RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557115.5

CIPC-208, Transcript of CLOCK interacting pacemaker, humanhuman

TSL 4

Gene CIPC, Length 882 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPC-208ENST00000557115 SLC15A2Q16348 729 aa30.01■■■□□ 2.39
CIPC-208ENST00000557115 KIF24Q5T7B8 1368 aa30.01■■■□□ 2.39
CIPC-208ENST00000557115 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa30■■■□□ 2.39
CIPC-208ENST00000557115 TATP17735 454 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
CIPC-208ENST00000557115 MEGF6O75095 1541 aa29.99■■■□□ 2.39
CIPC-208ENST00000557115 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
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CIPC-208ENST00000557115 KAT6BQ8WYB5 2073 aa29.98■■■□□ 2.39
CIPC-208ENST00000557115 ZBTB7AO95365 584 aa29.97■■■□□ 2.39
CIPC-208ENST00000557115 RGPD2P0DJD1 1756 aa29.95■■■□□ 2.39
CIPC-208ENST00000557115 BTAF1O14981 1849 aa29.93■■■□□ 2.38
CIPC-208ENST00000557115 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
CIPC-208ENST00000557115 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
CIPC-208ENST00000557115 SLC27A3Q5K4L6 730 aa29.9■■■□□ 2.38
CIPC-208ENST00000557115 PANK3Q9H999 370 aa29.9■■■□□ 2.38
CIPC-208ENST00000557115 LRRC4BQ9NT99 713 aa29.9■■■□□ 2.38
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CIPC-208ENST00000557115 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa29.89■■■□□ 2.38
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CIPC-208ENST00000557115 ZNF827Q17R98 1081 aa29.86■■■□□ 2.37
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CIPC-208ENST00000557115 POLKQ9UBT6 870 aa29.86■■■□□ 2.37
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CIPC-208ENST00000557115 DOT1LQ8TEK3 1739 aa29.83■■■□□ 2.37
CIPC-208ENST00000557115 SHANK3Q9BYB0 1731 aa29.82■■■□□ 2.36
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CIPC-208ENST00000557115 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
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CIPC-208ENST00000557115 CYP27B1O15528 508 aa29.79■■■□□ 2.36
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CIPC-208ENST00000557115 MORC1Q86VD1 984 aa29.76■■■□□ 2.35
CIPC-208ENST00000557115 KNSTRNQ9Y448 316 aa29.76■■■□□ 2.35
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CIPC-208ENST00000557115 NCAPD2Q15021 1401 aa29.73■■■□□ 2.35
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CIPC-208ENST00000557115 ARXQ96QS3 562 aa29.72■■■□□ 2.35
CIPC-208ENST00000557115 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
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CIPC-208ENST00000557115 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP29.71■■■□□ 2.35
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CIPC-208ENST00000557115 PALLDQ8WX93 1383 aa29.69■■■□□ 2.34
CIPC-208ENST00000557115 MSH5O43196 834 aa29.69■■■□□ 2.34
CIPC-208ENST00000557115 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
CIPC-208ENST00000557115 POLD1P28340 1107 aa29.68■■■□□ 2.34
CIPC-208ENST00000557115 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
CIPC-208ENST00000557115 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
CIPC-208ENST00000557115 SYT17Q9BSW7 474 aa29.68■■■□□ 2.34
CIPC-208ENST00000557115 IFNL2Q8IZJ0 200 aa29.67■■■□□ 2.34
CIPC-208ENST00000557115 LY75O60449 1722 aa29.67■■■□□ 2.34
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CIPC-208ENST00000557115 TMOD3Q9NYL9 352 aa29.64■■■□□ 2.34
CIPC-208ENST00000557115 IGSF1Q8N6C5 1336 aa29.64■■■□□ 2.34
CIPC-208ENST00000557115 KLHL34Q8N239 644 aa29.63■■■□□ 2.33
CIPC-208ENST00000557115 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
CIPC-208ENST00000557115 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
CIPC-208ENST00000557115 QSER1Q2KHR3 1735 aa29.58■■■□□ 2.33
CIPC-208ENST00000557115 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
CIPC-208ENST00000557115 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa29.58■■■□□ 2.33
CIPC-208ENST00000557115 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa29.57■■■□□ 2.32
CIPC-208ENST00000557115 AK7Q96M32 723 aa29.57■■■□□ 2.32
CIPC-208ENST00000557115 FLAD1Q8NFF5 587 aa29.56■■■□□ 2.32
CIPC-208ENST00000557115 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
CIPC-208ENST00000557115 AMOTQ4VCS5 1084 aa29.55■■■□□ 2.32
CIPC-208ENST00000557115 ASAP1Q9ULH1 1129 aa29.55■■■□□ 2.32
CIPC-208ENST00000557115 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa29.54■■■□□ 2.32
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CIPC-208ENST00000557115 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
CIPC-208ENST00000557115 ITGB4P16144 1822 aa29.54■■■□□ 2.32
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CIPC-208ENST00000557115 AEBP1Q8IUX7 1158 aa29.52■■■□□ 2.32
CIPC-208ENST00000557115 DCAF5Q96JK2 942 aa29.52■■■□□ 2.32
CIPC-208ENST00000557115 C5P01031 1676 aa29.52■■■□□ 2.32
CIPC-208ENST00000557115 C1orf141Q5JVX7 400 aa29.51■■■□□ 2.31
CIPC-208ENST00000557115 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
CIPC-208ENST00000557115 ERVV-2B6SEH9 535 aa29.5■■■□□ 2.31
CIPC-208ENST00000557115 PHF14O94880 888 aa29.5■■■□□ 2.31
CIPC-208ENST00000557115 IL13P35225 146 aa29.49■■■□□ 2.31
CIPC-208ENST00000557115 ATP6V1AP38606 617 aa29.49■■■□□ 2.31
CIPC-208ENST00000557115 MTHFSP49914 203 aa29.49■■■□□ 2.31
CIPC-208ENST00000557115 ATG3Q9NT62 314 aa29.49■■■□□ 2.31
CIPC-208ENST00000557115 GPR162Q16538 588 aa29.48■■■□□ 2.31
CIPC-208ENST00000557115 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
CIPC-208ENST00000557115 CABP4P57796 275 aa29.47■■■□□ 2.31
CIPC-208ENST00000557115 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
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