RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587662.1

PTPRH-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type H, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRH, Length 571 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRH-205ENST00000587662 DOT1LQ8TEK3 1739 aa32.79■■■□□ 2.84
PTPRH-205ENST00000587662 KAT6BQ8WYB5 2073 aa32.79■■■□□ 2.84
PTPRH-205ENST00000587662 TMF1P82094 1093 aa32.77■■■□□ 2.84
PTPRH-205ENST00000587662 USHBP1Q8N6Y0 703 aa32.76■■■□□ 2.83
PTPRH-205ENST00000587662 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP32.76■■■□□ 2.83
PTPRH-205ENST00000587662 CARD14Q9BXL6 1004 aa32.75■■■□□ 2.83
PTPRH-205ENST00000587662 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP32.74■■■□□ 2.83
PTPRH-205ENST00000587662 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP32.74■■■□□ 2.83
PTPRH-205ENST00000587662 SLC27A3Q5K4L6 730 aa32.74■■■□□ 2.83
PTPRH-205ENST00000587662 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa32.74■■■□□ 2.83
PTPRH-205ENST00000587662 LY75O60449 1722 aa32.73■■■□□ 2.83
PTPRH-205ENST00000587662 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa32.72■■■□□ 2.83
PTPRH-205ENST00000587662 QSER1Q2KHR3 1735 aa32.72■■■□□ 2.83
PTPRH-205ENST00000587662 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa32.72■■■□□ 2.83
PTPRH-205ENST00000587662 ARXQ96QS3 562 aa32.72■■■□□ 2.83
PTPRH-205ENST00000587662 MAP3K5Q99683 1374 aa32.71■■■□□ 2.83
PTPRH-205ENST00000587662 COL24A1Q17RW2 1714 aa32.71■■■□□ 2.83
PTPRH-205ENST00000587662 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP32.71■■■□□ 2.83
PTPRH-205ENST00000587662 DCAF8L1A6NGE4 600 aa32.69■■■□□ 2.82
PTPRH-205ENST00000587662 INSRP06213 1382 aa32.69■■■□□ 2.82
PTPRH-205ENST00000587662 KIF20BQ96Q89 1820 aa32.67■■■□□ 2.82
PTPRH-205ENST00000587662 FLT4P35916 1363 aa32.63■■■□□ 2.81
PTPRH-205ENST00000587662 CGNL1Q0VF96 1302 aa32.63■■■□□ 2.81
PTPRH-205ENST00000587662 SLC16A10Q8TF71 515 aa32.63■■■□□ 2.81
PTPRH-205ENST00000587662 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa32.63■■■□□ 2.81
PTPRH-205ENST00000587662 NSD3Q9BZ95 1437 aa32.61■■■□□ 2.81
PTPRH-205ENST00000587662 KIF24Q5T7B8 1368 aa32.61■■■□□ 2.81
PTPRH-205ENST00000587662 NCAPD2Q15021 1401 aa32.6■■■□□ 2.81
PTPRH-205ENST00000587662 CYP27B1O15528 508 aa32.6■■■□□ 2.81
PTPRH-205ENST00000587662 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa32.6■■■□□ 2.81
PTPRH-205ENST00000587662 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa32.59■■■□□ 2.81
PTPRH-205ENST00000587662 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP32.59■■■□□ 2.81
PTPRH-205ENST00000587662 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP32.59■■■□□ 2.81
PTPRH-205ENST00000587662 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP32.58■■■□□ 2.81
PTPRH-205ENST00000587662 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa32.57■■■□□ 2.81
PTPRH-205ENST00000587662 CDCA8Q53HL2 280 aa32.57■■■□□ 2.8
PTPRH-205ENST00000587662 TATP17735 454 aaPredicted RBP32.56■■■□□ 2.8
PTPRH-205ENST00000587662 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa32.54■■■□□ 2.8
PTPRH-205ENST00000587662 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP32.54■■■□□ 2.8
PTPRH-205ENST00000587662 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa32.53■■■□□ 2.8
PTPRH-205ENST00000587662 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa32.53■■■□□ 2.8
PTPRH-205ENST00000587662 PKD1L3Q7Z443 1732 aa32.52■■■□□ 2.8
PTPRH-205ENST00000587662 NLGN2Q8NFZ4 835 aa32.52■■■□□ 2.8
PTPRH-205ENST00000587662 AMIGO3Q86WK7 504 aa32.49■■■□□ 2.79
PTPRH-205ENST00000587662 PALLDQ8WX93 1383 aa32.48■■■□□ 2.79
PTPRH-205ENST00000587662 C5P01031 1676 aa32.48■■■□□ 2.79
PTPRH-205ENST00000587662 POLD1P28340 1107 aa32.48■■■□□ 2.79
