RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589585.1

CTIF-207, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 4

Gene CTIF, Length 564 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-207ENST00000589585 SBF2Q86WG5 1849 aa18.66■□□□□ 0.58
CTIF-207ENST00000589585 PTF1AQ7RTS3 328 aa18.66■□□□□ 0.58
CTIF-207ENST00000589585 ACSBG1Q96GR2 724 aa18.66■□□□□ 0.58
CTIF-207ENST00000589585 EYA1Q99502 592 aa18.66■□□□□ 0.58
CTIF-207ENST00000589585 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
CTIF-207ENST00000589585 PARD3Q8TEW0 1356 aa18.66■□□□□ 0.58
CTIF-207ENST00000589585 MEGF6O75095 1541 aa18.65■□□□□ 0.58
CTIF-207ENST00000589585 BCL9O00512 1426 aa18.64■□□□□ 0.57
CTIF-207ENST00000589585 KCNQ2O43526 872 aa18.63■□□□□ 0.57
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CTIF-207ENST00000589585 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
CTIF-207ENST00000589585 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa18.62■□□□□ 0.57
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CTIF-207ENST00000589585 SULT6B1Q6IMI4 303 aa18.54■□□□□ 0.56
CTIF-207ENST00000589585 AEBP1Q8IUX7 1158 aa18.54■□□□□ 0.56
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CTIF-207ENST00000589585 IFNL2Q8IZJ0 200 aa18.49■□□□□ 0.55
CTIF-207ENST00000589585 CFAP53Q96M91 514 aa18.49■□□□□ 0.55
CTIF-207ENST00000589585 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
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CTIF-207ENST00000589585 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
CTIF-207ENST00000589585 BTAF1O14981 1849 aa18.46■□□□□ 0.55
CTIF-207ENST00000589585 PKD1L3Q7Z443 1732 aa18.46■□□□□ 0.55
CTIF-207ENST00000589585 DOT1LQ8TEK3 1739 aa18.46■□□□□ 0.55
CTIF-207ENST00000589585 KDRP35968 1356 aa18.45■□□□□ 0.54
CTIF-207ENST00000589585 C1orf141Q5JVX7 400 aa18.45■□□□□ 0.54
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CTIF-207ENST00000589585 PIGBQ92521 554 aa18.42■□□□□ 0.54
CTIF-207ENST00000589585 DCAF5Q96JK2 942 aa18.42■□□□□ 0.54
CTIF-207ENST00000589585 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
CTIF-207ENST00000589585 NUDCQ9Y266 331 aa18.42■□□□□ 0.54
CTIF-207ENST00000589585 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
CTIF-207ENST00000589585 SLC15A2Q16348 729 aa18.4■□□□□ 0.54
CTIF-207ENST00000589585 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
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CTIF-207ENST00000589585 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
CTIF-207ENST00000589585 CABP4P57796 275 aa18.38■□□□□ 0.53
CTIF-207ENST00000589585 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP18.38■□□□□ 0.53
CTIF-207ENST00000589585 RALBP1Q15311 655 aa18.38■□□□□ 0.53
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CTIF-207ENST00000589585 PAPPAQ13219 1627 aa18.36■□□□□ 0.53
CTIF-207ENST00000589585 ZNF827Q17R98 1081 aa18.36■□□□□ 0.53
CTIF-207ENST00000589585 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
CTIF-207ENST00000589585 PRKAR2BP31323 418 aa18.35■□□□□ 0.53
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CTIF-207ENST00000589585 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa18.34■□□□□ 0.53
CTIF-207ENST00000589585 ITGB4P16144 1822 aa18.33■□□□□ 0.53
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CTIF-207ENST00000589585 AKT1S1Q96B36 256 aa18.33■□□□□ 0.52
CTIF-207ENST00000589585 LGR6Q9HBX8 967 aa18.33■□□□□ 0.52
CTIF-207ENST00000589585 ATG3Q9NT62 314 aa18.33■□□□□ 0.52
CTIF-207ENST00000589585 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa18.32■□□□□ 0.52
CTIF-207ENST00000589585 YY1P25490 414 aa18.32■□□□□ 0.52
CTIF-207ENST00000589585 SIK1P57059 783 aa18.32■□□□□ 0.52
CTIF-207ENST00000589585 GAS2L2Q8NHY3 880 aa18.32■□□□□ 0.52
CTIF-207ENST00000589585 RNMTO43148 476 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
CTIF-207ENST00000589585 FCHSD2O94868 740 aa18.31■□□□□ 0.52
CTIF-207ENST00000589585 PHACTR3Q96KR7 559 aa18.31■□□□□ 0.52
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