RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563545.1

CHTF18-214, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 5

Gene CHTF18, Length 569 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-214ENST00000563545 USHBP1Q8N6Y0 703 aa30.95■■■□□ 2.55
CHTF18-214ENST00000563545 LRRC4BQ9NT99 713 aa30.95■■■□□ 2.55
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CHTF18-214ENST00000563545 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa30.93■■■□□ 2.54
CHTF18-214ENST00000563545 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP30.93■■■□□ 2.54
CHTF18-214ENST00000563545 INSRP06213 1382 aa30.92■■■□□ 2.54
CHTF18-214ENST00000563545 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
CHTF18-214ENST00000563545 MTFR1LQ9H019 292 aa30.92■■■□□ 2.54
CHTF18-214ENST00000563545 FLT4P35916 1363 aa30.92■■■□□ 2.54
CHTF18-214ENST00000563545 ZNF827Q17R98 1081 aa30.91■■■□□ 2.54
CHTF18-214ENST00000563545 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa30.9■■■□□ 2.54
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CHTF18-214ENST00000563545 KIF24Q5T7B8 1368 aa30.9■■■□□ 2.54
CHTF18-214ENST00000563545 DCAF8L1A6NGE4 600 aa30.89■■■□□ 2.54
CHTF18-214ENST00000563545 SLC27A3Q5K4L6 730 aa30.89■■■□□ 2.54
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CHTF18-214ENST00000563545 LY75O60449 1722 aa30.87■■■□□ 2.53
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CHTF18-214ENST00000563545 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa30.86■■■□□ 2.53
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CHTF18-214ENST00000563545 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa30.82■■■□□ 2.52
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CHTF18-214ENST00000563545 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa30.81■■■□□ 2.52
CHTF18-214ENST00000563545 POLR3GLQ9BT43 218 aa30.81■■■□□ 2.52
CHTF18-214ENST00000563545 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP30.81■■■□□ 2.52
CHTF18-214ENST00000563545 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa30.79■■■□□ 2.52
CHTF18-214ENST00000563545 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa30.79■■■□□ 2.52
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CHTF18-214ENST00000563545 SYT17Q9BSW7 474 aa30.79■■■□□ 2.52
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CHTF18-214ENST00000563545 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa30.77■■■□□ 2.52
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CHTF18-214ENST00000563545 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP30.76■■■□□ 2.51
CHTF18-214ENST00000563545 PKD1L3Q7Z443 1732 aa30.76■■■□□ 2.51
CHTF18-214ENST00000563545 SLC16A10Q8TF71 515 aa30.75■■■□□ 2.51
CHTF18-214ENST00000563545 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP30.74■■■□□ 2.51
CHTF18-214ENST00000563545 WASHC2AQ641Q2 1341 aa30.73■■■□□ 2.51
CHTF18-214ENST00000563545 NCAPD2Q15021 1401 aa30.73■■■□□ 2.51
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CHTF18-214ENST00000563545 ITGB4P16144 1822 aa30.73■■■□□ 2.51
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CHTF18-214ENST00000563545 COL24A1Q17RW2 1714 aa30.72■■■□□ 2.51
CHTF18-214ENST00000563545 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa30.71■■■□□ 2.51
CHTF18-214ENST00000563545 POLKQ9UBT6 870 aa30.7■■■□□ 2.51
CHTF18-214ENST00000563545 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP30.69■■■□□ 2.5
CHTF18-214ENST00000563545 MAP3K5Q99683 1374 aa30.68■■■□□ 2.5
CHTF18-214ENST00000563545 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa30.68■■■□□ 2.5
CHTF18-214ENST00000563545 EYA1Q99502 592 aa30.68■■■□□ 2.5
CHTF18-214ENST00000563545 C5P01031 1676 aa30.68■■■□□ 2.5
CHTF18-214ENST00000563545 TAF1LQ8IZX4 1826 aa30.66■■■□□ 2.5
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CHTF18-214ENST00000563545 PALLDQ8WX93 1383 aa30.65■■■□□ 2.5
CHTF18-214ENST00000563545 PANK3Q9H999 370 aa30.63■■■□□ 2.49
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CHTF18-214ENST00000563545 CHD4Q14839 1912 aa30.62■■■□□ 2.49
CHTF18-214ENST00000563545 MSH5O43196 834 aa30.61■■■□□ 2.49
CHTF18-214ENST00000563545 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP30.61■■■□□ 2.49
CHTF18-214ENST00000563545 KLHL34Q8N239 644 aa30.61■■■□□ 2.49
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CHTF18-214ENST00000563545 PHKG2P15735 406 aa30.53■■■□□ 2.48
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CHTF18-214ENST00000563545 IGSF1Q8N6C5 1336 aa30.51■■■□□ 2.48
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CHTF18-214ENST00000563545 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa30.47■■■□□ 2.47
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CHTF18-214ENST00000563545 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
CHTF18-214ENST00000563545 AMIGO3Q86WK7 504 aa30.45■■■□□ 2.47
CHTF18-214ENST00000563545 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP30.45■■■□□ 2.47
CHTF18-214ENST00000563545 KNSTRNQ9Y448 316 aa30.45■■■□□ 2.47
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CHTF18-214ENST00000563545 PHF14O94880 888 aa30.42■■■□□ 2.46
CHTF18-214ENST00000563545 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP30.41■■■□□ 2.46
CHTF18-214ENST00000563545 SMIM5Q71RC9 77 aa30.41■■■□□ 2.46
CHTF18-214ENST00000563545 ATG3Q9NT62 314 aa30.41■■■□□ 2.46
CHTF18-214ENST00000563545 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
CHTF18-214ENST00000563545 ATP6V1AP38606 617 aa30.39■■■□□ 2.46
CHTF18-214ENST00000563545 ITPK1Q13572 414 aa30.39■■■□□ 2.46
CHTF18-214ENST00000563545 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
CHTF18-214ENST00000563545 ERVV-2B6SEH9 535 aa30.38■■■□□ 2.45
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