RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561136.1

TMOD3-209, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 803 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-209ENST00000561136 PTPRNQ16849 979 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD3-209ENST00000561136 NUTM1Q86Y26 1132 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD3-209ENST00000561136 ABCA6Q8N139 1617 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD3-209ENST00000561136 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
TMOD3-209ENST00000561136 FDX1P10109 184 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD3-209ENST00000561136 KCNH2Q12809 1159 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD3-209ENST00000561136 TMEM132AQ24JP5 1023 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD3-209ENST00000561136 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
TMOD3-209ENST00000561136 PCDHGC3Q9UN70 934 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD3-209ENST00000561136 C3P01024 1663 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD3-209ENST00000561136 MYO5CQ9NQX4 1742 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD3-209ENST00000561136 POGZQ7Z3K3 1410 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD3-209ENST00000561136 BMP2P12643 396 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD3-209ENST00000561136 MAP2K5Q13163 448 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD3-209ENST00000561136 ARID5BQ14865 1188 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD3-209ENST00000561136 ITPKCQ96DU7 683 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD3-209ENST00000561136 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa8.57□□□□□ -1.04
TMOD3-209ENST00000561136 AKNAQ7Z591 1439 aa8.57□□□□□ -1.04
TMOD3-209ENST00000561136 MLECQ14165 292 aa8.57□□□□□ -1.04
TMOD3-209ENST00000561136 C14orf37Q86TY3 774 aa8.57□□□□□ -1.04
TMOD3-209ENST00000561136 FAM174AQ8TBP5 190 aa8.57□□□□□ -1.04
TMOD3-209ENST00000561136 UPP2O95045 317 aa8.56□□□□□ -1.04
TMOD3-209ENST00000561136 IRS1P35568 1242 aa8.56□□□□□ -1.04
TMOD3-209ENST00000561136 DNMT3LQ9UJW3 386 aa8.56□□□□□ -1.04
TMOD3-209ENST00000561136 LTBP4Q8N2S1 1624 aa8.55□□□□□ -1.04
TMOD3-209ENST00000561136 IRF6O14896 467 aa8.55□□□□□ -1.04
TMOD3-209ENST00000561136 NR3C2P08235 984 aa8.55□□□□□ -1.04
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
TMOD3-209ENST00000561136 SVOPQ8N4V2 548 aa8.55□□□□□ -1.04
TMOD3-209ENST00000561136 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
TMOD3-209ENST00000561136 LINC00528Q8N1L1 170 aa8.54□□□□□ -1.04
TMOD3-209ENST00000561136 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
TMOD3-209ENST00000561136 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
TMOD3-209ENST00000561136 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
TMOD3-209ENST00000561136 KDM5CP41229 1560 aa8.53□□□□□ -1.04
TMOD3-209ENST00000561136 IGHA1P01876 353 aa8.53□□□□□ -1.04
TMOD3-209ENST00000561136 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
TMOD3-209ENST00000561136 XP32Q5T750 250 aa8.53□□□□□ -1.04
TMOD3-209ENST00000561136 VSIG10Q8N0Z9 540 aa8.53□□□□□ -1.04
TMOD3-209ENST00000561136 PRR7Q8TB68 274 aa8.53□□□□□ -1.04
TMOD3-209ENST00000561136 GPCPD1Q9NPB8 672 aa8.53□□□□□ -1.04
TMOD3-209ENST00000561136 FOXJ1Q92949 421 aa8.52□□□□□ -1.05
TMOD3-209ENST00000561136 CDK15Q96Q40 435 aa8.52□□□□□ -1.05
TMOD3-209ENST00000561136 C9orf84Q5VXU9 1444 aa8.52□□□□□ -1.05
TMOD3-209ENST00000561136 ITSN2Q9NZM3 1697 aa8.52□□□□□ -1.05
TMOD3-209ENST00000561136 SOCS7O14512 581 aa8.51□□□□□ -1.05
