIN1O15169 862 aa9.93□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ST8SIA5O15466 376 aa9.93□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ADH1AP07327 375 aa9.93□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TRIM50Q86XT4 487 aa9.93□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 OGFOD1Q8N543 542 aa9.93□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 STAU1O95793 577 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RELBQ01201 579 aa9.92□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PSME1Q06323 249 aa9.92□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CTC1Q2NKJ3 1217 aa9.92□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CYP2U1Q7Z449 544 aa9.92□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MEIOBQ8N635 442 aa9.92□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 BMP1P13497 986 aa9.91□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ATP1A2P50993 1020 aa9.91□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 AAASQ9NRG9 546 aa9.91□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 KIAA1024Q9UPX6 916 aa9.91□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 Q6ZNB5 142 aa9.9□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CRIPAKQ8N1N5 446 aa9.9□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PTGIRP43119 386 aa9.89□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PTK7Q13308 1070 aa9.89□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa9.89□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RAB6BQ9NRW1 208 aa9.89□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 USP17L15C9J2P7 530 aa9.88□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 USP17L10C9JJH3 530 aa9.88□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 USP17L13C9JLJ4 530 aa9.88□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 USP17L12C9JPN9 530 aa9.88□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 USP17L11C9JVI0 530 aa9.88□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 USP17L21D6R901 530 aa9.88□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 USP17L18D6R9N7 530 aa9.88□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 USP17L22D6RA61 530 aa9.88□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 USP17L17D6RBQ6 530 aa9.88□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 USP17L19D6RCP7 530 aa9.88□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 USP17L20D6RJB6 530 aa9.88□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GNRH1P01148 92 aa9.88□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 USP17L24Q0WX57 530 aa9.88□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 C6orf118Q5T5N4 469 aa9.88□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CCDC102BQ68D86 513 aa9.88□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LINC00528Q8N1L1 170 aa9.88□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LARGE2Q8N3Y3 721 aa9.88□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TPCN2Q8NHX9 752 aa9.88□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 DACH1Q9UI36 760 aa9.88□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 A0A1W2PRU2 124 aa9.87□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FAM196BA6NMK8 535 aa9.87□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 UPP2O95045 317 aa9.87□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 BMP2P12643 396 aa9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.6 ms