RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, human

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CAPNS1-206	ENST00000588815	BTG4	Q9NY30	223 aa		40.44	■■■■■ 4.06
CAPNS1-206	ENST00000588815	CRB1	P82279	1406 aa		40.43	■■■■■ 4.06
CAPNS1-206	ENST00000588815	LRRC37A3	O60309	1634 aa		40.42	■■■■■ 4.06
CAPNS1-206	ENST00000588815	MAP3K5	Q99683	1374 aa		40.42	■■■■■ 4.06
CAPNS1-206	ENST00000588815	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	40.42	■■■■■ 4.06
CAPNS1-206	ENST00000588815	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	40.42	■■■■■ 4.06
CAPNS1-206	ENST00000588815	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		40.41	■■■■■ 4.06
CAPNS1-206	ENST00000588815	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	40.41	■■■■■ 4.06
CAPNS1-206	ENST00000588815	GNAI1	P63096	354 aa		40.38	■■■■■ 4.05
CAPNS1-206	ENST00000588815	STRN4	Q9NRL3	753 aa		40.38	■■■■■ 4.05
CAPNS1-206	ENST00000588815	IFT57	Q9NWB7	429 aa		40.38	■■■■■ 4.05
CAPNS1-206	ENST00000588815	MEGF6	O75095	1541 aa		40.37	■■■■■ 4.05
CAPNS1-206	ENST00000588815	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	40.35	■■■■■ 4.05
CAPNS1-206	ENST00000588815	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	40.35	■■■■■ 4.05
CAPNS1-206	ENST00000588815	ADAMTS2	O95450	1211 aa		40.35	■■■■■ 4.05
CAPNS1-206	ENST00000588815	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	40.35	■■■■■ 4.05
CAPNS1-206	ENST00000588815	HSPA1L	P34931	641 aa		40.34	■■■■■ 4.05
CAPNS1-206	ENST00000588815	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		40.34	■■■■■ 4.05
CAPNS1-206	ENST00000588815	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	40.34	■■■■■ 4.05
CAPNS1-206	ENST00000588815	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		40.34	■■■■■ 4.05
CAPNS1-206	ENST00000588815	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		40.34	■■■■■ 4.05
CAPNS1-206	ENST00000588815	SLIT2	O94813	1529 aa		40.33	■■■■■ 4.05
CAPNS1-206	ENST00000588815	SPG7	Q9UQ90	795 aa		40.33	■■■■■ 4.05
CAPNS1-206	ENST00000588815	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		40.33	■■■■■ 4.05
CAPNS1-206	ENST00000588815	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	40.32	■■■■■ 4.05
CAPNS1-206	ENST00000588815	CFAP44	Q96MT7	982 aa		40.32	■■■■■ 4.05
CAPNS1-206	ENST00000588815	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		40.32	■■■■■ 4.05
CAPNS1-206	ENST00000588815	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		40.32	■■■■■ 4.04
CAPNS1-206	ENST00000588815	ZNF853	P0CG23	659 aa		40.32	■■■■■ 4.04
CAPNS1-206	ENST00000588815	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	40.32	■■■■■ 4.04
CAPNS1-206	ENST00000588815	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	40.3	■■■■■ 4.04
CAPNS1-206	ENST00000588815	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		40.3	■■■■■ 4.04
CAPNS1-206	ENST00000588815	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	40.3	■■■■■ 4.04
CAPNS1-206	ENST00000588815	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		40.3	■■■■■ 4.04
CAPNS1-206	ENST00000588815	DCTN1	Q14203	1278 aa		40.29	■■■■■ 4.04
CAPNS1-206	ENST00000588815	MCM10	Q7L590	875 aa		40.29	■■■■■ 4.04
CAPNS1-206	ENST00000588815	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	40.26	■■■■■ 4.04
CAPNS1-206	ENST00000588815	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		40.26	■■■■■ 4.04
CAPNS1-206	ENST00000588815	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		40.26	■■■■■ 4.04
CAPNS1-206	ENST00000588815	IL2RB	P14784	551 aa		40.26	■■■■■ 4.03
CAPNS1-206	ENST00000588815	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		40.23	■■■■■ 4.03
CAPNS1-206	ENST00000588815	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		40.23	■■■■■ 4.03
CAPNS1-206	ENST00000588815	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	40.22	■■■■■ 4.03
CAPNS1-206	ENST00000588815	NEFL	P07196	543 aa		40.21	■■■■■ 4.03
CAPNS1-206	ENST00000588815	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		40.21	■■■■■ 4.03
CAPNS1-206	ENST00000588815	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	40.21	■■■■■ 4.03
CAPNS1-206	ENST00000588815	LRP6	O75581	1613 aa		40.21	■■■■■ 4.03
CAPNS1-206	ENST00000588815	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	40.21	■■■■■ 4.03
CAPNS1-206	ENST00000588815	CHL1	O00533	1208 aa		40.2	■■■■■ 4.03
CAPNS1-206	ENST00000588815	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		40.19	■■■■■ 4.03
