RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574099.1

CCDC40-211, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC40, Length 537 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-211ENST00000574099 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
CCDC40-211ENST00000574099 CARD11Q9BXL7 1154 aa24.92■■□□□ 1.58
CCDC40-211ENST00000574099 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
CCDC40-211ENST00000574099 IP6K1Q92551 441 aa24.91■■□□□ 1.58
CCDC40-211ENST00000574099 NSD2O96028 1365 aa24.9■■□□□ 1.58
CCDC40-211ENST00000574099 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa24.9■■□□□ 1.58
CCDC40-211ENST00000574099 TERF2IPQ9NYB0 399 aa24.89■■□□□ 1.58
CCDC40-211ENST00000574099 MSH5O43196 834 aa24.87■■□□□ 1.57
CCDC40-211ENST00000574099 MEGF6O75095 1541 aa24.86■■□□□ 1.57
CCDC40-211ENST00000574099 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
CCDC40-211ENST00000574099 MAP3K19Q56UN5 1328 aa24.85■■□□□ 1.57
CCDC40-211ENST00000574099 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP24.84■■□□□ 1.57
CCDC40-211ENST00000574099 FBLN1P23142 703 aa24.84■■□□□ 1.57
CCDC40-211ENST00000574099 HOXC9P31274 260 aa24.84■■□□□ 1.57
CCDC40-211ENST00000574099 MSL1Q68DK7 614 aa24.83■■□□□ 1.57
CCDC40-211ENST00000574099 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
CCDC40-211ENST00000574099 AMPHP49418 695 aa24.82■■□□□ 1.56
CCDC40-211ENST00000574099 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
CCDC40-211ENST00000574099 COG3Q96JB2 828 aa24.81■■□□□ 1.56
CCDC40-211ENST00000574099 C5P01031 1676 aa24.81■■□□□ 1.56
CCDC40-211ENST00000574099 USP47Q96K76 1375 aa24.8■■□□□ 1.56
CCDC40-211ENST00000574099 USHBP1Q8N6Y0 703 aa24.78■■□□□ 1.56
CCDC40-211ENST00000574099 GRIN3BO60391 1043 aa24.77■■□□□ 1.56
CCDC40-211ENST00000574099 ATP10DQ9P241 1426 aa24.75■■□□□ 1.55
CCDC40-211ENST00000574099 CEP350Q5VT06 3117 aa24.74■■□□□ 1.55
CCDC40-211ENST00000574099 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
CCDC40-211ENST00000574099 NBPF6Q5VWK0 638 aa24.74■■□□□ 1.55
CCDC40-211ENST00000574099 NBPF4Q96M43 638 aa24.74■■□□□ 1.55
CCDC40-211ENST00000574099 TAF1LQ8IZX4 1826 aa24.74■■□□□ 1.55
CCDC40-211ENST00000574099 RTL1A6NKG5 1358 aa24.73■■□□□ 1.55
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CCDC40-211ENST00000574099 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa24.71■■□□□ 1.55
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CCDC40-211ENST00000574099 TONSLQ96HA7 1378 aa24.7■■□□□ 1.55
CCDC40-211ENST00000574099 IFFO2Q5TF58 517 aa24.7■■□□□ 1.54
CCDC40-211ENST00000574099 TESK2Q96S53 571 aa24.69■■□□□ 1.54
CCDC40-211ENST00000574099 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa24.69■■□□□ 1.54
CCDC40-211ENST00000574099 PALLDQ8WX93 1383 aa24.68■■□□□ 1.54
CCDC40-211ENST00000574099 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa24.68■■□□□ 1.54
CCDC40-211ENST00000574099 GGNBP2Q9H3C7 697 aa24.68■■□□□ 1.54
CCDC40-211ENST00000574099 C4BP0C0L5 1744 aa24.68■■□□□ 1.54
CCDC40-211ENST00000574099 CGNL1Q0VF96 1302 aa24.67■■□□□ 1.54
CCDC40-211ENST00000574099 TATP17735 454 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
CCDC40-211ENST00000574099 WWC3Q9ULE0 1092 aa24.67■■□□□ 1.54
CCDC40-211ENST00000574099 ITGB4P16144 1822 aa24.66■■□□□ 1.54
CCDC40-211ENST00000574099 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa24.66■■□□□ 1.54
CCDC40-211ENST00000574099 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
CCDC40-211ENST00000574099 CD2APQ9Y5K6 639 aa24.66■■□□□ 1.54
CCDC40-211ENST00000574099 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa24.65■■□□□ 1.54
CCDC40-211ENST00000574099 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa24.65■■□□□ 1.54
CCDC40-211ENST00000574099 KIF20BQ96Q89 1820 aa24.65■■□□□ 1.54
CCDC40-211ENST00000574099 PHF14O94880 888 aa24.63■■□□□ 1.53
CCDC40-211ENST00000574099 SMIM5Q71RC9 77 aa24.63■■□□□ 1.53
CCDC40-211ENST00000574099 AMIGO3Q86WK7 504 aa24.63■■□□□ 1.53
CCDC40-211ENST00000574099 FLAD1Q8NFF5 587 aa24.63■■□□□ 1.53
CCDC40-211ENST00000574099 UBR3Q6ZT12 1888 aa24.63■■□□□ 1.53
CCDC40-211ENST00000574099 FYB1O15117 783 aa24.62■■□□□ 1.53
CCDC40-211ENST00000574099 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa24.62■■□□□ 1.53
CCDC40-211ENST00000574099 AK7Q96M32 723 aa24.62■■□□□ 1.53
CCDC40-211ENST00000574099 ADCY9O60503 1353 aa24.62■■□□□ 1.53
CCDC40-211ENST00000574099 INSRP06213 1382 aa24.6■■□□□ 1.53
CCDC40-211ENST00000574099 PKD1L3Q7Z443 1732 aa24.6■■□□□ 1.53
CCDC40-211ENST00000574099 IGSF1Q8N6C5 1336 aa24.6■■□□□ 1.53
CCDC40-211ENST00000574099 CYP27B1O15528 508 aa24.59■■□□□ 1.53
CCDC40-211ENST00000574099 FLT4P35916 1363 aa24.58■■□□□ 1.53
CCDC40-211ENST00000574099 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
CCDC40-211ENST00000574099 HSPA6P17066 643 aa24.55■■□□□ 1.52
CCDC40-211ENST00000574099 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
CCDC40-211ENST00000574099 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
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CCDC40-211ENST00000574099 NSD3Q9BZ95 1437 aa24.53■■□□□ 1.52
CCDC40-211ENST00000574099 PIGBQ92521 554 aa24.53■■□□□ 1.52
CCDC40-211ENST00000574099 SLC24A1O60721 1099 aa24.52■■□□□ 1.52
CCDC40-211ENST00000574099 LINC00116Q8NCU8 138 aa24.52■■□□□ 1.52
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CCDC40-211ENST00000574099 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa24.51■■□□□ 1.51
CCDC40-211ENST00000574099 KIF24Q5T7B8 1368 aa24.5■■□□□ 1.51
CCDC40-211ENST00000574099 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa24.49■■□□□ 1.51
CCDC40-211ENST00000574099 SSFA2P28290 1259 aa24.49■■□□□ 1.51
CCDC40-211ENST00000574099 SIK1P57059 783 aa24.49■■□□□ 1.51
CCDC40-211ENST00000574099 GNPATO15228 680 aa24.48■■□□□ 1.51
CCDC40-211ENST00000574099 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
CCDC40-211ENST00000574099 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa24.47■■□□□ 1.51
CCDC40-211ENST00000574099 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
CCDC40-211ENST00000574099 NCAPD2Q15021 1401 aa24.46■■□□□ 1.51
CCDC40-211ENST00000574099 TMOD3Q9NYL9 352 aa24.46■■□□□ 1.51
CCDC40-211ENST00000574099 SPG7Q9UQ90 795 aa24.46■■□□□ 1.51
CCDC40-211ENST00000574099 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
CCDC40-211ENST00000574099 KIF3CO14782 793 aa24.45■■□□□ 1.5
CCDC40-211ENST00000574099 ITPK1Q13572 414 aa24.45■■□□□ 1.5
CCDC40-211ENST00000574099 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
CCDC40-211ENST00000574099 ASAP1Q9ULH1 1129 aa24.45■■□□□ 1.5
CCDC40-211ENST00000574099 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa24.44■■□□□ 1.5
CCDC40-211ENST00000574099 ATP6V1AP38606 617 aa24.43■■□□□ 1.5
CCDC40-211ENST00000574099 PXDNLA1KZ92 1463 aa24.43■■□□□ 1.5
CCDC40-211ENST00000574099 KIF13BQ9NQT8 1826 aa24.42■■□□□ 1.5
CCDC40-211ENST00000574099 MMP10P09238 476 aa24.42■■□□□ 1.5
CCDC40-211ENST00000574099 CARD14Q9BXL6 1004 aa24.42■■□□□ 1.5
CCDC40-211ENST00000574099 EYA1Q99502 592 aa24.4■■□□□ 1.5
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