RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554994.5

ATXN3-231, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 922 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-231	ENST00000554994	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ATXN3-231	ENST00000554994	SULF1	Q8IWU6	871 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ATXN3-231	ENST00000554994	DEPDC5	O75140	1603 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ATXN3-231	ENST00000554994	GMPR	P36959	345 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATXN3-231	ENST00000554994	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
ATXN3-231	ENST00000554994	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
ATXN3-231	ENST00000554994	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ATXN3-231	ENST00000554994	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ATXN3-231	ENST00000554994	TMEM94	Q12767	1356 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ATXN3-231	ENST00000554994	AFF2	P51816	1311 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ATXN3-231	ENST00000554994	GNPAT	O15228	680 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ATXN3-231	ENST00000554994	ALDH1A1	P00352	501 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ATXN3-231	ENST00000554994	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
ATXN3-231	ENST00000554994	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ATXN3-231	ENST00000554994	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
ATXN3-231	ENST00000554994	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATXN3-231	ENST00000554994	BMP1	P13497	986 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATXN3-231	ENST00000554994		Q3C1V9	767 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATXN3-231	ENST00000554994	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATXN3-231	ENST00000554994	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
ATXN3-231	ENST00000554994	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
ATXN3-231	ENST00000554994	PLXNC1	O60486	1568 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATXN3-231	ENST00000554994	A2M	P01023	1474 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ATXN3-231	ENST00000554994	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ATXN3-231	ENST00000554994	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
ATXN3-231	ENST00000554994	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ATXN3-231	ENST00000554994	YY1	P25490	414 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ATXN3-231	ENST00000554994	MMP16	P51512	607 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ATXN3-231	ENST00000554994	SKOR1	P84550	965 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ATXN3-231	ENST00000554994	IRF7	Q92985	503 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ATXN3-231	ENST00000554994	PHOX2B	Q99453	314 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ATXN3-231	ENST00000554994	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
ATXN3-231	ENST00000554994	MAP3K1	Q13233	1512 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ATXN3-231	ENST00000554994	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ATXN3-231	ENST00000554994	LRP5	O75197	1615 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ATXN3-231	ENST00000554994	ATP7A	Q04656	1500 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ATXN3-231	ENST00000554994	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ATXN3-231	ENST00000554994	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ATXN3-231	ENST00000554994	PZP	P20742	1482 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ATXN3-231	ENST00000554994	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ATXN3-231	ENST00000554994	CLIP1	P30622	1438 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ATXN3-231	ENST00000554994	PREX2	Q70Z35	1606 aa		7.34	□□□□□ -1.24
ATXN3-231	ENST00000554994	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ATXN3-231	ENST00000554994	NLRP1	Q9C000	1473 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ATXN3-231	ENST00000554994	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
ATXN3-231	ENST00000554994	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
ATXN3-231	ENST00000554994	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
ATXN3-231	ENST00000554994	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
ATXN3-231	ENST00000554994	MIA2	Q96PC5	1412 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ATXN3-231	ENST00000554994	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATXN3-231	ENST00000554994	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
ATXN3-231	ENST00000554994	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	7.32	□□□□□ -1.24
ATXN3-231	ENST00000554994	TRIM46	Q7Z4K8	759 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATXN3-231	ENST00000554994	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
ATXN3-231	ENST00000554994	HLA-C	Q95604	372 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATXN3-231	ENST00000554994	C8orf37	Q96NL8	207 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATXN3-231	ENST00000554994	SLAIN2	Q9P270	581 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATXN3-231	ENST00000554994	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
ATXN3-231	ENST00000554994	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATXN3-231	ENST00000554994	FMN1	Q68DA7	1419 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATXN3-231	ENST00000554994	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
ATXN3-231	ENST00000554994	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
ATXN3-231	ENST00000554994	LTK	P29376	864 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATXN3-231	ENST00000554994	WNT7B	P56706	349 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATXN3-231	ENST00000554994	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATXN3-231	ENST00000554994	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATXN3-231	ENST00000554994	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
ATXN3-231	ENST00000554994	ERBB4	Q15303	1308 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ATXN3-231	ENST00000554994	GPR37	O15354	613 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ATXN3-231	ENST00000554994	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ATXN3-231	ENST00000554994	SHPRH	Q149N8	1683 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ATXN3-231	ENST00000554994	MSH6	P52701	1360 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ATXN3-231	ENST00000554994	TIAM1	Q13009	1591 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ATXN3-231	ENST00000554994	CEP162	Q5TB80	1403 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ATXN3-231	ENST00000554994		H3BM21	787 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ATXN3-231	ENST00000554994	SLC24A1	O60721	1099 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ATXN3-231	ENST00000554994	KDM4A	O75164	1064 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ATXN3-231	ENST00000554994	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ATXN3-231	ENST00000554994	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ATXN3-231	ENST00000554994	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		7.27	□□□□□ -1.24
ATXN3-231	ENST00000554994	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
ATXN3-231	ENST00000554994	KIF3B	O15066	747 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ATXN3-231	ENST00000554994	CD46	P15529	392 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ATXN3-231	ENST00000554994	GUCA2A	Q02747	115 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ATXN3-231	ENST00000554994	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ATXN3-231	ENST00000554994	NCOA2	Q15596	1464 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ATXN3-231	ENST00000554994	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ATXN3-231	ENST00000554994	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
ATXN3-231	ENST00000554994	KCNA6	P17658	529 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ATXN3-231	ENST00000554994	HRC	P23327	699 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ATXN3-231	ENST00000554994	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
ATXN3-231	ENST00000554994	NGLY1	Q96IV0	654 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ATXN3-231	ENST00000554994	ZFP42	Q96MM3	310 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ATXN3-231	ENST00000554994	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ATXN3-231	ENST00000554994	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ATXN3-231	ENST00000554994	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ATXN3-231	ENST00000554994	DIP2A	Q14689	1571 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ATXN3-231	ENST00000554994	NWD1	Q149M9	1564 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ATXN3-231	ENST00000554994	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		7.25	□□□□□ -1.25

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