RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568586.5

RAB40C-211, Transcript of RAB40C, member RAS oncogene family, humanhuman

TSL 2

Gene RAB40C, Length 648 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40C-211ENST00000568586 USHBP1Q8N6Y0 703 aa40.37■■■■■ 4.05
RAB40C-211ENST00000568586 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP40.36■■■■■ 4.05
RAB40C-211ENST00000568586 ACSBG1Q96GR2 724 aa40.35■■■■■ 4.05
RAB40C-211ENST00000568586 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP40.34■■■■■ 4.05
RAB40C-211ENST00000568586 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa40.34■■■■■ 4.05
RAB40C-211ENST00000568586 KNSTRNQ9Y448 316 aa40.33■■■■■ 4.05
RAB40C-211ENST00000568586 SHANK3Q9BYB0 1731 aa40.33■■■■■ 4.05
RAB40C-211ENST00000568586 LRP5O75197 1615 aa40.32■■■■■ 4.05
RAB40C-211ENST00000568586 TATP17735 454 aaPredicted RBP40.3■■■■■ 4.04
RAB40C-211ENST00000568586 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP40.29■■■■■ 4.04
RAB40C-211ENST00000568586 TXNRD1Q16881 649 aa40.29■■■■■ 4.04
RAB40C-211ENST00000568586 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP40.28■■■■■ 4.04
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RAB40C-211ENST00000568586 EYA1Q99502 592 aa40.25■■■■■ 4.03
RAB40C-211ENST00000568586 MORC1Q86VD1 984 aa40.24■■■■■ 4.03
RAB40C-211ENST00000568586 BTAF1O14981 1849 aa40.23■■■■■ 4.03
RAB40C-211ENST00000568586 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP40.22■■■■■ 4.03
RAB40C-211ENST00000568586 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP40.21■■■■■ 4.03
RAB40C-211ENST00000568586 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa40.19■■■■■ 4.02
RAB40C-211ENST00000568586 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa40.19■■■■■ 4.02
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RAB40C-211ENST00000568586 KAT6BQ8WYB5 2073 aa40.19■■■■■ 4.02
RAB40C-211ENST00000568586 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP40.16■■■■■ 4.02
RAB40C-211ENST00000568586 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa40.15■■■■■ 4.02
RAB40C-211ENST00000568586 CYP27B1O15528 508 aa40.15■■■■■ 4.02
RAB40C-211ENST00000568586 PKD1L3Q7Z443 1732 aa40.15■■■■■ 4.02
RAB40C-211ENST00000568586 DOT1LQ8TEK3 1739 aa40.13■■■■■ 4.02
RAB40C-211ENST00000568586 IGSF1Q8N6C5 1336 aa40.13■■■■■ 4.01
RAB40C-211ENST00000568586 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa40.1■■■■■ 4.01
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RAB40C-211ENST00000568586 SLC27A3Q5K4L6 730 aa40.08■■■■■ 4.01
RAB40C-211ENST00000568586 LRRC4BQ9NT99 713 aa40.08■■■■■ 4.01
RAB40C-211ENST00000568586 STK32BQ9NY57 414 aa40.08■■■■■ 4.01
RAB40C-211ENST00000568586 PAPPAQ13219 1627 aa40.08■■■■■ 4.01
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RAB40C-211ENST00000568586 IL13P35225 146 aa39.98■■■■□ 3.99
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RAB40C-211ENST00000568586 ZNF827Q17R98 1081 aa39.93■■■■□ 3.98
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RAB40C-211ENST00000568586 AEBP1Q8IUX7 1158 aa39.89■■■■□ 3.98
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RAB40C-211ENST00000568586 AMOTQ4VCS5 1084 aa39.88■■■■□ 3.97
RAB40C-211ENST00000568586 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP39.88■■■■□ 3.97
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RAB40C-211ENST00000568586 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP39.88■■■■□ 3.97
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RAB40C-211ENST00000568586 SULT6B1Q6IMI4 303 aa39.86■■■■□ 3.97
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RAB40C-211ENST00000568586 MTFR1LQ9H019 292 aa39.82■■■■□ 3.97
RAB40C-211ENST00000568586 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP39.81■■■■□ 3.96
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RAB40C-211ENST00000568586 ERVV-2B6SEH9 535 aa39.78■■■■□ 3.96
RAB40C-211ENST00000568586 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP39.77■■■■□ 3.96
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RAB40C-211ENST00000568586 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP39.6■■■■□ 3.93
RAB40C-211ENST00000568586 C4BP0C0L5 1744 aa39.6■■■■□ 3.93
RAB40C-211ENST00000568586 PPP2R1AP30153 589 aa39.59■■■■□ 3.93
RAB40C-211ENST00000568586 FLAD1Q8NFF5 587 aa39.59■■■■□ 3.93
RAB40C-211ENST00000568586 ITPK1Q13572 414 aa39.56■■■■□ 3.92
RAB40C-211ENST00000568586 LINC00116Q8NCU8 138 aa39.56■■■■□ 3.92
RAB40C-211ENST00000568586 CFAP53Q96M91 514 aa39.56■■■■□ 3.92
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