RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575783.5

CTDNEP1-211, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
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CTDNEP1-211ENST00000575783 COL24A1Q17RW2 1714 aa23.22■■□□□ 1.31
CTDNEP1-211ENST00000575783 QSER1Q2KHR3 1735 aa23.22■■□□□ 1.31
CTDNEP1-211ENST00000575783 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa23.22■■□□□ 1.31
CTDNEP1-211ENST00000575783 NSD2O96028 1365 aa23.22■■□□□ 1.31
CTDNEP1-211ENST00000575783 WWC3Q9ULE0 1092 aa23.21■■□□□ 1.31
CTDNEP1-211ENST00000575783 USP47Q96K76 1375 aa23.2■■□□□ 1.3
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CTDNEP1-211ENST00000575783 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa23.17■■□□□ 1.3
CTDNEP1-211ENST00000575783 LTN1O94822 1766 aa23.17■■□□□ 1.3
CTDNEP1-211ENST00000575783 TERF2IPQ9NYB0 399 aa23.16■■□□□ 1.3
CTDNEP1-211ENST00000575783 ADCY9O60503 1353 aa23.15■■□□□ 1.3
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CTDNEP1-211ENST00000575783 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.15■■□□□ 1.3
CTDNEP1-211ENST00000575783 MON2Q7Z3U7 1717 aa23.15■■□□□ 1.3
CTDNEP1-211ENST00000575783 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
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CTDNEP1-211ENST00000575783 LY75O60449 1722 aa23.11■■□□□ 1.29
CTDNEP1-211ENST00000575783 DOT1LQ8TEK3 1739 aa23.11■■□□□ 1.29
CTDNEP1-211ENST00000575783 USP54Q70EL1 1684 aa23.1■■□□□ 1.29
CTDNEP1-211ENST00000575783 KIF3CO14782 793 aa23.1■■□□□ 1.29
CTDNEP1-211ENST00000575783 USHBP1Q8N6Y0 703 aa23.1■■□□□ 1.29
CTDNEP1-211ENST00000575783 COG3Q96JB2 828 aa23.1■■□□□ 1.29
CTDNEP1-211ENST00000575783 A0A1W2PP64 1363 aa23.1■■□□□ 1.29
CTDNEP1-211ENST00000575783 MEGF6O75095 1541 aa23.09■■□□□ 1.29
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CTDNEP1-211ENST00000575783 SMIM5Q71RC9 77 aa23.08■■□□□ 1.29
CTDNEP1-211ENST00000575783 AK7Q96M32 723 aa23.08■■□□□ 1.29
CTDNEP1-211ENST00000575783 NBPF4Q96M43 638 aa23.08■■□□□ 1.29
CTDNEP1-211ENST00000575783 APLP1P51693 650 aa23.07■■□□□ 1.28
CTDNEP1-211ENST00000575783 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa23.07■■□□□ 1.28
CTDNEP1-211ENST00000575783 CARD11Q9BXL7 1154 aa23.07■■□□□ 1.28
CTDNEP1-211ENST00000575783 PALLDQ8WX93 1383 aa23.06■■□□□ 1.28
CTDNEP1-211ENST00000575783 AMIGO3Q86WK7 504 aa23.06■■□□□ 1.28
CTDNEP1-211ENST00000575783 CGNL1Q0VF96 1302 aa23.04■■□□□ 1.28
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CTDNEP1-211ENST00000575783 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.99■■□□□ 1.27
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CTDNEP1-211ENST00000575783 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.93■■□□□ 1.26
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CTDNEP1-211ENST00000575783 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.91■■□□□ 1.26
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CTDNEP1-211ENST00000575783 CAPN15O75808 1086 aa22.91■■□□□ 1.26
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CTDNEP1-211ENST00000575783 ATP6V1AP38606 617 aa22.87■■□□□ 1.25
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CTDNEP1-211ENST00000575783 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1-211ENST00000575783 PCNTO95613 3336 aa22.85■■□□□ 1.25
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CTDNEP1-211ENST00000575783 FCHSD2O94868 740 aa22.85■■□□□ 1.25
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CTDNEP1-211ENST00000575783 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1-211ENST00000575783 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1-211ENST00000575783 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
CTDNEP1-211ENST00000575783 DPEP1P16444 411 aa22.83■■□□□ 1.25
CTDNEP1-211ENST00000575783 TMF1P82094 1093 aa22.83■■□□□ 1.25
CTDNEP1-211ENST00000575783 C9orf131Q5VYM1 1079 aa22.83■■□□□ 1.25
CTDNEP1-211ENST00000575783 SPG7Q9UQ90 795 aa22.83■■□□□ 1.25
CTDNEP1-211ENST00000575783 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.82■■□□□ 1.24
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