RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556385.5

RIN3-209, Transcript of Ras and Rab interactor 3, humanhuman

TSL 3

Gene RIN3, Length 856 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIN3-209ENST00000556385 PLSCR1O15162 318 aa23.29■■□□□ 1.32
RIN3-209ENST00000556385 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa23.28■■□□□ 1.32
RIN3-209ENST00000556385 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
RIN3-209ENST00000556385 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa23.27■■□□□ 1.32
RIN3-209ENST00000556385 NCAPD2Q15021 1401 aa23.26■■□□□ 1.31
RIN3-209ENST00000556385 TATP17735 454 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
RIN3-209ENST00000556385 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
RIN3-209ENST00000556385 PTF1AQ7RTS3 328 aa23.24■■□□□ 1.31
RIN3-209ENST00000556385 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa23.24■■□□□ 1.31
RIN3-209ENST00000556385 USHBP1Q8N6Y0 703 aa23.23■■□□□ 1.31
RIN3-209ENST00000556385 EYA1Q99502 592 aa23.23■■□□□ 1.31
RIN3-209ENST00000556385 KAT6BQ8WYB5 2073 aa23.22■■□□□ 1.31
RIN3-209ENST00000556385 MTHFSP49914 203 aa23.22■■□□□ 1.31
RIN3-209ENST00000556385 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
RIN3-209ENST00000556385 MEGF6O75095 1541 aa23.22■■□□□ 1.31
RIN3-209ENST00000556385 IGSF1Q8N6C5 1336 aa23.2■■□□□ 1.3
RIN3-209ENST00000556385 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP23.18■■□□□ 1.3
RIN3-209ENST00000556385 KCNQ2O43526 872 aa23.17■■□□□ 1.3
RIN3-209ENST00000556385 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
RIN3-209ENST00000556385 ACSBG1Q96GR2 724 aa23.17■■□□□ 1.3
RIN3-209ENST00000556385 SHANK3Q9BYB0 1731 aa23.16■■□□□ 1.3
RIN3-209ENST00000556385 NHSQ6T4R5 1651 aa23.16■■□□□ 1.3
RIN3-209ENST00000556385 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa23.16■■□□□ 1.3
RIN3-209ENST00000556385 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa23.16■■□□□ 1.3
RIN3-209ENST00000556385 IL13P35225 146 aa23.16■■□□□ 1.3
RIN3-209ENST00000556385 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
RIN3-209ENST00000556385 PROM2Q8N271 834 aa23.16■■□□□ 1.3
RIN3-209ENST00000556385 SPG7Q9UQ90 795 aa23.16■■□□□ 1.3
RIN3-209ENST00000556385 PKD1L3Q7Z443 1732 aa23.16■■□□□ 1.3
RIN3-209ENST00000556385 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
RIN3-209ENST00000556385 TXNRD1Q16881 649 aa23.15■■□□□ 1.3
RIN3-209ENST00000556385 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
RIN3-209ENST00000556385 CFAP53Q96M91 514 aa23.14■■□□□ 1.29
RIN3-209ENST00000556385 SPON1Q9HCB6 807 aa23.12■■□□□ 1.29
RIN3-209ENST00000556385 PPP2R1AP30153 589 aa23.11■■□□□ 1.29
RIN3-209ENST00000556385 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
RIN3-209ENST00000556385 KDRP35968 1356 aa23.11■■□□□ 1.29
RIN3-209ENST00000556385 STK32BQ9NY57 414 aa23.1■■□□□ 1.29
RIN3-209ENST00000556385 BTAF1O14981 1849 aa23.1■■□□□ 1.29
RIN3-209ENST00000556385 RALBP1Q15311 655 aa23.09■■□□□ 1.29
RIN3-209ENST00000556385 AMOTQ4VCS5 1084 aa23.09■■□□□ 1.29
RIN3-209ENST00000556385 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
RIN3-209ENST00000556385 SULT6B1Q6IMI4 303 aa23.08■■□□□ 1.29
RIN3-209ENST00000556385 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
RIN3-209ENST00000556385 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
RIN3-209ENST00000556385 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
RIN3-209ENST00000556385 DOT1LQ8TEK3 1739 aa23.06■■□□□ 1.28
RIN3-209ENST00000556385 CYP27B1O15528 508 aa23.06■■□□□ 1.28
RIN3-209ENST00000556385 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
RIN3-209ENST00000556385 IFNL2Q8IZJ0 200 aa23.06■■□□□ 1.28
RIN3-209ENST00000556385 SLC15A2Q16348 729 aa23.05■■□□□ 1.28
RIN3-209ENST00000556385 NUDCQ9Y266 331 aa23.05■■□□□ 1.28
RIN3-209ENST00000556385 CASZ1Q86V15 1759 aa23.04■■□□□ 1.28
RIN3-209ENST00000556385 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
RIN3-209ENST00000556385 AEBP1Q8IUX7 1158 aa23.03■■□□□ 1.28
RIN3-209ENST00000556385 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
RIN3-209ENST00000556385 PHKG2P15735 406 aa23.02■■□□□ 1.28
RIN3-209ENST00000556385 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
RIN3-209ENST00000556385 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
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RIN3-209ENST00000556385 ZBTB7AO95365 584 aa22.99■■□□□ 1.27
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RIN3-209ENST00000556385 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.98■■□□□ 1.27
RIN3-209ENST00000556385 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.98■■□□□ 1.27
RIN3-209ENST00000556385 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
RIN3-209ENST00000556385 DCAF5Q96JK2 942 aa22.97■■□□□ 1.27
RIN3-209ENST00000556385 ITGB4P16144 1822 aa22.96■■□□□ 1.27
RIN3-209ENST00000556385 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
RIN3-209ENST00000556385 LRRC4BQ9NT99 713 aa22.96■■□□□ 1.27
RIN3-209ENST00000556385 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
RIN3-209ENST00000556385 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
RIN3-209ENST00000556385 PAPPAQ13219 1627 aa22.96■■□□□ 1.27
RIN3-209ENST00000556385 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.95■■□□□ 1.26
RIN3-209ENST00000556385 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.94■■□□□ 1.26
RIN3-209ENST00000556385 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.94■■□□□ 1.26
RIN3-209ENST00000556385 MTFR1LQ9H019 292 aa22.94■■□□□ 1.26
RIN3-209ENST00000556385 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.93■■□□□ 1.26
RIN3-209ENST00000556385 LY75O60449 1722 aa22.92■■□□□ 1.26
RIN3-209ENST00000556385 FCHSD2O94868 740 aa22.92■■□□□ 1.26
RIN3-209ENST00000556385 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
RIN3-209ENST00000556385 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.26
RIN3-209ENST00000556385 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.92■■□□□ 1.26
RIN3-209ENST00000556385 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
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RIN3-209ENST00000556385 PTGER2P43116 358 aa22.91■■□□□ 1.26
RIN3-209ENST00000556385 ZNF827Q17R98 1081 aa22.91■■□□□ 1.26
RIN3-209ENST00000556385 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
RIN3-209ENST00000556385 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.9■■□□□ 1.26
RIN3-209ENST00000556385 AKT1S1Q96B36 256 aa22.89■■□□□ 1.25
RIN3-209ENST00000556385 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.89■■□□□ 1.25
RIN3-209ENST00000556385 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
RIN3-209ENST00000556385 KCNQ4P56696 695 aa22.88■■□□□ 1.25
RIN3-209ENST00000556385 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
RIN3-209ENST00000556385 PIGBQ92521 554 aa22.88■■□□□ 1.25
RIN3-209ENST00000556385 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
RIN3-209ENST00000556385 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.88■■□□□ 1.25
RIN3-209ENST00000556385 QSER1Q2KHR3 1735 aa22.88■■□□□ 1.25
RIN3-209ENST00000556385 NEFMP07197 916 aa22.87■■□□□ 1.25
RIN3-209ENST00000556385 PRKAR2BP31323 418 aa22.87■■□□□ 1.25
RIN3-209ENST00000556385 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
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