RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 CGNL1Q0VF96 1302 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRM-214ENST00000583153 CAMKK2Q96RR4 588 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRM-214ENST00000583153 PANK3Q9H999 370 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRM-214ENST00000583153 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
PTPRM-214ENST00000583153 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
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PTPRM-214ENST00000583153 AMOTQ4VCS5 1084 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRM-214ENST00000583153 C1orf141Q5JVX7 400 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRM-214ENST00000583153 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
PTPRM-214ENST00000583153 TMOD3Q9NYL9 352 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRM-214ENST00000583153 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
PTPRM-214ENST00000583153 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
PTPRM-214ENST00000583153 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
PTPRM-214ENST00000583153 AEBP1Q8IUX7 1158 aa11.23□□□□□ -0.61
PTPRM-214ENST00000583153 PIGBQ92521 554 aa11.23□□□□□ -0.61
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