TMOD3-209ENST00000561136 CTHP32929 405 aa8.51□□□□□ -1.05
TMOD3-209ENST00000561136 MEIOBQ8N635 442 aa8.51□□□□□ -1.05
TMOD3-209ENST00000561136 WHAMMQ8TF30 809 aa8.51□□□□□ -1.05
TMOD3-209ENST00000561136 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa8.51□□□□□ -1.05
TMOD3-209ENST00000561136 MYO3AQ8NEV4 1616 aa8.51□□□□□ -1.05
TMOD3-209ENST00000561136 PHLDB1Q86UU1 1377 aa8.5□□□□□ -1.05
TMOD3-209ENST00000561136 NDUFV2P19404 249 aa8.5□□□□□ -1.05
TMOD3-209ENST00000561136 CLCN1P35523 988 aa8.5□□□□□ -1.05
TMOD3-209ENST00000561136 NR5A1Q13285 461 aa8.5□□□□□ -1.05
TMOD3-209ENST00000561136 RNFT1Q5M7Z0 435 aa8.5□□□□□ -1.05
TMOD3-209ENST00000561136 SCAPERQ9BY12 1400 aa8.5□□□□□ -1.05
TMOD3-209ENST00000561136 PREX2Q70Z35 1606 aa8.49□□□□□ -1.05
TMOD3-209ENST00000561136 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa8.48□□□□□ -1.05
TMOD3-209ENST00000561136 MARSP56192 900 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
TMOD3-209ENST00000561136 PTSQ03393 145 aa8.48□□□□□ -1.05
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.05
TMOD3-209ENST00000561136 CCDC102AQ96A19 550 aa8.48□□□□□ -1.05
TMOD3-209ENST00000561136 ABCC1P33527 1531 aa8.48□□□□□ -1.05
TMOD3-209ENST00000561136 ARHGAP5Q13017 1502 aa8.48□□□□□ -1.05
TMOD3-209ENST00000561136 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa8.48□□□□□ -1.05
TMOD3-209ENST00000561136 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
TMOD3-209ENST00000561136 ATP10AO60312 1499 aa8.47□□□□□ -1.05
TMOD3-209ENST00000561136 MAGI2Q86UL8 1455 aa8.47□□□□□ -1.05
TMOD3-209ENST00000561136 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
TMOD3-209ENST00000561136 SPTLC1O15269 473 aa8.47□□□□□ -1.05
TMOD3-209ENST00000561136 GRM5P41594 1212 aa8.47□□□□□ -1.05
TMOD3-209ENST00000561136 FOXK2Q01167 660 aa8.47□□□□□ -1.05
TMOD3-209ENST00000561136 AGERQ15109 404 aa8.47□□□□□ -1.05
TMOD3-209ENST00000561136 KANK3Q6NY19 840 aa8.47□□□□□ -1.05
TMOD3-209ENST00000561136 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
TMOD3-209ENST00000561136 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
TMOD3-209ENST00000561136 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa8.47□□□□□ -1.05
TMOD3-209ENST00000561136 NCOA1Q15788 1441 aa8.46□□□□□ -1.05
TMOD3-209ENST00000561136 FIGNL2A6NMB9 653 aa8.46□□□□□ -1.06
TMOD3-209ENST00000561136 ARHGEF15O94989 841 aa8.46□□□□□ -1.06
TMOD3-209ENST00000561136 MTMR2Q13614 643 aa8.46□□□□□ -1.06
TMOD3-209ENST00000561136 DESI1Q6ICB0 168 aa8.46□□□□□ -1.06
TMOD3-209ENST00000561136 SPIRE2Q8WWL2 714 aa8.46□□□□□ -1.06
TMOD3-209ENST00000561136 REREQ9P2R6 1566 aa8.46□□□□□ -1.06
TMOD3-209ENST00000561136 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
TMOD3-209ENST00000561136 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa8.46□□□□□ -1.06
TMOD3-209ENST00000561136 MOXD2PA6NHM9 499 aa8.45□□□□□ -1.06
TMOD3-209ENST00000561136 TTLL8A6PVC2 850 aa8.45□□□□□ -1.06
TMOD3-209ENST00000561136 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
TMOD3-209ENST00000561136 PLCH2O75038 1416 aa8.45□□□□□ -1.06
TMOD3-209ENST00000561136 SLURP2P0DP57 97 aa8.44□□□□□ -1.06
TMOD3-209ENST00000561136 C4orf48Q5BLP8 95 aa8.44□□□□□ -1.06
TMOD3-209ENST00000561136 CCDC155Q8N6L0 562 aa8.44□□□□□ -1.06
TMOD3-209ENST00000561136 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
TMOD3-209ENST00000561136 MAP10Q9P2G4 905 aa8.44□□□□□ -1.06
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa8.44□□□□□ -1.06
TMOD3-209ENST00000561136 MROH2AA6NES4 1674 aa8.43□□□□□ -1.06
TMOD3-209ENST00000561136 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms