RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.8■■□□□ 1.24
CS-227ENST00000551441 MAP3K5Q99683 1374 aa22.79■■□□□ 1.24
CS-227ENST00000551441 AMPHP49418 695 aa22.79■■□□□ 1.24
CS-227ENST00000551441 C1QTNF8P60827 252 aa22.79■■□□□ 1.24
CS-227ENST00000551441 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.79■■□□□ 1.24
CS-227ENST00000551441 HOXC9P31274 260 aa22.78■■□□□ 1.24
CS-227ENST00000551441 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.78■■□□□ 1.24
CS-227ENST00000551441 QSER1Q2KHR3 1735 aa22.77■■□□□ 1.24
CS-227ENST00000551441 COG3Q96JB2 828 aa22.77■■□□□ 1.24
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CS-227ENST00000551441 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
CS-227ENST00000551441 SLC16A10Q8TF71 515 aa22.76■■□□□ 1.23
CS-227ENST00000551441 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
CS-227ENST00000551441 NSD2O96028 1365 aa22.76■■□□□ 1.23
CS-227ENST00000551441 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa22.76■■□□□ 1.23
CS-227ENST00000551441 MEGF6O75095 1541 aa22.75■■□□□ 1.23
CS-227ENST00000551441 LY75O60449 1722 aa22.74■■□□□ 1.23
CS-227ENST00000551441 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
CS-227ENST00000551441 MSL1Q68DK7 614 aa22.74■■□□□ 1.23
CS-227ENST00000551441 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
CS-227ENST00000551441 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.73■■□□□ 1.23
CS-227ENST00000551441 TONSLQ96HA7 1378 aa22.73■■□□□ 1.23
CS-227ENST00000551441 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.72■■□□□ 1.23
CS-227ENST00000551441 NBPF6Q5VWK0 638 aa22.72■■□□□ 1.23
CS-227ENST00000551441 NBPF4Q96M43 638 aa22.72■■□□□ 1.23
CS-227ENST00000551441 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
CS-227ENST00000551441 TESK2Q96S53 571 aa22.71■■□□□ 1.23
CS-227ENST00000551441 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.7■■□□□ 1.22
CS-227ENST00000551441 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
CS-227ENST00000551441 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP22.69■■□□□ 1.225e-10■□□□□ 9.3
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CS-227ENST00000551441 SMIM5Q71RC9 77 aa22.64■■□□□ 1.21
CS-227ENST00000551441 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.64■■□□□ 1.21
CS-227ENST00000551441 FYB1O15117 783 aa22.63■■□□□ 1.21
CS-227ENST00000551441 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.63■■□□□ 1.21
CS-227ENST00000551441 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.63■■□□□ 1.21
CS-227ENST00000551441 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
CS-227ENST00000551441 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.62■■□□□ 1.21
CS-227ENST00000551441 C5P01031 1676 aa22.62■■□□□ 1.21
CS-227ENST00000551441 RTL1A6NKG5 1358 aa22.6■■□□□ 1.21
CS-227ENST00000551441 CEP350Q5VT06 3117 aa22.59■■□□□ 1.21
CS-227ENST00000551441 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
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CS-227ENST00000551441 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.58■■□□□ 1.21
CS-227ENST00000551441 PALLDQ8WX93 1383 aa22.58■■□□□ 1.21
CS-227ENST00000551441 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.57■■□□□ 1.2
CS-227ENST00000551441 CYP27B1O15528 508 aa22.56■■□□□ 1.2
CS-227ENST00000551441 PHF14O94880 888 aa22.56■■□□□ 1.2
CS-227ENST00000551441 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
CS-227ENST00000551441 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.56■■□□□ 1.2
CS-227ENST00000551441 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.56■■□□□ 1.2
CS-227ENST00000551441 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.56■■□□□ 1.2
CS-227ENST00000551441 ITGB4P16144 1822 aa22.55■■□□□ 1.2
CS-227ENST00000551441 KIF20BQ96Q89 1820 aa22.55■■□□□ 1.2
CS-227ENST00000551441 ATP10DQ9P241 1426 aa22.55■■□□□ 1.2
CS-227ENST00000551441 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.55■■□□□ 1.2
CS-227ENST00000551441 TMF1P82094 1093 aa22.54■■□□□ 1.2
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CS-227ENST00000551441 FLT4P35916 1363 aa22.5■■□□□ 1.19
CS-227ENST00000551441 PIGBQ92521 554 aa22.5■■□□□ 1.19
CS-227ENST00000551441 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.49■■□□□ 1.19
CS-227ENST00000551441 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.48■■□□□ 1.19
CS-227ENST00000551441 UBR3Q6ZT12 1888 aa22.47■■□□□ 1.19
CS-227ENST00000551441 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
CS-227ENST00000551441 SLC24A1O60721 1099 aa22.47■■□□□ 1.19
CS-227ENST00000551441 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.47■■□□□ 1.19
CS-227ENST00000551441 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
CS-227ENST00000551441 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.47■■□□□ 1.19
CS-227ENST00000551441 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
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CS-227ENST00000551441 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.45■■□□□ 1.18
CS-227ENST00000551441 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.43■■□□□ 1.18
CS-227ENST00000551441 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.42■■□□□ 1.18
CS-227ENST00000551441 SIK1P57059 783 aa22.42■■□□□ 1.18
CS-227ENST00000551441 ITPK1Q13572 414 aa22.42■■□□□ 1.18
CS-227ENST00000551441 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CS-227ENST00000551441 GNPATO15228 680 aa22.41■■□□□ 1.18
CS-227ENST00000551441 EYA1Q99502 592 aa22.41■■□□□ 1.18
CS-227ENST00000551441 SPG7Q9UQ90 795 aa22.41■■□□□ 1.18
CS-227ENST00000551441 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
CS-227ENST00000551441 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.4■■□□□ 1.18
CS-227ENST00000551441 ADCY9O60503 1353 aa22.39■■□□□ 1.18
CS-227ENST00000551441 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.39■■□□□ 1.18
CS-227ENST00000551441 ATP6V1AP38606 617 aa22.39■■□□□ 1.17
CS-227ENST00000551441 IFFO2Q5TF58 517 aa22.39■■□□□ 1.17
CS-227ENST00000551441 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.39■■□□□ 1.17
CS-227ENST00000551441 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CS-227ENST00000551441 CDCA8Q53HL2 280 aa22.38■■□□□ 1.17
CS-227ENST00000551441 SSFA2P28290 1259 aa22.37■■□□□ 1.17
CS-227ENST00000551441 PHKG2P15735 406 aa22.36■■□□□ 1.17
CS-227ENST00000551441 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
CS-227ENST00000551441 ATG3Q9NT62 314 aa22.36■■□□□ 1.17
CS-227ENST00000551441 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.35■■□□□ 1.17
CS-227ENST00000551441 NCAPD2Q15021 1401 aa22.35■■□□□ 1.17
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