RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563952.1

CMTM4-204, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM4, Length 1,023 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4-204ENST00000563952 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP42.02■■■■■ 4.32
CMTM4-204ENST00000563952 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa42.02■■■■■ 4.32
CMTM4-204ENST00000563952 TATP17735 454 aaPredicted RBP42.02■■■■■ 4.32
CMTM4-204ENST00000563952 SHANK3Q9BYB0 1731 aa42.02■■■■■ 4.32
CMTM4-204ENST00000563952 PLSCR1O15162 318 aa42.01■■■■■ 4.32
CMTM4-204ENST00000563952 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP42.01■■■■■ 4.32
CMTM4-204ENST00000563952 KAT6BQ8WYB5 2073 aa41.99■■■■■ 4.31
CMTM4-204ENST00000563952 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP41.99■■■■■ 4.31
CMTM4-204ENST00000563952 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa41.95■■■■■ 4.31
CMTM4-204ENST00000563952 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP41.95■■■■■ 4.31
CMTM4-204ENST00000563952 EYA1Q99502 592 aa41.95■■■■■ 4.31
CMTM4-204ENST00000563952 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP41.94■■■■■ 4.3
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CMTM4-204ENST00000563952 NCAPD2Q15021 1401 aa41.92■■■■■ 4.3
CMTM4-204ENST00000563952 BTAF1O14981 1849 aa41.91■■■■■ 4.3
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CMTM4-204ENST00000563952 DOT1LQ8TEK3 1739 aa41.89■■■■■ 4.3
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CMTM4-204ENST00000563952 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa41.87■■■■■ 4.29
CMTM4-204ENST00000563952 PROM2Q8N271 834 aa41.86■■■■■ 4.29
CMTM4-204ENST00000563952 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP41.85■■■■■ 4.29
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CMTM4-204ENST00000563952 PKD1L3Q7Z443 1732 aa41.83■■■■■ 4.29
CMTM4-204ENST00000563952 IGSF1Q8N6C5 1336 aa41.78■■■■■ 4.28
CMTM4-204ENST00000563952 SPG7Q9UQ90 795 aa41.78■■■■■ 4.28
CMTM4-204ENST00000563952 CYP27B1O15528 508 aa41.77■■■■■ 4.28
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CMTM4-204ENST00000563952 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa41.75■■■■■ 4.27
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CMTM4-204ENST00000563952 LRP5O75197 1615 aa41.72■■■■■ 4.27
CMTM4-204ENST00000563952 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP41.7■■■■■ 4.27
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CMTM4-204ENST00000563952 STK32BQ9NY57 414 aa41.67■■■■■ 4.26
CMTM4-204ENST00000563952 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa41.66■■■■■ 4.26
CMTM4-204ENST00000563952 AEBP1Q8IUX7 1158 aa41.65■■■■■ 4.26
CMTM4-204ENST00000563952 SULT6B1Q6IMI4 303 aa41.62■■■■■ 4.25
CMTM4-204ENST00000563952 LRRC4BQ9NT99 713 aa41.62■■■■■ 4.25
CMTM4-204ENST00000563952 PHKG2P15735 406 aa41.61■■■■■ 4.25
CMTM4-204ENST00000563952 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP41.61■■■■■ 4.25
CMTM4-204ENST00000563952 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa41.61■■■■■ 4.25
CMTM4-204ENST00000563952 IFNL2Q8IZJ0 200 aa41.61■■■■■ 4.25
CMTM4-204ENST00000563952 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa41.61■■■■■ 4.25
CMTM4-204ENST00000563952 ITGB4P16144 1822 aa41.6■■■■■ 4.25
CMTM4-204ENST00000563952 SLC15A2Q16348 729 aa41.6■■■■■ 4.25
CMTM4-204ENST00000563952 PAPPAQ13219 1627 aa41.59■■■■■ 4.25
CMTM4-204ENST00000563952 LY75O60449 1722 aa41.59■■■■■ 4.25
CMTM4-204ENST00000563952 SLC27A3Q5K4L6 730 aa41.59■■■■■ 4.25
CMTM4-204ENST00000563952 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP41.58■■■■■ 4.25
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CMTM4-204ENST00000563952 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP41.54■■■■■ 4.24
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CMTM4-204ENST00000563952 KDRP35968 1356 aa41.53■■■■■ 4.24
CMTM4-204ENST00000563952 AMOTQ4VCS5 1084 aa41.53■■■■■ 4.24
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CMTM4-204ENST00000563952 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP41.52■■■■■ 4.24
CMTM4-204ENST00000563952 ZNF827Q17R98 1081 aa41.51■■■■■ 4.24
CMTM4-204ENST00000563952 PIGBQ92521 554 aa41.5■■■■■ 4.23
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CMTM4-204ENST00000563952 PALLDQ8WX93 1383 aa41.49■■■■■ 4.23
CMTM4-204ENST00000563952 TMOD3Q9NYL9 352 aa41.48■■■■■ 4.23
CMTM4-204ENST00000563952 SPON1Q9HCB6 807 aa41.47■■■■■ 4.23
CMTM4-204ENST00000563952 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP41.47■■■■■ 4.23
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CMTM4-204ENST00000563952 ZBTB7AO95365 584 aa41.43■■■■■ 4.22
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CMTM4-204ENST00000563952 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP41.43■■■■■ 4.22
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CMTM4-204ENST00000563952 ERVV-2B6SEH9 535 aa41.36■■■■■ 4.21
CMTM4-204ENST00000563952 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP41.35■■■■■ 4.21
CMTM4-204ENST00000563952 ASAP1Q9ULH1 1129 aa41.35■■■■■ 4.21
CMTM4-204ENST00000563952 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP41.35■■■■■ 4.21
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CMTM4-204ENST00000563952 QSER1Q2KHR3 1735 aa41.33■■■■■ 4.21
CMTM4-204ENST00000563952 TAF1LQ8IZX4 1826 aa41.32■■■■■ 4.2
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CMTM4-204ENST00000563952 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa41.3■■■■■ 4.2
CMTM4-204ENST00000563952 MTFR1LQ9H019 292 aa41.3■■■■■ 4.2
CMTM4-204ENST00000563952 ATG3Q9NT62 314 aa41.3■■■■■ 4.2
CMTM4-204ENST00000563952 AKAP4Q5JQC9 854 aa41.29■■■■■ 4.2
CMTM4-204ENST00000563952 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa41.27■■■■■ 4.2
CMTM4-204ENST00000563952 SIK1P57059 783 aa41.27■■■■■ 4.2
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CMTM4-204ENST00000563952 SCN11AQ9UI33 1791 aa41.26■■■■■ 4.2
CMTM4-204ENST00000563952 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP41.25■■■■■ 4.19
CMTM4-204ENST00000563952 NUDCQ9Y266 331 aa41.24■■■■■ 4.19
CMTM4-204ENST00000563952 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP41.23■■■■■ 4.19
CMTM4-204ENST00000563952 PTGER2P43116 358 aa41.23■■■■■ 4.19
CMTM4-204ENST00000563952 C4BP0C0L5 1744 aa41.23■■■■■ 4.19
CMTM4-204ENST00000563952 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa41.21■■■■■ 4.19
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