PTPRH-205ENST00000587662 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa32.48■■■□□ 2.79
PTPRH-205ENST00000587662 CHD4Q14839 1912 aa32.47■■■□□ 2.79
PTPRH-205ENST00000587662 WASHC2AQ641Q2 1341 aa32.47■■■□□ 2.79
PTPRH-205ENST00000587662 TAF1LQ8IZX4 1826 aa32.45■■■□□ 2.79
PTPRH-205ENST00000587662 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP32.45■■■□□ 2.79
PTPRH-205ENST00000587662 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa32.45■■■□□ 2.79
PTPRH-205ENST00000587662 EYA1Q99502 592 aa32.45■■■□□ 2.79
PTPRH-205ENST00000587662 POLKQ9UBT6 870 aa32.45■■■□□ 2.79
PTPRH-205ENST00000587662 ITGB4P16144 1822 aa32.44■■■□□ 2.78
PTPRH-205ENST00000587662 KLHL34Q8N239 644 aa32.44■■■□□ 2.78
PTPRH-205ENST00000587662 PIGBQ92521 554 aa32.43■■■□□ 2.78
PTPRH-205ENST00000587662 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP32.42■■■□□ 2.78
PTPRH-205ENST00000587662 MSL1Q68DK7 614 aa32.42■■■□□ 2.78
PTPRH-205ENST00000587662 GPR162Q16538 588 aa32.41■■■□□ 2.78
PTPRH-205ENST00000587662 SMIM5Q71RC9 77 aa32.4■■■□□ 2.78
PTPRH-205ENST00000587662 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP32.4■■■□□ 2.78
PTPRH-205ENST00000587662 C4BP0C0L5 1744 aa32.38■■■□□ 2.77
PTPRH-205ENST00000587662 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP32.38■■■□□ 2.77
PTPRH-205ENST00000587662 CLSPNQ9HAW4 1339 aa32.37■■■□□ 2.77
PTPRH-205ENST00000587662 MSH5O43196 834 aa32.37■■■□□ 2.77
PTPRH-205ENST00000587662 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP32.34■■■□□ 2.77
PTPRH-205ENST00000587662 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP32.34■■■□□ 2.77
PTPRH-205ENST00000587662 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP32.32■■■□□ 2.76
PTPRH-205ENST00000587662 PCGF6Q9BYE7 350 aa32.32■■■□□ 2.76
PTPRH-205ENST00000587662 SPG7Q9UQ90 795 aa32.32■■■□□ 2.76
PTPRH-205ENST00000587662 UBR3Q6ZT12 1888 aa32.31■■■□□ 2.76
PTPRH-205ENST00000587662 PHKG2P15735 406 aa32.31■■■□□ 2.76
PTPRH-205ENST00000587662 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP32.31■■■□□ 2.76
PTPRH-205ENST00000587662 LINC00116Q8NCU8 138 aa32.31■■■□□ 2.76
PTPRH-205ENST00000587662 ASAP1Q9ULH1 1129 aa32.3■■■□□ 2.76
PTPRH-205ENST00000587662 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP32.29■■■□□ 2.76
PTPRH-205ENST00000587662 ITPK1Q13572 414 aa32.29■■■□□ 2.76
PTPRH-205ENST00000587662 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP32.28■■■□□ 2.76
PTPRH-205ENST00000587662 FLAD1Q8NFF5 587 aa32.28■■■□□ 2.76
PTPRH-205ENST00000587662 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa32.27■■■□□ 2.76
PTPRH-205ENST00000587662 SIK1P57059 783 aa32.27■■■□□ 2.76
PTPRH-205ENST00000587662 POLR3GLQ9BT43 218 aa32.27■■■□□ 2.76
PTPRH-205ENST00000587662 IGSF1Q8N6C5 1336 aa32.26■■■□□ 2.75
PTPRH-205ENST00000587662 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP32.25■■■□□ 2.75
PTPRH-205ENST00000587662 AK7Q96M32 723 aa32.25■■■□□ 2.75
PTPRH-205ENST00000587662 IFNL2Q8IZJ0 200 aa32.24■■■□□ 2.75
PTPRH-205ENST00000587662 PANK3Q9H999 370 aa32.24■■■□□ 2.75
PTPRH-205ENST00000587662 ATG3Q9NT62 314 aa32.24■■■□□ 2.75
PTPRH-205ENST00000587662 CD2APQ9Y5K6 639 aa32.24■■■□□ 2.75
PTPRH-205ENST00000587662 PHF14O94880 888 aa32.23■■■□□ 2.75
PTPRH-205ENST00000587662 C1QTNF8P60827 252 aa32.22■■■□□ 2.75
PTPRH-205ENST00000587662 SLC4A9Q96Q91 983 aa32.22■■■□□ 2.75
PTPRH-205ENST00000587662 TMOD3Q9NYL9 352 aa32.22■■■□□ 2.75
PTPRH-205ENST00000587662 KDRP35968 1356 aa32.21■■■□□ 2.75
PTPRH-205ENST00000587662 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa32.2■■■□□ 2.75
PTPRH-205ENST00000587662 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP32.2■■■□□ 2.75
PTPRH-205ENST00000587662 SSFA2P28290 1259 aa32.19■■■□□ 2.74
PTPRH-205ENST00000587662 CEP350Q5VT06 3117 aa32.18■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms