RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576589.1

NOMO3-217, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

TSL 5

Gene NOMO3, Length 683 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-217ENST00000576589 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa38.34■■■■□ 3.73
NOMO3-217ENST00000576589 MEGF6O75095 1541 aa38.34■■■■□ 3.73
NOMO3-217ENST00000576589 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP38.34■■■■□ 3.73
NOMO3-217ENST00000576589 TATP17735 454 aaPredicted RBP38.33■■■■□ 3.73
NOMO3-217ENST00000576589 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP38.33■■■■□ 3.73
NOMO3-217ENST00000576589 EYA1Q99502 592 aa38.33■■■■□ 3.73
NOMO3-217ENST00000576589 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP38.3■■■■□ 3.72
NOMO3-217ENST00000576589 NUP188Q5SRE5 1749 aa38.29■■■■□ 3.72
NOMO3-217ENST00000576589 PTF1AQ7RTS3 328 aa38.27■■■■□ 3.72
NOMO3-217ENST00000576589 MTHFSP49914 203 aa38.25■■■■□ 3.71
NOMO3-217ENST00000576589 NCAPD2Q15021 1401 aa38.25■■■■□ 3.71
NOMO3-217ENST00000576589 ACSBG1Q96GR2 724 aa38.25■■■■□ 3.71
NOMO3-217ENST00000576589 PLSCR1O15162 318 aa38.24■■■■□ 3.71
NOMO3-217ENST00000576589 KCNQ2O43526 872 aa38.22■■■■□ 3.71
NOMO3-217ENST00000576589 IGSF1Q8N6C5 1336 aa38.19■■■■□ 3.7
NOMO3-217ENST00000576589 SBF2Q86WG5 1849 aa38.16■■■■□ 3.7
NOMO3-217ENST00000576589 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa38.15■■■■□ 3.7
NOMO3-217ENST00000576589 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa38.15■■■■□ 3.7
NOMO3-217ENST00000576589 IL13P35225 146 aa38.15■■■■□ 3.7
NOMO3-217ENST00000576589 SPG7Q9UQ90 795 aa38.13■■■■□ 3.69
NOMO3-217ENST00000576589 SPON1Q9HCB6 807 aa38.12■■■■□ 3.69
NOMO3-217ENST00000576589 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP38.11■■■■□ 3.69
NOMO3-217ENST00000576589 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa38.11■■■■□ 3.69
NOMO3-217ENST00000576589 CYP27B1O15528 508 aa38.1■■■■□ 3.69
NOMO3-217ENST00000576589 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP38.1■■■■□ 3.69
NOMO3-217ENST00000576589 PROM2Q8N271 834 aa38.09■■■■□ 3.69
NOMO3-217ENST00000576589 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP38.09■■■■□ 3.69
NOMO3-217ENST00000576589 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP38.08■■■■□ 3.69
NOMO3-217ENST00000576589 SHANK3Q9BYB0 1731 aa38.08■■■■□ 3.69
NOMO3-217ENST00000576589 NHSQ6T4R5 1651 aa38.07■■■■□ 3.69
NOMO3-217ENST00000576589 AEBP1Q8IUX7 1158 aa38.07■■■■□ 3.68
NOMO3-217ENST00000576589 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP38.07■■■■□ 3.68
NOMO3-217ENST00000576589 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP38.06■■■■□ 3.68
NOMO3-217ENST00000576589 SULT6B1Q6IMI4 303 aa38.06■■■■□ 3.68
NOMO3-217ENST00000576589 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP38.06■■■■□ 3.68
NOMO3-217ENST00000576589 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP38.04■■■■□ 3.68
NOMO3-217ENST00000576589 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa38.02■■■■□ 3.68
NOMO3-217ENST00000576589 PPP2R1AP30153 589 aa38.01■■■■□ 3.68
NOMO3-217ENST00000576589 TXNRD1Q16881 649 aa38■■■■□ 3.67
NOMO3-217ENST00000576589 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP38■■■■□ 3.67
NOMO3-217ENST00000576589 PKD1L3Q7Z443 1732 aa38■■■■□ 3.67
NOMO3-217ENST00000576589 IFNL2Q8IZJ0 200 aa37.99■■■■□ 3.67
NOMO3-217ENST00000576589 KDRP35968 1356 aa37.98■■■■□ 3.67
NOMO3-217ENST00000576589 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP37.98■■■■□ 3.67
NOMO3-217ENST00000576589 PHKG2P15735 406 aa37.97■■■■□ 3.67
NOMO3-217ENST00000576589 CFAP53Q96M91 514 aa37.96■■■■□ 3.67
NOMO3-217ENST00000576589 HMOX1P09601 288 aa37.95■■■■□ 3.67
NOMO3-217ENST00000576589 AMOTQ4VCS5 1084 aa37.95■■■■□ 3.67
NOMO3-217ENST00000576589 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP37.95■■■■□ 3.67
NOMO3-217ENST00000576589 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP37.95■■■■□ 3.67
NOMO3-217ENST00000576589 DOT1LQ8TEK3 1739 aa37.94■■■■□ 3.66
NOMO3-217ENST00000576589 STK32BQ9NY57 414 aa37.93■■■■□ 3.66
NOMO3-217ENST00000576589 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP37.91■■■■□ 3.66
NOMO3-217ENST00000576589 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP37.91■■■■□ 3.66
NOMO3-217ENST00000576589 BTAF1O14981 1849 aa37.91■■■■□ 3.66
NOMO3-217ENST00000576589 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa37.9■■■■□ 3.66
NOMO3-217ENST00000576589 CASZ1Q86V15 1759 aa37.9■■■■□ 3.66
NOMO3-217ENST00000576589 SLC15A2Q16348 729 aa37.89■■■■□ 3.66
NOMO3-217ENST00000576589 KAT6BQ8WYB5 2073 aa37.88■■■■□ 3.65
NOMO3-217ENST00000576589 ZBTB7AO95365 584 aa37.88■■■■□ 3.65
NOMO3-217ENST00000576589 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP37.86■■■■□ 3.65
NOMO3-217ENST00000576589 DCAF8L1A6NGE4 600 aa37.84■■■■□ 3.65
NOMO3-217ENST00000576589 C1orf141Q5JVX7 400 aa37.84■■■■□ 3.65
NOMO3-217ENST00000576589 NUDCQ9Y266 331 aa37.83■■■■□ 3.65
NOMO3-217ENST00000576589 SLC27A3Q5K4L6 730 aa37.82■■■■□ 3.64
NOMO3-217ENST00000576589 PIGBQ92521 554 aa37.82■■■■□ 3.64
NOMO3-217ENST00000576589 LRRC4BQ9NT99 713 aa37.82■■■■□ 3.64
NOMO3-217ENST00000576589 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP37.82■■■■□ 3.64
NOMO3-217ENST00000576589 YY1P25490 414 aa37.81■■■■□ 3.64
NOMO3-217ENST00000576589 DCAF5Q96JK2 942 aa37.81■■■■□ 3.64
NOMO3-217ENST00000576589 TMOD3Q9NYL9 352 aa37.81■■■■□ 3.64
NOMO3-217ENST00000576589 PTGER2P43116 358 aa37.8■■■■□ 3.64
NOMO3-217ENST00000576589 RALBP1Q15311 655 aa37.8■■■■□ 3.64
NOMO3-217ENST00000576589 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa37.79■■■■□ 3.64
NOMO3-217ENST00000576589 ERVV-2B6SEH9 535 aa37.76■■■■□ 3.64
NOMO3-217ENST00000576589 KCNQ4P56696 695 aa37.76■■■■□ 3.64
NOMO3-217ENST00000576589 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP37.75■■■■□ 3.63
NOMO3-217ENST00000576589 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP37.75■■■■□ 3.63
NOMO3-217ENST00000576589 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP37.74■■■■□ 3.63
NOMO3-217ENST00000576589 AKAP4Q5JQC9 854 aa37.74■■■■□ 3.63
NOMO3-217ENST00000576589 PALLDQ8WX93 1383 aa37.74■■■■□ 3.63
NOMO3-217ENST00000576589 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP37.73■■■■□ 3.63
NOMO3-217ENST00000576589 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP37.73■■■■□ 3.63
NOMO3-217ENST00000576589 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP37.73■■■■□ 3.63
NOMO3-217ENST00000576589 MTFR1LQ9H019 292 aa37.73■■■■□ 3.63
NOMO3-217ENST00000576589 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP37.71■■■■□ 3.63
NOMO3-217ENST00000576589 CABP4P57796 275 aa37.7■■■■□ 3.63
NOMO3-217ENST00000576589 RSPH6AQ9H0K4 717 aa37.7■■■■□ 3.63
NOMO3-217ENST00000576589 PRKAR2BP31323 418 aa37.68■■■■□ 3.62
NOMO3-217ENST00000576589 ASAP1Q9ULH1 1129 aa37.68■■■■□ 3.62
NOMO3-217ENST00000576589 ZNF827Q17R98 1081 aa37.67■■■■□ 3.62
NOMO3-217ENST00000576589 ITGB4P16144 1822 aa37.66■■■■□ 3.62
NOMO3-217ENST00000576589 SGIP1Q9BQI5 828 aa37.66■■■■□ 3.62
NOMO3-217ENST00000576589 PAPPAQ13219 1627 aa37.65■■■■□ 3.62
NOMO3-217ENST00000576589 LY75O60449 1722 aa37.65■■■■□ 3.62
NOMO3-217ENST00000576589 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP37.65■■■■□ 3.62
NOMO3-217ENST00000576589 ATG3Q9NT62 314 aa37.65■■■■□ 3.62
NOMO3-217ENST00000576589 GAS2L2Q8NHY3 880 aa37.64■■■■□ 3.62
NOMO3-217ENST00000576589 AKT1S1Q96B36 256 aa37.64■■■■□ 3.62
NOMO3-217ENST00000576589 FCHSD2O94868 740 aa37.63■■■■□ 3.61
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