CAPNS1-206	ENST00000588815	MBIP	Q9NS73	344 aa		40.19	■■■■■ 4.02
CAPNS1-206	ENST00000588815	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	40.18	■■■■■ 4.02
CAPNS1-206	ENST00000588815	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	40.17	■■■■■ 4.02
CAPNS1-206	ENST00000588815	DISP2	A7MBM2	1401 aa		40.16	■■■■■ 4.02
CAPNS1-206	ENST00000588815	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	40.16	■■■■■ 4.02
CAPNS1-206	ENST00000588815	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		40.16	■■■■■ 4.02
CAPNS1-206	ENST00000588815	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		40.16	■■■■■ 4.02
CAPNS1-206	ENST00000588815	PHKG2	P15735	406 aa		40.15	■■■■■ 4.02
CAPNS1-206	ENST00000588815	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	40.15	■■■■■ 4.02
CAPNS1-206	ENST00000588815	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		40.15	■■■■■ 4.02
CAPNS1-206	ENST00000588815	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	40.14	■■■■■ 4.02
CAPNS1-206	ENST00000588815	NGLY1	Q96IV0	654 aa		40.14	■■■■■ 4.02
CAPNS1-206	ENST00000588815	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	40.14	■■■■■ 4.02
CAPNS1-206	ENST00000588815	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		40.14	■■■■■ 4.02
CAPNS1-206	ENST00000588815	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	40.13	■■■■■ 4.02
CAPNS1-206	ENST00000588815	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		40.13	■■■■■ 4.02
CAPNS1-206	ENST00000588815	ZNF428	Q96B54	188 aa		40.13	■■■■■ 4.02
CAPNS1-206	ENST00000588815	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	40.13	■■■■■ 4.01
CAPNS1-206	ENST00000588815	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		40.13	■■■■■ 4.01
CAPNS1-206	ENST00000588815	C8orf37	Q96NL8	207 aa		40.12	■■■■■ 4.01
CAPNS1-206	ENST00000588815	USP35	Q9P2H5	1018 aa		40.1	■■■■■ 4.01
CAPNS1-206	ENST00000588815	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		40.09	■■■■■ 4.01
CAPNS1-206	ENST00000588815	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		40.09	■■■■■ 4.01
CAPNS1-206	ENST00000588815	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		40.09	■■■■■ 4.01
CAPNS1-206	ENST00000588815	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		40.09	■■■■■ 4.01
CAPNS1-206	ENST00000588815	LGR6	Q9HBX8	967 aa		40.09	■■■■■ 4.01
CAPNS1-206	ENST00000588815	CYP27B1	O15528	508 aa		40.08	■■■■■ 4.01
CAPNS1-206	ENST00000588815	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	40.08	■■■■■ 4.01
CAPNS1-206	ENST00000588815	TEF	Q10587	303 aa		40.08	■■■■■ 4.01
CAPNS1-206	ENST00000588815	DCAF5	Q96JK2	942 aa		40.08	■■■■■ 4.01
CAPNS1-206	ENST00000588815	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		40.07	■■■■■ 4.01
CAPNS1-206	ENST00000588815	MRC1	P22897	1456 aa		40.06	■■■■■ 4
CAPNS1-206	ENST00000588815	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	40.06	■■■■■ 4
CAPNS1-206	ENST00000588815	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	40.05	■■■■■ 4
CAPNS1-206	ENST00000588815	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	40.04	■■■■■ 4
CAPNS1-206	ENST00000588815	VPS72	Q15906	364 aa		40.04	■■■■■ 4
CAPNS1-206	ENST00000588815	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	40.04	■■■■■ 4
CAPNS1-206	ENST00000588815	CACNA1F	O60840	1977 aa		40.02	■■■■■ 4
CAPNS1-206	ENST00000588815	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	40.02	■■■■■ 4
CAPNS1-206	ENST00000588815	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		40.02	■■■■■ 4
CAPNS1-206	ENST00000588815	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	40	■■■■□ 3.99
CAPNS1-206	ENST00000588815	TNS2	Q63HR2	1409 aa		39.99	■■■■□ 3.99
CAPNS1-206	ENST00000588815	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		39.99	■■■■□ 3.99
CAPNS1-206	ENST00000588815	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		39.99	■■■■□ 3.99
CAPNS1-206	ENST00000588815	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	39.98	■■■■□ 3.99
CAPNS1-206	ENST00000588815	USP21	Q9UK80	565 aa		39.98	■■■■□ 3.99
CAPNS1-206	ENST00000588815	VAMP4	O75379	141 aa		39.97	■■■■□ 3.99
CAPNS1-206	ENST00000588815	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		39.96	■■■■□ 3.99
CAPNS1-206	ENST00000588815	EXOC5	O00471	708 aa		39.95	■■■■□ 3.99
CAPNS1-206	ENST00000588815	FKBP8	Q14318	412 aa		39.95	■■■■□ 3.99

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