RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587215.1

PKN1-209, Transcript of protein kinase N1, humanhuman

TSL 3

Gene PKN1, Length 363 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1-209ENST00000587215 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.98■■□□□ 1.27
PKN1-209ENST00000587215 CASZ1Q86V15 1759 aa22.97■■□□□ 1.27
PKN1-209ENST00000587215 ZBTB7AO95365 584 aa22.97■■□□□ 1.27
PKN1-209ENST00000587215 FLT4P35916 1363 aa22.97■■□□□ 1.27
PKN1-209ENST00000587215 BTAF1O14981 1849 aa22.96■■□□□ 1.27
PKN1-209ENST00000587215 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PKN1-209ENST00000587215 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.95■■□□□ 1.26
PKN1-209ENST00000587215 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.95■■□□□ 1.26
PKN1-209ENST00000587215 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.94■■□□□ 1.26
PKN1-209ENST00000587215 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PKN1-209ENST00000587215 PTGER2P43116 358 aa22.94■■□□□ 1.26
PKN1-209ENST00000587215 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PKN1-209ENST00000587215 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PKN1-209ENST00000587215 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PKN1-209ENST00000587215 SHANK3Q9BYB0 1731 aa22.93■■□□□ 1.26
PKN1-209ENST00000587215 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PKN1-209ENST00000587215 ZNF827Q17R98 1081 aa22.92■■□□□ 1.26
PKN1-209ENST00000587215 NSD2O96028 1365 aa22.91■■□□□ 1.26
PKN1-209ENST00000587215 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.91■■□□□ 1.26
PKN1-209ENST00000587215 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.9■■□□□ 1.26
PKN1-209ENST00000587215 PANK3Q9H999 370 aa22.9■■□□□ 1.26
PKN1-209ENST00000587215 POLKQ9UBT6 870 aa22.9■■□□□ 1.26
PKN1-209ENST00000587215 PAPPAQ13219 1627 aa22.9■■□□□ 1.26
PKN1-209ENST00000587215 KCNQ4P56696 695 aa22.89■■□□□ 1.25
PKN1-209ENST00000587215 AKT1S1Q96B36 256 aa22.89■■□□□ 1.25
PKN1-209ENST00000587215 SGIP1Q9BQI5 828 aa22.88■■□□□ 1.25
PKN1-209ENST00000587215 MTFR1LQ9H019 292 aa22.88■■□□□ 1.25
PKN1-209ENST00000587215 CYP27B1O15528 508 aa22.87■■□□□ 1.25
PKN1-209ENST00000587215 EYA1Q99502 592 aa22.86■■□□□ 1.25
PKN1-209ENST00000587215 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.85■■□□□ 1.25
PKN1-209ENST00000587215 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.85■■□□□ 1.25
PKN1-209ENST00000587215 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.85■■□□□ 1.25
PKN1-209ENST00000587215 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
PKN1-209ENST00000587215 NCAPD2Q15021 1401 aa22.84■■□□□ 1.25
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PKN1-209ENST00000587215 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa22.82■■□□□ 1.24
PKN1-209ENST00000587215 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
PKN1-209ENST00000587215 LY75O60449 1722 aa22.8■■□□□ 1.24
PKN1-209ENST00000587215 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
PKN1-209ENST00000587215 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
PKN1-209ENST00000587215 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.8■■□□□ 1.24
PKN1-209ENST00000587215 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa22.8■■□□□ 1.24
PKN1-209ENST00000587215 SYT17Q9BSW7 474 aa22.79■■□□□ 1.24
PKN1-209ENST00000587215 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
PKN1-209ENST00000587215 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.79■■□□□ 1.24
PKN1-209ENST00000587215 SLC16A10Q8TF71 515 aa22.78■■□□□ 1.24
PKN1-209ENST00000587215 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.78■■□□□ 1.24
PKN1-209ENST00000587215 SPG7Q9UQ90 795 aa22.78■■□□□ 1.24
PKN1-209ENST00000587215 ARXQ96QS3 562 aa22.77■■□□□ 1.24
PKN1-209ENST00000587215 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.75■■□□□ 1.23
