RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559312.5

NUMB-231, Transcript of NUMB, endocytic adaptor protein, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUMB, Length 1,439 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUMB-231	ENST00000559312	SLIT1	O75093	1534 aa		10.89	□□□□□ -0.67
NUMB-231	ENST00000559312	APLP1	P51693	650 aa		10.89	□□□□□ -0.67
NUMB-231	ENST00000559312	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		10.89	□□□□□ -0.67
NUMB-231	ENST00000559312	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		10.88	□□□□□ -0.67
NUMB-231	ENST00000559312	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		10.88	□□□□□ -0.67
NUMB-231	ENST00000559312	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	10.88	□□□□□ -0.67
NUMB-231	ENST00000559312	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		10.88	□□□□□ -0.67
NUMB-231	ENST00000559312	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		10.88	□□□□□ -0.67
NUMB-231	ENST00000559312	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		10.87	□□□□□ -0.67
NUMB-231	ENST00000559312	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		10.87	□□□□□ -0.67
NUMB-231	ENST00000559312	FAM117A	Q9C073	453 aa		10.87	□□□□□ -0.67
NUMB-231	ENST00000559312	KDM4A	O75164	1064 aa		10.86	□□□□□ -0.67
NUMB-231	ENST00000559312	ZFYVE9	O95405	1425 aa		10.86	□□□□□ -0.67
NUMB-231	ENST00000559312	USP46	P62068	366 aa		10.85	□□□□□ -0.67
NUMB-231	ENST00000559312	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		10.85	□□□□□ -0.67
NUMB-231	ENST00000559312	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		10.85	□□□□□ -0.67
NUMB-231	ENST00000559312	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	10.85	□□□□□ -0.67
NUMB-231	ENST00000559312	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	10.85	□□□□□ -0.67
NUMB-231	ENST00000559312	EID1	Q9Y6B2	187 aa		10.85	□□□□□ -0.67
NUMB-231	ENST00000559312	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		10.85	□□□□□ -0.67
NUMB-231	ENST00000559312	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	10.85	□□□□□ -0.67
NUMB-231	ENST00000559312	HSPA2	P54652	639 aa		10.84	□□□□□ -0.67
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
NUMB-231	ENST00000559312	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
NUMB-231	ENST00000559312	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		10.84	□□□□□ -0.67
NUMB-231	ENST00000559312	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		10.84	□□□□□ -0.67
NUMB-231	ENST00000559312	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		10.83	□□□□□ -0.68
NUMB-231	ENST00000559312	PPL	O60437	1756 aa		10.83	□□□□□ -0.68
NUMB-231	ENST00000559312	MED14	O60244	1454 aa		10.83	□□□□□ -0.68
NUMB-231	ENST00000559312	ATP6V1A	P38606	617 aa		10.83	□□□□□ -0.68
NUMB-231	ENST00000559312	FUT2	Q10981	343 aa		10.83	□□□□□ -0.68
NUMB-231	ENST00000559312	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		10.83	□□□□□ -0.68
NUMB-231	ENST00000559312	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		10.83	□□□□□ -0.68
NUMB-231	ENST00000559312	PCDHB3	Q9Y5E6	796 aa		10.83	□□□□□ -0.68
NUMB-231	ENST00000559312	IFT172	Q9UG01	1749 aa		10.83	□□□□□ -0.68
NUMB-231	ENST00000559312	STRC	Q7RTU9	1775 aa		10.82	□□□□□ -0.68
NUMB-231	ENST00000559312	RGL3	Q3MIN7	710 aa		10.82	□□□□□ -0.68
NUMB-231	ENST00000559312	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		10.82	□□□□□ -0.68
NUMB-231	ENST00000559312	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		10.82	□□□□□ -0.68
NUMB-231	ENST00000559312	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		10.81	□□□□□ -0.68
NUMB-231	ENST00000559312	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
NUMB-231	ENST00000559312	LTK	P29376	864 aa		10.81	□□□□□ -0.68
NUMB-231	ENST00000559312	IL27	Q8NEV9	243 aa		10.81	□□□□□ -0.68
NUMB-231	ENST00000559312	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		10.81	□□□□□ -0.68
NUMB-231	ENST00000559312	MYOM2	P54296	1465 aa		10.8	□□□□□ -0.68
NUMB-231	ENST00000559312	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		10.8	□□□□□ -0.68
NUMB-231	ENST00000559312	HOXA2	O43364	376 aa		10.8	□□□□□ -0.68
NUMB-231	ENST00000559312	NEUROD1	Q13562	356 aa		10.8	□□□□□ -0.68
NUMB-231	ENST00000559312	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		10.8	□□□□□ -0.68
NUMB-231	ENST00000559312	TONSL	Q96HA7	1378 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NUMB-231	ENST00000559312	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
NUMB-231	ENST00000559312	IQGAP1	P46940	1657 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NUMB-231	ENST00000559312	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NUMB-231	ENST00000559312	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
NUMB-231	ENST00000559312	MORN1	Q5T089	497 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NUMB-231	ENST00000559312	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NUMB-231	ENST00000559312	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		10.77	□□□□□ -0.68
NUMB-231	ENST00000559312	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		10.77	□□□□□ -0.68
NUMB-231	ENST00000559312	MTR	Q99707	1265 aa		10.77	□□□□□ -0.68
NUMB-231	ENST00000559312	DIP2A	Q14689	1571 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NUMB-231	ENST00000559312	PIK3C2G	O75747	1445 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NUMB-231	ENST00000559312	NR1I2	O75469	434 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NUMB-231	ENST00000559312	COPS2	P61201	443 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NUMB-231	ENST00000559312	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NUMB-231	ENST00000559312	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NUMB-231	ENST00000559312	IL21	Q9HBE4	155 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NUMB-231	ENST00000559312	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NUMB-231	ENST00000559312	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NUMB-231	ENST00000559312	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NUMB-231	ENST00000559312	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NUMB-231	ENST00000559312	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
NUMB-231	ENST00000559312	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NUMB-231	ENST00000559312	LAMC1	P11047	1609 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NUMB-231	ENST00000559312	GJA5	P36382	358 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NUMB-231	ENST00000559312	TBX22	Q9Y458	520 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NUMB-231	ENST00000559312	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NUMB-231	ENST00000559312	SPTLC1	O15269	473 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NUMB-231	ENST00000559312	NDUFV2	P19404	249 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NUMB-231	ENST00000559312	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
NUMB-231	ENST00000559312	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NUMB-231	ENST00000559312	PIK3R4	Q99570	1358 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NUMB-231	ENST00000559312	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	10.73	□□□□□ -0.69
NUMB-231	ENST00000559312	FDX1	P10109	184 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NUMB-231	ENST00000559312	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
NUMB-231	ENST00000559312	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NUMB-231	ENST00000559312	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NUMB-231	ENST00000559312	HLA-C	Q95604	372 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NUMB-231	ENST00000559312	GOPC	Q9HD26	462 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NUMB-231	ENST00000559312	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NUMB-231	ENST00000559312	ALK	Q9UM73	1620 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NUMB-231	ENST00000559312	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	10.72	□□□□□ -0.69
NUMB-231	ENST00000559312	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		10.72	□□□□□ -0.69
NUMB-231	ENST00000559312	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	10.72	□□□□□ -0.69
NUMB-231	ENST00000559312	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		10.72	□□□□□ -0.69
NUMB-231	ENST00000559312	ZPR1	O75312	459 aa		10.71	□□□□□ -0.69
NUMB-231	ENST00000559312	GUCA2A	Q02747	115 aa		10.71	□□□□□ -0.69
NUMB-231	ENST00000559312	KCNC4	Q03721	635 aa		10.71	□□□□□ -0.69
NUMB-231	ENST00000559312		Q3C1V9	767 aa		10.71	□□□□□ -0.69
NUMB-231	ENST00000559312	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	10.71	□□□□□ -0.69
NUMB-231	ENST00000559312	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		10.71	□□□□□ -0.69

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