RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588707.5

GTF3C2-AS1-205, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C2-AS1, Length 607 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP9.75□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ACSBG1Q96GR2 724 aa9.75□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CFAP53Q96M91 514 aa9.75□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NUP188Q5SRE5 1749 aa9.75□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SBF2Q86WG5 1849 aa9.75□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 RTL1A6NKG5 1358 aa9.75□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP9.74□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NBPF14Q5TI25 921 aa9.74□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KIF20BQ96Q89 1820 aa9.74□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa9.73□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NBPF6Q5VWK0 638 aa9.73□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PROM2Q8N271 834 aa9.73□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 USHBP1Q8N6Y0 703 aa9.73□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NBPF4Q96M43 638 aa9.73□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa9.73□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 LRP5O75197 1615 aa9.73□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 FLT4P35916 1363 aa9.73□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TXNRD1Q16881 649 aa9.72□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MEGF6O75095 1541 aa9.72□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa9.71□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KIF24Q5T7B8 1368 aa9.71□□□□□ -0.86
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NHSQ6T4R5 1651 aa9.71□□□□□ -0.86
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 RGPD2P0DJD1 1756 aa9.7□□□□□ -0.86
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MTHFSP49914 203 aa9.7□□□□□ -0.86
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NUDCQ9Y266 331 aa9.7□□□□□ -0.86
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ZBED9Q6R2W3 1325 aa9.7□□□□□ -0.86
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NGEFQ8N5V2 710 aa9.69□□□□□ -0.86
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa9.69□□□□□ -0.86
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa9.69□□□□□ -0.86
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TATP17735 454 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 POLKQ9UBT6 870 aa9.68□□□□□ -0.86
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SLC15A2Q16348 729 aa9.67□□□□□ -0.86
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 STK32BQ9NY57 414 aa9.67□□□□□ -0.86
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ADAMTS8Q9UP79 889 aa9.67□□□□□ -0.86
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SHANK3Q9BYB0 1731 aa9.67□□□□□ -0.86
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SPON1Q9HCB6 807 aa9.66□□□□□ -0.86
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 BTAF1O14981 1849 aa9.66□□□□□ -0.86
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa9.65□□□□□ -0.86
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa9.65□□□□□ -0.86
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 EYA1Q99502 592 aa9.65□□□□□ -0.86
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 LRRC4BQ9NT99 713 aa9.65□□□□□ -0.86
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 DOT1LQ8TEK3 1739 aa9.65□□□□□ -0.87
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NCAPD2Q15021 1401 aa9.65□□□□□ -0.87
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CYP27B1O15528 508 aa9.64□□□□□ -0.87
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ZBTB7AO95365 584 aa9.64□□□□□ -0.87
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NEFMP07197 916 aa9.64□□□□□ -0.87
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KCNQ4P56696 695 aa9.64□□□□□ -0.87
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ZNF827Q17R98 1081 aa9.64□□□□□ -0.87
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CASZ1Q86V15 1759 aa9.64□□□□□ -0.87
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PAPPAQ13219 1627 aa9.64□□□□□ -0.87
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 RUNDC1Q96C34 613 aa9.63□□□□□ -0.87
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP9.62□□□□□ -0.87
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SLC27A3Q5K4L6 730 aa9.62□□□□□ -0.87
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SPG7Q9UQ90 795 aa9.62□□□□□ -0.87
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa9.61□□□□□ -0.87
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 AKT1S1Q96B36 256 aa9.61□□□□□ -0.87
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 IGSF1Q8N6C5 1336 aa9.6□□□□□ -0.87
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PKD1L3Q7Z443 1732 aa9.6□□□□□ -0.87
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 FCHSD2O94868 740 aa9.6□□□□□ -0.87
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PTGER2P43116 358 aa9.6□□□□□ -0.87
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MTFR1LQ9H019 292 aa9.6□□□□□ -0.87
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP9.6□□□□□ -0.87
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 LY75O60449 1722 aa9.59□□□□□ -0.87
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PHKG2P15735 406 aa9.59□□□□□ -0.87
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 IFNL2Q8IZJ0 200 aa9.59□□□□□ -0.87
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa9.59□□□□□ -0.87
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa9.59□□□□□ -0.87
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa9.58□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa9.58□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 APAF1O14727 1248 aa9.58□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PIGBQ92521 554 aa9.58□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SGIP1Q9BQI5 828 aa9.58□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PALLDQ8WX93 1383 aa9.58□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 IL13P35225 146 aa9.57□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CCDC27Q2M243 656 aa9.57□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 AEBP1Q8IUX7 1158 aa9.57□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CCDC146Q8IYE0 955 aa9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.7 ms