RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589497.5

GIPC1-210, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 5

Gene GIPC1, Length 853 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-210ENST00000589497 PLSCR1O15162 318 aa25.63■■□□□ 1.69
GIPC1-210ENST00000589497 KCNQ2O43526 872 aa25.63■■□□□ 1.69
GIPC1-210ENST00000589497 PTF1AQ7RTS3 328 aa25.63■■□□□ 1.69
GIPC1-210ENST00000589497 MEGF6O75095 1541 aa25.63■■□□□ 1.69
GIPC1-210ENST00000589497 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
GIPC1-210ENST00000589497 SPG7Q9UQ90 795 aa25.61■■□□□ 1.69
GIPC1-210ENST00000589497 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
GIPC1-210ENST00000589497 MTHFSP49914 203 aa25.59■■□□□ 1.69
GIPC1-210ENST00000589497 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa25.59■■□□□ 1.69
GIPC1-210ENST00000589497 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa25.59■■□□□ 1.69
GIPC1-210ENST00000589497 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
GIPC1-210ENST00000589497 SBF2Q86WG5 1849 aa25.58■■□□□ 1.68
GIPC1-210ENST00000589497 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa25.56■■□□□ 1.68
GIPC1-210ENST00000589497 KAT6BQ8WYB5 2073 aa25.56■■□□□ 1.68
GIPC1-210ENST00000589497 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
GIPC1-210ENST00000589497 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
GIPC1-210ENST00000589497 TXNRD1Q16881 649 aa25.53■■□□□ 1.68
GIPC1-210ENST00000589497 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP25.52■■□□□ 1.68
GIPC1-210ENST00000589497 IGSF1Q8N6C5 1336 aa25.52■■□□□ 1.68
GIPC1-210ENST00000589497 CYP27B1O15528 508 aa25.5■■□□□ 1.67
GIPC1-210ENST00000589497 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
GIPC1-210ENST00000589497 IL13P35225 146 aa25.5■■□□□ 1.67
GIPC1-210ENST00000589497 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
GIPC1-210ENST00000589497 SULT6B1Q6IMI4 303 aa25.5■■□□□ 1.67
GIPC1-210ENST00000589497 NCAPD2Q15021 1401 aa25.49■■□□□ 1.67
GIPC1-210ENST00000589497 IFNL2Q8IZJ0 200 aa25.49■■□□□ 1.67
GIPC1-210ENST00000589497 NHSQ6T4R5 1651 aa25.48■■□□□ 1.67
GIPC1-210ENST00000589497 PROM2Q8N271 834 aa25.48■■□□□ 1.67
GIPC1-210ENST00000589497 AMOTQ4VCS5 1084 aa25.47■■□□□ 1.67
GIPC1-210ENST00000589497 CFAP53Q96M91 514 aa25.47■■□□□ 1.67
GIPC1-210ENST00000589497 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa25.46■■□□□ 1.67
GIPC1-210ENST00000589497 STK32BQ9NY57 414 aa25.46■■□□□ 1.67
GIPC1-210ENST00000589497 AEBP1Q8IUX7 1158 aa25.45■■□□□ 1.66
GIPC1-210ENST00000589497 RREB1Q92766 1687 aa25.43■■□□□ 1.66
GIPC1-210ENST00000589497 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
GIPC1-210ENST00000589497 PHKG2P15735 406 aa25.43■■□□□ 1.66
GIPC1-210ENST00000589497 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
GIPC1-210ENST00000589497 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
GIPC1-210ENST00000589497 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa25.43■■□□□ 1.66
GIPC1-210ENST00000589497 SHANK3Q9BYB0 1731 aa25.43■■□□□ 1.66
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GIPC1-210ENST00000589497 C1orf141Q5JVX7 400 aa25.42■■□□□ 1.66
GIPC1-210ENST00000589497 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
GIPC1-210ENST00000589497 HMOX1P09601 288 aa25.41■■□□□ 1.66
GIPC1-210ENST00000589497 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
GIPC1-210ENST00000589497 SLC27A3Q5K4L6 730 aa25.41■■□□□ 1.66
GIPC1-210ENST00000589497 BTAF1O14981 1849 aa25.41■■□□□ 1.66
