RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578093.1

PTPRM-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-206ENST00000578093 DDX12PQ92771 950 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-206ENST00000578093 EPAS1Q99814 870 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-206ENST00000578093 NAIPQ13075 1403 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-206ENST00000578093 NWD2Q9ULI1 1742 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-206ENST00000578093 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-206ENST00000578093 SLIT2O94813 1529 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-206ENST00000578093 RALGAPBQ86X10 1494 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-206ENST00000578093 PHF14O94880 888 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-206ENST00000578093 NUDT7P0C024 238 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-206ENST00000578093 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-206ENST00000578093 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-206ENST00000578093 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-206ENST00000578093 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-206ENST00000578093 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-206ENST00000578093 HFM1A2PYH4 1435 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-206ENST00000578093 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-206ENST00000578093 DMRTA1Q5VZB9 504 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-206ENST00000578093 GPIHBP1Q8IV16 184 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-206ENST00000578093 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-206ENST00000578093 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-206ENST00000578093 TECPR2O15040 1411 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-206ENST00000578093 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-206ENST00000578093 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-206ENST00000578093 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-206ENST00000578093 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-206ENST00000578093 OSBPP22059 807 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-206ENST00000578093 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-206ENST00000578093 FBXW7Q969H0 707 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-206ENST00000578093 RGPD1P0DJD0 1748 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-206ENST00000578093 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-206ENST00000578093 ALS2Q96Q42 1657 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-206ENST00000578093 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-206ENST00000578093 NUTM2FA1L443 756 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-206ENST00000578093 TYW1BQ6NUM6 668 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-206ENST00000578093 DEFB132Q7Z7B7 95 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-206ENST00000578093 NPHP3Q7Z494 1330 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRM-206ENST00000578093 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRM-206ENST00000578093 PIK3C2GO75747 1445 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRM-206ENST00000578093 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRM-206ENST00000578093 FOXO3O43524 673 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRM-206ENST00000578093 ESCO1Q5FWF5 840 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRM-206ENST00000578093 THSD4Q6ZMP0 1018 aa6.01□□□□□ -1.45
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PTPRM-206ENST00000578093 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
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PTPRM-206ENST00000578093 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRM-206ENST00000578093 TNS3Q68CZ2 1445 aa6□□□□□ -1.45
PTPRM-206ENST00000578093 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PTPRM-206ENST00000578093 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PTPRM-206ENST00000578093 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa6□□□□□ -1.45
PTPRM-206ENST00000578093 WAPLQ7Z5K2 1190 aa6□□□□□ -1.45
PTPRM-206ENST00000578093 ZDHHC16Q969W1 377 aa6□□□□□ -1.45
PTPRM-206ENST00000578093 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa6□□□□□ -1.45
PTPRM-206ENST00000578093 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
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PTPRM-206ENST00000578093 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa5.99□□□□□ -1.45
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PTPRM-206ENST00000578093 CABLES1Q8TDN4 633 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRM-206ENST00000578093 STK26Q9P289 416 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRM-206ENST00000578093 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
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PTPRM-206ENST00000578093 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRM-206ENST00000578093 NUP188Q5SRE5 1749 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRM-206ENST00000578093 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa5.98□□□□□ -1.45
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PTPRM-206ENST00000578093 ZMYND10O75800 440 aa5.97□□□□□ -1.45
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PTPRM-206ENST00000578093 ADGRB1O14514 1584 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRM-206ENST00000578093 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.45
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PTPRM-206ENST00000578093 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa5.96□□□□□ -1.46
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PTPRM-206ENST00000578093 FAM182BQ5T319 152 aa5.95□□□□□ -1.46
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PTPRM-206ENST00000578093 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRM-206ENST00000578093 TULP4Q9NRJ4 1543 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRM-206ENST00000578093 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRM-206ENST00000578093 ANKARQ7Z5J8 1434 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRM-206ENST00000578093 HRCP23327 699 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRM-206ENST00000578093 PTPREP23469 700 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRM-206ENST00000578093 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
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