PKN1-209ENST00000587215 PIGBQ92521 554 aa22.75■■□□□ 1.23
PKN1-209ENST00000587215 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.74■■□□□ 1.23
PKN1-209ENST00000587215 MORC1Q86VD1 984 aa22.74■■□□□ 1.23
PKN1-209ENST00000587215 QSER1Q2KHR3 1735 aa22.72■■□□□ 1.23
PKN1-209ENST00000587215 PHKG2P15735 406 aa22.72■■□□□ 1.23
PKN1-209ENST00000587215 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
PKN1-209ENST00000587215 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.72■■□□□ 1.23
PKN1-209ENST00000587215 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.72■■□□□ 1.23
PKN1-209ENST00000587215 PALLDQ8WX93 1383 aa22.72■■□□□ 1.23
PKN1-209ENST00000587215 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.71■■□□□ 1.23
PKN1-209ENST00000587215 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
PKN1-209ENST00000587215 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.71■■□□□ 1.23
PKN1-209ENST00000587215 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.71■■□□□ 1.23
PKN1-209ENST00000587215 YY1P25490 414 aa22.7■■□□□ 1.22
PKN1-209ENST00000587215 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.69■■□□□ 1.22
PKN1-209ENST00000587215 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
PKN1-209ENST00000587215 ITGB4P16144 1822 aa22.68■■□□□ 1.22
PKN1-209ENST00000587215 POLD1P28340 1107 aa22.68■■□□□ 1.22
PKN1-209ENST00000587215 MAP3K5Q99683 1374 aa22.67■■□□□ 1.22
PKN1-209ENST00000587215 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.66■■□□□ 1.22
PKN1-209ENST00000587215 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
PKN1-209ENST00000587215 MSH5O43196 834 aa22.66■■□□□ 1.22
PKN1-209ENST00000587215 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PKN1-209ENST00000587215 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.66■■□□□ 1.22
PKN1-209ENST00000587215 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.66■■□□□ 1.22
PKN1-209ENST00000587215 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.65■■□□□ 1.22
PKN1-209ENST00000587215 UTRNP46939 3433 aa22.64■■□□□ 1.22
PKN1-209ENST00000587215 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.64■■□□□ 1.21
PKN1-209ENST00000587215 C5P01031 1676 aa22.63■■□□□ 1.21
PKN1-209ENST00000587215 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.63■■□□□ 1.21
PKN1-209ENST00000587215 SIK1P57059 783 aa22.63■■□□□ 1.21
PKN1-209ENST00000587215 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
PKN1-209ENST00000587215 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.63■■□□□ 1.21
PKN1-209ENST00000587215 ATG3Q9NT62 314 aa22.63■■□□□ 1.21
PKN1-209ENST00000587215 IL13P35225 146 aa22.62■■□□□ 1.21
PKN1-209ENST00000587215 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.62■■□□□ 1.21
PKN1-209ENST00000587215 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.61■■□□□ 1.21
PKN1-209ENST00000587215 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.61■■□□□ 1.21
PKN1-209ENST00000587215 SMIM5Q71RC9 77 aa22.61■■□□□ 1.21
PKN1-209ENST00000587215 ITPK1Q13572 414 aa22.6■■□□□ 1.21
PKN1-209ENST00000587215 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.6■■□□□ 1.21
PKN1-209ENST00000587215 MSL1Q68DK7 614 aa22.6■■□□□ 1.21
PKN1-209ENST00000587215 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.6■■□□□ 1.21
PKN1-209ENST00000587215 KLHL34Q8N239 644 aa22.6■■□□□ 1.21
PKN1-209ENST00000587215 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.6■■□□□ 1.21
PKN1-209ENST00000587215 DCAF5Q96JK2 942 aa22.59■■□□□ 1.21
PKN1-209ENST00000587215 AK7Q96M32 723 aa22.59■■□□□ 1.21
PKN1-209ENST00000587215 C4BP0C0L5 1744 aa22.58■■□□□ 1.21
PKN1-209ENST00000587215 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
PKN1-209ENST00000587215 ATP6V1AP38606 617 aa22.58■■□□□ 1.21
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