GIPC1-210ENST00000589497 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa25.41■■□□□ 1.66
GIPC1-210ENST00000589497 NUP188Q5SRE5 1749 aa25.4■■□□□ 1.66
GIPC1-210ENST00000589497 DOT1LQ8TEK3 1739 aa25.4■■□□□ 1.66
GIPC1-210ENST00000589497 PPP2R1AP30153 589 aa25.39■■□□□ 1.66
GIPC1-210ENST00000589497 TMOD3Q9NYL9 352 aa25.39■■□□□ 1.66
GIPC1-210ENST00000589497 NUDCQ9Y266 331 aa25.39■■□□□ 1.66
GIPC1-210ENST00000589497 PKD1L3Q7Z443 1732 aa25.38■■□□□ 1.65
GIPC1-210ENST00000589497 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
GIPC1-210ENST00000589497 SLC15A2Q16348 729 aa25.37■■□□□ 1.65
GIPC1-210ENST00000589497 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
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GIPC1-210ENST00000589497 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
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GIPC1-210ENST00000589497 PIGBQ92521 554 aa25.35■■□□□ 1.65
GIPC1-210ENST00000589497 LRRC4BQ9NT99 713 aa25.34■■□□□ 1.65
GIPC1-210ENST00000589497 KCNQ4P56696 695 aa25.33■■□□□ 1.65
GIPC1-210ENST00000589497 ERVV-2B6SEH9 535 aa25.32■■□□□ 1.64
GIPC1-210ENST00000589497 CABP4P57796 275 aa25.32■■□□□ 1.64
GIPC1-210ENST00000589497 PALLDQ8WX93 1383 aa25.31■■□□□ 1.64
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GIPC1-210ENST00000589497 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
GIPC1-210ENST00000589497 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP25.29■■□□□ 1.64
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GIPC1-210ENST00000589497 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa25.29■■□□□ 1.64
GIPC1-210ENST00000589497 RALBP1Q15311 655 aa25.28■■□□□ 1.64
GIPC1-210ENST00000589497 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
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GIPC1-210ENST00000589497 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
GIPC1-210ENST00000589497 ZNF827Q17R98 1081 aa25.25■■□□□ 1.63
GIPC1-210ENST00000589497 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
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GIPC1-210ENST00000589497 ITGB4P16144 1822 aa25.23■■□□□ 1.63
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GIPC1-210ENST00000589497 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa25.23■■□□□ 1.63
GIPC1-210ENST00000589497 GAS2L2Q8NHY3 880 aa25.23■■□□□ 1.63
GIPC1-210ENST00000589497 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
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GIPC1-210ENST00000589497 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa25.22■■□□□ 1.63
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GIPC1-210ENST00000589497 NEFMP07197 916 aa25.22■■□□□ 1.63
GIPC1-210ENST00000589497 PRKAR2BP31323 418 aa25.22■■□□□ 1.63
GIPC1-210ENST00000589497 SIK1P57059 783 aa25.22■■□□□ 1.63
GIPC1-210ENST00000589497 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
GIPC1-210ENST00000589497 ATP6V1AP38606 617 aa25.21■■□□□ 1.63
GIPC1-210ENST00000589497 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
GIPC1-210ENST00000589497 LY75O60449 1722 aa25.2■■□□□ 1.63
GIPC1-210ENST00000589497 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
GIPC1-210ENST00000589497 FCHSD2O94868 740 aa25.19■■□□□ 1.62
GIPC1-210ENST00000589497 AK7Q96M32 723 aa25.19■■□□□ 1.62
GIPC1-210ENST00000589497 LGR6Q9HBX8 967 aa25.19■■□□□ 1.62
GIPC1-210ENST00000589497 RNMTO43148 476 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
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