RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587074.1

CELF4-205, Transcript of CUGBP Elav-like family member 4, human

TSL 3

Gene CELF4, Length 411 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CELF4-205	ENST00000587074	NSD2	O96028	1365 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CELF4-205	ENST00000587074	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CELF4-205	ENST00000587074	APBA3	O96018	575 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CELF4-205	ENST00000587074	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CELF4-205	ENST00000587074	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CELF4-205	ENST00000587074	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CELF4-205	ENST00000587074	NCAPD2	Q15021	1401 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CELF4-205	ENST00000587074	BTAF1	O14981	1849 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CELF4-205	ENST00000587074	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CELF4-205	ENST00000587074	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CELF4-205	ENST00000587074	NBPF4	Q96M43	638 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CELF4-205	ENST00000587074	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CELF4-205	ENST00000587074	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CELF4-205	ENST00000587074	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CELF4-205	ENST00000587074	POLK	Q9UBT6	870 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CELF4-205	ENST00000587074	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-205	ENST00000587074	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-205	ENST00000587074	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-205	ENST00000587074	LRP5	O75197	1615 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-205	ENST00000587074	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CELF4-205	ENST00000587074	PLSCR1	O15162	318 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CELF4-205	ENST00000587074	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
CELF4-205	ENST00000587074	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
CELF4-205	ENST00000587074	KCNQ2	O43526	872 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CELF4-205	ENST00000587074	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
CELF4-205	ENST00000587074	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CELF4-205	ENST00000587074	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
CELF4-205	ENST00000587074	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
CELF4-205	ENST00000587074	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CELF4-205	ENST00000587074	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
CELF4-205	ENST00000587074	MORC1	Q86VD1	984 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CELF4-205	ENST00000587074	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
CELF4-205	ENST00000587074	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CELF4-205	ENST00000587074	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CELF4-205	ENST00000587074	PAPPA	Q13219	1627 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CELF4-205	ENST00000587074	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
CELF4-205	ENST00000587074	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
CELF4-205	ENST00000587074	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
CELF4-205	ENST00000587074	EYA1	Q99502	592 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CELF4-205	ENST00000587074	LY75	O60449	1722 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CELF4-205	ENST00000587074	ITGB4	P16144	1822 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CELF4-205	ENST00000587074	PROM2	Q8N271	834 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CELF4-205	ENST00000587074	CASZ1	Q86V15	1759 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CELF4-205	ENST00000587074	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CELF4-205	ENST00000587074	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CELF4-205	ENST00000587074	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CELF4-205	ENST00000587074	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CELF4-205	ENST00000587074	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CELF4-205	ENST00000587074	TXNRD1	Q16881	649 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CELF4-205	ENST00000587074	NBPF14	Q5TI25	921 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CELF4-205	ENST00000587074	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
CELF4-205	ENST00000587074	CYP27B1	O15528	508 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CELF4-205	ENST00000587074	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CELF4-205	ENST00000587074	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CELF4-205	ENST00000587074	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CELF4-205	ENST00000587074	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CELF4-205	ENST00000587074	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CELF4-205	ENST00000587074	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	13.59	□□□□□ -0.23
CELF4-205	ENST00000587074	IL13	P35225	146 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CELF4-205	ENST00000587074	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CELF4-205	ENST00000587074	SPG7	Q9UQ90	795 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CELF4-205	ENST00000587074	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CELF4-205	ENST00000587074	KDR	P35968	1356 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CELF4-205	ENST00000587074	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CELF4-205	ENST00000587074	MTHFS	P49914	203 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CELF4-205	ENST00000587074	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CELF4-205	ENST00000587074	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CELF4-205	ENST00000587074	C5	P01031	1676 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CELF4-205	ENST00000587074	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CELF4-205	ENST00000587074	PHKG2	P15735	406 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CELF4-205	ENST00000587074	SLC15A2	Q16348	729 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CELF4-205	ENST00000587074	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CELF4-205	ENST00000587074	STK32B	Q9NY57	414 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CELF4-205	ENST00000587074	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CELF4-205	ENST00000587074	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CELF4-205	ENST00000587074	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CELF4-205	ENST00000587074	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CELF4-205	ENST00000587074	ZNF827	Q17R98	1081 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CELF4-205	ENST00000587074	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CELF4-205	ENST00000587074	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CELF4-205	ENST00000587074	AKT1S1	Q96B36	256 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CELF4-205	ENST00000587074	PALLD	Q8WX93	1383 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CELF4-205	ENST00000587074	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
CELF4-205	ENST00000587074	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CELF4-205	ENST00000587074	KCNQ4	P56696	695 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CELF4-205	ENST00000587074	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
CELF4-205	ENST00000587074	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CELF4-205	ENST00000587074	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
CELF4-205	ENST00000587074	PIGB	Q92521	554 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CELF4-205	ENST00000587074	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
CELF4-205	ENST00000587074	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CELF4-205	ENST00000587074	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CELF4-205	ENST00000587074	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
CELF4-205	ENST00000587074	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
CELF4-205	ENST00000587074	SPON1	Q9HCB6	807 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CELF4-205	ENST00000587074	C4B	P0C0L5	1744 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CELF4-205	ENST00000587074	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CELF4-205	ENST00000587074	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CELF4-205	ENST00000587074	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CELF4-205	ENST00000587074	DCAF5	Q96JK2	942 aa		13.48	□□□□□ -0.25

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