RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564172.1

GDE1-203, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GDE1, Length 2,238 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-203ENST00000564172 NBR1Q14596 966 aa22.8■■□□□ 1.24
GDE1-203ENST00000564172 ABCC6O95255 1503 aa22.8■■□□□ 1.24
GDE1-203ENST00000564172 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
GDE1-203ENST00000564172 RGPD5Q99666 1765 aa22.8■■□□□ 1.24
GDE1-203ENST00000564172 IFT57Q9NWB7 429 aa22.8■■□□□ 1.24
GDE1-203ENST00000564172 RGPD2P0DJD1 1756 aa22.79■■□□□ 1.24
GDE1-203ENST00000564172 ZNF853P0CG23 659 aa22.79■■□□□ 1.24
GDE1-203ENST00000564172 GNAI1P63096 354 aa22.79■■□□□ 1.24
GDE1-203ENST00000564172 PRDM11Q9NQV5 511 aa22.79■■□□□ 1.24
GDE1-203ENST00000564172 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
GDE1-203ENST00000564172 MCM10Q7L590 875 aa22.78■■□□□ 1.24
GDE1-203ENST00000564172 PLIN1O60240 522 aa22.78■■□□□ 1.24
GDE1-203ENST00000564172 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
GDE1-203ENST00000564172 CFAP44Q96MT7 982 aa22.78■■□□□ 1.24
GDE1-203ENST00000564172 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
GDE1-203ENST00000564172 BCAR3O75815 825 aa22.76■■□□□ 1.23
GDE1-203ENST00000564172 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
GDE1-203ENST00000564172 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
GDE1-203ENST00000564172 NLRP2Q9NX02 1062 aa22.76■■□□□ 1.23
GDE1-203ENST00000564172 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa22.75■■□□□ 1.23
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GDE1-203ENST00000564172 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.74■■□□□ 1.23
GDE1-203ENST00000564172 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa22.74■■□□□ 1.23
GDE1-203ENST00000564172 PIP4K2BP78356 416 aa22.74■■□□□ 1.23
GDE1-203ENST00000564172 MBIPQ9NS73 344 aa22.74■■□□□ 1.23
GDE1-203ENST00000564172 ABCA3Q99758 1704 aa22.74■■□□□ 1.23
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GDE1-203ENST00000564172 LMO7Q8WWI1 1683 aa22.72■■□□□ 1.23
GDE1-203ENST00000564172 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.72■■□□□ 1.23
GDE1-203ENST00000564172 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
GDE1-203ENST00000564172 MAP3K5Q99683 1374 aa22.72■■□□□ 1.23
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GDE1-203ENST00000564172 CRB1P82279 1406 aa22.71■■□□□ 1.23
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GDE1-203ENST00000564172 IL17REQ8NFR9 667 aa22.69■■□□□ 1.22
GDE1-203ENST00000564172 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.69■■□□□ 1.22
GDE1-203ENST00000564172 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.68■■□□□ 1.22
GDE1-203ENST00000564172 WDR17Q8IZU2 1322 aa22.68■■□□□ 1.22
GDE1-203ENST00000564172 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.67■■□□□ 1.22
GDE1-203ENST00000564172 ZMYND15Q9H091 742 aa22.67■■□□□ 1.22
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GDE1-203ENST00000564172 USP35Q9P2H5 1018 aa22.67■■□□□ 1.22
GDE1-203ENST00000564172 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
GDE1-203ENST00000564172 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.66■■□□□ 1.22
GDE1-203ENST00000564172 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.66■■□□□ 1.22
GDE1-203ENST00000564172 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
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GDE1-203ENST00000564172 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.66■■□□□ 1.22
GDE1-203ENST00000564172 PHLPP1O60346 1717 aa22.66■■□□□ 1.22
GDE1-203ENST00000564172 TSPYL6Q8N831 410 aa22.65■■□□□ 1.22
GDE1-203ENST00000564172 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
GDE1-203ENST00000564172 VAMP4O75379 141 aa22.65■■□□□ 1.22
GDE1-203ENST00000564172 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
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GDE1-203ENST00000564172 SSH1Q8WYL5 1049 aa22.64■■□□□ 1.21
GDE1-203ENST00000564172 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.63■■□□□ 1.21
GDE1-203ENST00000564172 ZNF428Q96B54 188 aa22.63■■□□□ 1.21
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GDE1-203ENST00000564172 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.63■■□□□ 1.21
GDE1-203ENST00000564172 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.63■■□□□ 1.21
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GDE1-203ENST00000564172 CERKQ8TCT0 537 aa22.62■■□□□ 1.21
GDE1-203ENST00000564172 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
GDE1-203ENST00000564172 LGR6Q9HBX8 967 aa22.62■■□□□ 1.21
GDE1-203ENST00000564172 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.62■■□□□ 1.21
GDE1-203ENST00000564172 MEGF6O75095 1541 aa22.62■■□□□ 1.21
GDE1-203ENST00000564172 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
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GDE1-203ENST00000564172 STRN4Q9NRL3 753 aa22.62■■□□□ 1.21
GDE1-203ENST00000564172 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.62■■□□□ 1.21
GDE1-203ENST00000564172 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.62■■□□□ 1.21
GDE1-203ENST00000564172 ALDH1L2Q3SY69 923 aa22.61■■□□□ 1.21
GDE1-203ENST00000564172 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.61■■□□□ 1.21
GDE1-203ENST00000564172 LRRC37A3O60309 1634 aa22.61■■□□□ 1.21
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GDE1-203ENST00000564172 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.55■■□□□ 1.2
GDE1-203ENST00000564172 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
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GDE1-203ENST00000564172 TEFQ10587 303 aa22.54■■□□□ 1.2
GDE1-203ENST00000564172 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
GDE1-203ENST00000564172 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa22.54■■□□□ 1.2
GDE1-203ENST00000564172 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.54■■□□□ 1.2
GDE1-203ENST00000564172 PANK1Q8TE04 598 aa22.54■■□□□ 1.2
GDE1-203ENST00000564172 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
GDE1-203ENST00000564172 TNNQ9UQP3 1299 aa22.53■■□□□ 1.2
GDE1-203ENST00000564172 KIF16BQ96L93 1317 aa22.53■■□□□ 1.2
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