RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554945.1

SRP54-AS1-201, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3

Gene SRP54-AS1, Length 600 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-201ENST00000554945 A0A1W2PP64 1363 aa13.28□□□□□ -0.28
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MYOM1P52179 1685 aa13.28□□□□□ -0.28
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
SRP54-AS1-201ENST00000554945 IP6K1Q92551 441 aa13.27□□□□□ -0.29
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PAPPAQ13219 1627 aa13.24□□□□□ -0.29
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HAX1O00165 279 aa13.24□□□□□ -0.29
SRP54-AS1-201ENST00000554945 COG3Q96JB2 828 aa13.24□□□□□ -0.29
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SGIP1Q9BQI5 828 aa13.24□□□□□ -0.29
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SYT17Q9BSW7 474 aa13.24□□□□□ -0.29
SRP54-AS1-201ENST00000554945 UTRNP46939 3433 aa13.23□□□□□ -0.29
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa13.23□□□□□ -0.29
SRP54-AS1-201ENST00000554945 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TESK2Q96S53 571 aa13.23□□□□□ -0.29
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SLC27A3Q5K4L6 730 aa13.22□□□□□ -0.29
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LRRC4BQ9NT99 713 aa13.22□□□□□ -0.29
SRP54-AS1-201ENST00000554945 QSER1Q2KHR3 1735 aa13.22□□□□□ -0.29
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HOXC9P31274 260 aa13.21□□□□□ -0.29
SRP54-AS1-201ENST00000554945 AMPHP49418 695 aa13.21□□□□□ -0.29
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ARXQ96QS3 562 aa13.21□□□□□ -0.29
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CHD4Q14839 1912 aa13.21□□□□□ -0.3
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RGPD2P0DJD1 1756 aa13.2□□□□□ -0.3
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MAP3K19Q56UN5 1328 aa13.2□□□□□ -0.3
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ZNF827Q17R98 1081 aa13.2□□□□□ -0.3
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SLC16A10Q8TF71 515 aa13.2□□□□□ -0.3
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PITPNM1O00562 1244 aa13.19□□□□□ -0.3
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa13.19□□□□□ -0.3
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MAP3K5Q99683 1374 aa13.19□□□□□ -0.3
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
SRP54-AS1-201ENST00000554945 DOT1LQ8TEK3 1739 aa13.18□□□□□ -0.3
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LY75O60449 1722 aa13.17□□□□□ -0.3
SRP54-AS1-201ENST00000554945 COL24A1Q17RW2 1714 aa13.17□□□□□ -0.3
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SHANK3Q9BYB0 1731 aa13.17□□□□□ -0.3
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FBLN1P23142 703 aa13.17□□□□□ -0.3
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RTL1A6NKG5 1358 aa13.17□□□□□ -0.3
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CGNL1Q0VF96 1302 aa13.16□□□□□ -0.3
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FYB1O15117 783 aa13.16□□□□□ -0.3
SRP54-AS1-201ENST00000554945 POLD1P28340 1107 aa13.16□□□□□ -0.3
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP13.16□□□□□ -0.3
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TMF1P82094 1093 aa13.16□□□□□ -0.3
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa13.16□□□□□ -0.3
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa13.16□□□□□ -0.3
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa13.15□□□□□ -0.3
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NBPF6Q5VWK0 638 aa13.15□□□□□ -0.3
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NBPF4Q96M43 638 aa13.15□□□□□ -0.3
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MEGF6O75095 1541 aa13.14□□□□□ -0.31
SRP54-AS1-201ENST00000554945 GGNBP2Q9H3C7 697 aa13.14□□□□□ -0.31
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NSD2O96028 1365 aa13.14□□□□□ -0.31
SRP54-AS1-201ENST00000554945 USP47Q96K76 1375 aa13.13□□□□□ -0.31
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KCNQ4P56696 695 aa13.13□□□□□ -0.31
SRP54-AS1-201ENST00000554945 GPR162Q16538 588 aa13.13□□□□□ -0.31
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CDCA8Q53HL2 280 aa13.13□□□□□ -0.31
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa13.13□□□□□ -0.31
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KIF20BQ96Q89 1820 aa13.13□□□□□ -0.31
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KIF24Q5T7B8 1368 aa13.12□□□□□ -0.31
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TATP17735 454 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
SRP54-AS1-201ENST00000554945 INSRP06213 1382 aa13.11□□□□□ -0.31
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KLHL34Q8N239 644 aa13.11□□□□□ -0.31
SRP54-AS1-201ENST00000554945 USHBP1Q8N6Y0 703 aa13.11□□□□□ -0.31
SRP54-AS1-201ENST00000554945 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa13.1□□□□□ -0.31
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa13.1□□□□□ -0.31
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FLT4P35916 1363 aa13.09□□□□□ -0.31
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa13.09□□□□□ -0.31
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FOXD4L1Q9NU39 408 aa13.09□□□□□ -0.31
SRP54-AS1-201ENST00000554945 C5P01031 1676 aa13.08□□□□□ -0.31
SRP54-AS1-201ENST00000554945 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TAF1LQ8IZX4 1826 aa13.08□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ITGB4P16144 1822 aa13.07□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FLAD1Q8NFF5 587 aa13.07□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-201ENST00000554945 EVX2Q03828 476 aa13.06□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa13.06□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CYP27B1O15528 508 aa13.05□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-201ENST00000554945 C1QTNF8P60827 252 aa13.05□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NLGN2Q8NFZ4 835 aa13.05□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CARD14Q9BXL6 1004 aa13.05□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PALLDQ8WX93 1383 aa13.05□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PKD1L3Q7Z443 1732 aa13.05□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-201ENST00000554945 GRIN3BO60391 1043 aa13.04□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa13.04□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-201ENST00000554945 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa13.04□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NSD3Q9BZ95 1437 aa13.04□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa13.03□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa13.03□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SPG7Q9UQ90 795 aa13.03□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-201ENST00000554945 WASHC2AQ641Q2 1341 aa13.03□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-201ENST00000554945 C4BP0C0L5 1744 aa13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.8 ms