RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 GNAT3A8MTJ3 354 aa29.44■■■□□ 2.3
CAPNS1-207ENST00000589146 CHL1O00533 1208 aa29.44■■■□□ 2.3
CAPNS1-207ENST00000589146 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
CAPNS1-207ENST00000589146 MBIPQ9NS73 344 aa29.44■■■□□ 2.3
CAPNS1-207ENST00000589146 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
CAPNS1-207ENST00000589146 AMOTQ4VCS5 1084 aa29.43■■■□□ 2.3
CAPNS1-207ENST00000589146 MCM10Q7L590 875 aa29.42■■■□□ 2.3
CAPNS1-207ENST00000589146 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
CAPNS1-207ENST00000589146 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
CAPNS1-207ENST00000589146 CHRNA2Q15822 529 aa29.4■■■□□ 2.3
CAPNS1-207ENST00000589146 PDE3AQ14432 1141 aa29.39■■■□□ 2.3
CAPNS1-207ENST00000589146 EXOC6Q8TAG9 804 aa29.39■■■□□ 2.3
CAPNS1-207ENST00000589146 FBXO41Q8TF61 875 aa29.39■■■□□ 2.3
CAPNS1-207ENST00000589146 ALDH1L2Q3SY69 923 aa29.38■■■□□ 2.29
CAPNS1-207ENST00000589146 PRDM11Q9NQV5 511 aa29.38■■■□□ 2.29
CAPNS1-207ENST00000589146 BABAM1Q9NWV8 329 aa29.38■■■□□ 2.29
CAPNS1-207ENST00000589146 TOM1O60784 492 aa29.37■■■□□ 2.29
CAPNS1-207ENST00000589146 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
CAPNS1-207ENST00000589146 C20orf194Q5TEA3 1177 aa29.36■■■□□ 2.29
CAPNS1-207ENST00000589146 CRBNQ96SW2 442 aa29.36■■■□□ 2.29
CAPNS1-207ENST00000589146 VAMP4O75379 141 aa29.35■■■□□ 2.29
CAPNS1-207ENST00000589146 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
CAPNS1-207ENST00000589146 AKAP4Q5JQC9 854 aa29.35■■■□□ 2.29
CAPNS1-207ENST00000589146 IL17REQ8NFR9 667 aa29.35■■■□□ 2.29
CAPNS1-207ENST00000589146 NLRP2Q9NX02 1062 aa29.35■■■□□ 2.29
CAPNS1-207ENST00000589146 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa29.35■■■□□ 2.29
CAPNS1-207ENST00000589146 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
CAPNS1-207ENST00000589146 SSH1Q8WYL5 1049 aa29.33■■■□□ 2.29
CAPNS1-207ENST00000589146 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP29.33■■■□□ 2.29
CAPNS1-207ENST00000589146 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa29.33■■■□□ 2.29
CAPNS1-207ENST00000589146 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
CAPNS1-207ENST00000589146 PHLPP1O60346 1717 aa29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-207ENST00000589146 WDR17Q8IZU2 1322 aa29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-207ENST00000589146 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
CAPNS1-207ENST00000589146 C8orf58Q8NAV2 365 aa29.3■■■□□ 2.28
CAPNS1-207ENST00000589146 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa29.3■■■□□ 2.28
CAPNS1-207ENST00000589146 SMC4Q9NTJ3 1288 aa29.3■■■□□ 2.28
CAPNS1-207ENST00000589146 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa29.29■■■□□ 2.28
CAPNS1-207ENST00000589146 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
CAPNS1-207ENST00000589146 TSPYL6Q8N831 410 aa29.29■■■□□ 2.28
CAPNS1-207ENST00000589146 TATP17735 454 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
CAPNS1-207ENST00000589146 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
CAPNS1-207ENST00000589146 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.28
CAPNS1-207ENST00000589146 MEGF6O75095 1541 aa29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-207ENST00000589146 PKD1L3Q7Z443 1732 aa29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-207ENST00000589146 MS4A1P11836 297 aa29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-207ENST00000589146 CANXP27824 592 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-207ENST00000589146 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-207ENST00000589146 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-207ENST00000589146 BCL2L13Q9BXK5 485 aa29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-207ENST00000589146 TSPYL4Q9UJ04 414 aa29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-207ENST00000589146 C1orf141Q5JVX7 400 aa29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-207ENST00000589146 KIF16BQ96L93 1317 aa29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-207ENST00000589146 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC136Q96JN2 1154 aa29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-207ENST00000589146 CARD10Q9BWT7 1032 aa29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-207ENST00000589146 SPG7Q9UQ90 795 aa29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-207ENST00000589146 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-207ENST00000589146 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-207ENST00000589146 RNMTO43148 476 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-207ENST00000589146 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-207ENST00000589146 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
CAPNS1-207ENST00000589146 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
CAPNS1-207ENST00000589146 LGR6Q9HBX8 967 aa29.21■■■□□ 2.27
CAPNS1-207ENST00000589146 AAMPQ13685 434 aa29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-207ENST00000589146 ARHGAP45Q92619 1136 aa29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-207ENST00000589146 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-207ENST00000589146 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa29.19■■■□□ 2.26
CAPNS1-207ENST00000589146 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa29.19■■■□□ 2.26
CAPNS1-207ENST00000589146 MIS18AQ9NYP9 233 aa29.19■■■□□ 2.26
CAPNS1-207ENST00000589146 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
CAPNS1-207ENST00000589146 UBAP1LF5GYI3 381 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-207ENST00000589146 PANK1Q8TE04 598 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-207ENST00000589146 KDM3BQ7LBC6 1761 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-207ENST00000589146 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
CAPNS1-207ENST00000589146 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-207ENST00000589146 RLBP1P12271 317 aa29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-207ENST00000589146 PHKG2P15735 406 aa29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-207ENST00000589146 EVA1CP58658 441 aa29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-207ENST00000589146 PIP4K2BP78356 416 aa29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-207ENST00000589146 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-207ENST00000589146 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-207ENST00000589146 TRIM27P14373 513 aa29.15■■■□□ 2.26
CAPNS1-207ENST00000589146 KRT24Q2M2I5 525 aa29.15■■■□□ 2.26
CAPNS1-207ENST00000589146 IFNL2Q8IZJ0 200 aa29.15■■■□□ 2.26
CAPNS1-207ENST00000589146 SCN11AQ9UI33 1791 aa29.15■■■□□ 2.26
CAPNS1-207ENST00000589146 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
CAPNS1-207ENST00000589146 TNNQ9UQP3 1299 aa29.14■■■□□ 2.26
CAPNS1-207ENST00000589146 TEFQ10587 303 aa29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-207ENST00000589146 COG6Q9Y2V7 657 aa29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-207ENST00000589146 CERKQ8TCT0 537 aa29.12■■■□□ 2.25
CAPNS1-207ENST00000589146 BTG4Q9NY30 223 aa29.12■■■□□ 2.25
CAPNS1-207ENST00000589146 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
CAPNS1-207ENST00000589146 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
CAPNS1-207ENST00000589146 MVPQ14764 893 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
CAPNS1-207ENST00000589146 IL2RBP14784 551 aa29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-207ENST00000589146 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-207ENST00000589146 STRN4Q9NRL3 753 aa29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-207ENST00000589146 MRC1P22897 1456 aa29.1■■■□□ 2.25
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