RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555699.5

LGMN-211, Transcript of legumain, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LGMN, Length 1,728 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMN-211ENST00000555699 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.37■■□□□ 1.17
LGMN-211ENST00000555699 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
LGMN-211ENST00000555699 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
LGMN-211ENST00000555699 HMOX1P09601 288 aa22.36■■□□□ 1.17
LGMN-211ENST00000555699 FAM196AQ6ZSG2 479 aa22.35■■□□□ 1.17
LGMN-211ENST00000555699 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.35■■□□□ 1.17
LGMN-211ENST00000555699 SBF2Q86WG5 1849 aa22.35■■□□□ 1.17
LGMN-211ENST00000555699 TRIM37O94972 964 aa22.34■■□□□ 1.17
LGMN-211ENST00000555699 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
LGMN-211ENST00000555699 KDRP35968 1356 aa22.34■■□□□ 1.17
LGMN-211ENST00000555699 CFAP53Q96M91 514 aa22.33■■□□□ 1.17
LGMN-211ENST00000555699 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
LGMN-211ENST00000555699 CYP27B1O15528 508 aa22.32■■□□□ 1.16
LGMN-211ENST00000555699 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
LGMN-211ENST00000555699 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.31■■□□□ 1.16
LGMN-211ENST00000555699 KCNQ2O43526 872 aa22.3■■□□□ 1.16
LGMN-211ENST00000555699 BCL9O00512 1426 aa22.29■■□□□ 1.16
LGMN-211ENST00000555699 DEFB132Q7Z7B7 95 aa22.29■■□□□ 1.16
LGMN-211ENST00000555699 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.29■■□□□ 1.16
LGMN-211ENST00000555699 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.28■■□□□ 1.16
LGMN-211ENST00000555699 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.28■■□□□ 1.16
LGMN-211ENST00000555699 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.26■■□□□ 1.15
LGMN-211ENST00000555699 SPG7Q9UQ90 795 aa22.26■■□□□ 1.15
LGMN-211ENST00000555699 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.25■■□□□ 1.15
LGMN-211ENST00000555699 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
LGMN-211ENST00000555699 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.15
LGMN-211ENST00000555699 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.15
LGMN-211ENST00000555699 NHSQ6T4R5 1651 aa22.25■■□□□ 1.15
LGMN-211ENST00000555699 PHKG2P15735 406 aa22.23■■□□□ 1.15
LGMN-211ENST00000555699 CCDC184Q52MB2 194 aa22.23■■□□□ 1.15
LGMN-211ENST00000555699 CCDC125Q86Z20 511 aa22.23■■□□□ 1.15
LGMN-211ENST00000555699 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.23■■□□□ 1.15
LGMN-211ENST00000555699 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
LGMN-211ENST00000555699 NUDCQ9Y266 331 aa22.23■■□□□ 1.15
LGMN-211ENST00000555699 APBA3O96018 575 aa22.22■■□□□ 1.15
LGMN-211ENST00000555699 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
LGMN-211ENST00000555699 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
LGMN-211ENST00000555699 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
LGMN-211ENST00000555699 PRKAR2BP31323 418 aa22.21■■□□□ 1.15
LGMN-211ENST00000555699 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
LGMN-211ENST00000555699 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
LGMN-211ENST00000555699 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
LGMN-211ENST00000555699 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.2■■□□□ 1.14
LGMN-211ENST00000555699 BTAF1O14981 1849 aa22.2■■□□□ 1.14
LGMN-211ENST00000555699 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.2■■□□□ 1.14
LGMN-211ENST00000555699 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
LGMN-211ENST00000555699 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.19■■□□□ 1.14
LGMN-211ENST00000555699 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
LGMN-211ENST00000555699 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.19■■□□□ 1.14
LGMN-211ENST00000555699 ANP32CO43423 234 aa22.18■■□□□ 1.14
LGMN-211ENST00000555699 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
LGMN-211ENST00000555699 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
LGMN-211ENST00000555699 ITGB4P16144 1822 aa22.17■■□□□ 1.14
LGMN-211ENST00000555699 BAG6P46379 1132 aa22.17■■□□□ 1.14
LGMN-211ENST00000555699 CAMKK2Q96RR4 588 aa22.16■■□□□ 1.14
LGMN-211ENST00000555699 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.15■■□□□ 1.14
LGMN-211ENST00000555699 FCHSD2O94868 740 aa22.14■■□□□ 1.14
LGMN-211ENST00000555699 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.13■■□□□ 1.13
LGMN-211ENST00000555699 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.13■■□□□ 1.13
LGMN-211ENST00000555699 PROM2Q8N271 834 aa22.12■■□□□ 1.13
LGMN-211ENST00000555699 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.11■■□□□ 1.13
LGMN-211ENST00000555699 PIGBQ92521 554 aa22.11■■□□□ 1.13
LGMN-211ENST00000555699 LGR6Q9HBX8 967 aa22.11■■□□□ 1.13
LGMN-211ENST00000555699 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
LGMN-211ENST00000555699 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.1■■□□□ 1.13
LGMN-211ENST00000555699 DCAF5Q96JK2 942 aa22.1■■□□□ 1.13
LGMN-211ENST00000555699 RREB1Q92766 1687 aa22.1■■□□□ 1.13
LGMN-211ENST00000555699 PLSCR1O15162 318 aa22.09■■□□□ 1.13
LGMN-211ENST00000555699 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.09■■□□□ 1.13
LGMN-211ENST00000555699 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.09■■□□□ 1.13
LGMN-211ENST00000555699 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
LGMN-211ENST00000555699 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa22.08■■□□□ 1.13
LGMN-211ENST00000555699 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
LGMN-211ENST00000555699 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.08■■□□□ 1.12
LGMN-211ENST00000555699 NUP188Q5SRE5 1749 aa22.08■■□□□ 1.12
LGMN-211ENST00000555699 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa22.07■■□□□ 1.12
LGMN-211ENST00000555699 KCNQ4P56696 695 aa22.07■■□□□ 1.12
LGMN-211ENST00000555699 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
LGMN-211ENST00000555699 MAP3K5Q99683 1374 aa22.07■■□□□ 1.12
LGMN-211ENST00000555699 RNMTO43148 476 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
LGMN-211ENST00000555699 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.06■■□□□ 1.12
LGMN-211ENST00000555699 TXNRD1Q16881 649 aa22.06■■□□□ 1.12
LGMN-211ENST00000555699 IL17REQ8NFR9 667 aa22.06■■□□□ 1.12
LGMN-211ENST00000555699 MRS2Q9HD23 443 aa22.06■■□□□ 1.12
LGMN-211ENST00000555699 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.05■■□□□ 1.12
LGMN-211ENST00000555699 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.05■■□□□ 1.12
LGMN-211ENST00000555699 DLG5Q8TDM6 1919 aa22.04■■□□□ 1.12
LGMN-211ENST00000555699 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.04■■□□□ 1.12
LGMN-211ENST00000555699 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.04■■□□□ 1.12
LGMN-211ENST00000555699 LRRC4BQ9NT99 713 aa22.04■■□□□ 1.12
LGMN-211ENST00000555699 LY75O60449 1722 aa22.04■■□□□ 1.12
LGMN-211ENST00000555699 CABP4P57796 275 aa22.03■■□□□ 1.12
LGMN-211ENST00000555699 DCTN1Q14203 1278 aa22.03■■□□□ 1.12
LGMN-211ENST00000555699 MRC1P22897 1456 aa22.02■■□□□ 1.12
LGMN-211ENST00000555699 PALLDQ8WX93 1383 aa22.02■■□□□ 1.12
LGMN-211ENST00000555699 ATG3Q9NT62 314 aa22.02■■□□□ 1.12
LGMN-211ENST00000555699 MCM10Q7L590 875 aa22.01■■□□□ 1.11
LGMN-211ENST00000555699 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
LGMN-211ENST00000555699 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
LGMN-211ENST00000555699 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms