RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563032.1

TCF25-208, Transcript of transcription factor 25, human

TSL 2

Gene TCF25, Length 274 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF25-208	ENST00000563032	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	28.09	■■■□□ 2.09
TCF25-208	ENST00000563032	SLC15A2	Q16348	729 aa		28.09	■■■□□ 2.09
TCF25-208	ENST00000563032	BTAF1	O14981	1849 aa		28.08	■■■□□ 2.09
TCF25-208	ENST00000563032	MEGF6	O75095	1541 aa		28.07	■■■□□ 2.08
TCF25-208	ENST00000563032	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	28.06	■■■□□ 2.08
TCF25-208	ENST00000563032	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		28.06	■■■□□ 2.08
TCF25-208	ENST00000563032	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	28.06	■■■□□ 2.08
TCF25-208	ENST00000563032	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		28.05	■■■□□ 2.08
TCF25-208	ENST00000563032	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	28.04	■■■□□ 2.08
TCF25-208	ENST00000563032	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		28.03	■■■□□ 2.08
TCF25-208	ENST00000563032	CASZ1	Q86V15	1759 aa		28.01	■■■□□ 2.08
TCF25-208	ENST00000563032	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		28	■■■□□ 2.07
TCF25-208	ENST00000563032	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	27.99	■■■□□ 2.07
TCF25-208	ENST00000563032	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		27.99	■■■□□ 2.07
TCF25-208	ENST00000563032	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		27.99	■■■□□ 2.07
TCF25-208	ENST00000563032	ZBTB7A	O95365	584 aa		27.99	■■■□□ 2.07
TCF25-208	ENST00000563032	PANK3	Q9H999	370 aa		27.99	■■■□□ 2.07
TCF25-208	ENST00000563032	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		27.98	■■■□□ 2.07
TCF25-208	ENST00000563032	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	27.98	■■■□□ 2.07
TCF25-208	ENST00000563032	POLK	Q9UBT6	870 aa		27.97	■■■□□ 2.07
TCF25-208	ENST00000563032	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		27.97	■■■□□ 2.07
TCF25-208	ENST00000563032	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		27.96	■■■□□ 2.07
TCF25-208	ENST00000563032	MTFR1L	Q9H019	292 aa		27.96	■■■□□ 2.07
TCF25-208	ENST00000563032	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		27.96	■■■□□ 2.07
TCF25-208	ENST00000563032	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		27.95	■■■□□ 2.07
TCF25-208	ENST00000563032	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	27.95	■■■□□ 2.06
TCF25-208	ENST00000563032	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	27.94	■■■□□ 2.06
TCF25-208	ENST00000563032	PAPPA	Q13219	1627 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TCF25-208	ENST00000563032	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
TCF25-208	ENST00000563032	SPG7	Q9UQ90	795 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TCF25-208	ENST00000563032	NSD2	O96028	1365 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TCF25-208	ENST00000563032	EYA1	Q99502	592 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TCF25-208	ENST00000563032	ZNF827	Q17R98	1081 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TCF25-208	ENST00000563032	AKT1S1	Q96B36	256 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TCF25-208	ENST00000563032	NCAPD2	Q15021	1401 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TCF25-208	ENST00000563032	PTGER2	P43116	358 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TCF25-208	ENST00000563032	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	27.89	■■■□□ 2.06
TCF25-208	ENST00000563032	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.06
TCF25-208	ENST00000563032	CYP27B1	O15528	508 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TCF25-208	ENST00000563032	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TCF25-208	ENST00000563032	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TCF25-208	ENST00000563032	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TCF25-208	ENST00000563032	LY75	O60449	1722 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TCF25-208	ENST00000563032	MORC1	Q86VD1	984 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TCF25-208	ENST00000563032	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TCF25-208	ENST00000563032	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
TCF25-208	ENST00000563032	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TCF25-208	ENST00000563032	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
TCF25-208	ENST00000563032	KCNQ4	P56696	695 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TCF25-208	ENST00000563032	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
TCF25-208	ENST00000563032	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TCF25-208	ENST00000563032	ARX	Q96QS3	562 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TCF25-208	ENST00000563032	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TCF25-208	ENST00000563032	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TCF25-208	ENST00000563032	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TCF25-208	ENST00000563032	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		27.79	■■■□□ 2.04
TCF25-208	ENST00000563032	PALLD	Q8WX93	1383 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TCF25-208	ENST00000563032	POLD1	P28340	1107 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TCF25-208	ENST00000563032	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
TCF25-208	ENST00000563032	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TCF25-208	ENST00000563032	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TCF25-208	ENST00000563032	SYT17	Q9BSW7	474 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TCF25-208	ENST00000563032	ITGB4	P16144	1822 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TCF25-208	ENST00000563032	PHKG2	P15735	406 aa		27.75	■■■□□ 2.03
TCF25-208	ENST00000563032	PIGB	Q92521	554 aa		27.75	■■■□□ 2.03
TCF25-208	ENST00000563032	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		27.75	■■■□□ 2.03
TCF25-208	ENST00000563032	MSH5	O43196	834 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TCF25-208	ENST00000563032	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
TCF25-208	ENST00000563032	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TCF25-208	ENST00000563032	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		27.72	■■■□□ 2.03
TCF25-208	ENST00000563032	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
TCF25-208	ENST00000563032	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TCF25-208	ENST00000563032	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03
TCF25-208	ENST00000563032	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TCF25-208	ENST00000563032	MAP3K5	Q99683	1374 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TCF25-208	ENST00000563032	YY1	P25490	414 aa		27.7	■■■□□ 2.02
TCF25-208	ENST00000563032	C5	P01031	1676 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TCF25-208	ENST00000563032	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
TCF25-208	ENST00000563032	AK7	Q96M32	723 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TCF25-208	ENST00000563032	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		27.66	■■■□□ 2.02
TCF25-208	ENST00000563032	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		27.66	■■■□□ 2.02
TCF25-208	ENST00000563032	SIK1	P57059	783 aa		27.66	■■■□□ 2.02
TCF25-208	ENST00000563032	DCAF5	Q96JK2	942 aa		27.66	■■■□□ 2.02
TCF25-208	ENST00000563032	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		27.66	■■■□□ 2.02
TCF25-208	ENST00000563032	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	27.65	■■■□□ 2.02
TCF25-208	ENST00000563032	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		27.64	■■■□□ 2.02
TCF25-208	ENST00000563032	KLHL34	Q8N239	644 aa		27.64	■■■□□ 2.02
TCF25-208	ENST00000563032	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		27.63	■■■□□ 2.01
TCF25-208	ENST00000563032	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		27.63	■■■□□ 2.01
TCF25-208	ENST00000563032	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		27.63	■■■□□ 2.01
TCF25-208	ENST00000563032	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	27.62	■■■□□ 2.01
TCF25-208	ENST00000563032	IL13	P35225	146 aa		27.62	■■■□□ 2.01
TCF25-208	ENST00000563032	C4B	P0C0L5	1744 aa		27.61	■■■□□ 2.01
TCF25-208	ENST00000563032	MTHFS	P49914	203 aa		27.61	■■■□□ 2.01
TCF25-208	ENST00000563032	ATG3	Q9NT62	314 aa		27.61	■■■□□ 2.01
TCF25-208	ENST00000563032	ATP6V1A	P38606	617 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TCF25-208	ENST00000563032	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TCF25-208	ENST00000563032	KDR	P35968	1356 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TCF25-208	ENST00000563032	CABP4	P57796	275 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TCF25-208	ENST00000563032	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01

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