RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551155.1

CS-224, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-224ENST00000551155 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
CS-224ENST00000551155 USHBP1Q8N6Y0 703 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-224ENST00000551155 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-224ENST00000551155 NCAPD2Q15021 1401 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-224ENST00000551155 PARD3Q8TEW0 1356 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-224ENST00000551155 RGPD1P0DJD0 1748 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-224ENST00000551155 IL13P35225 146 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-224ENST00000551155 FAM182BQ5T319 152 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-224ENST00000551155 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
CS-224ENST00000551155 IGSF1Q8N6C5 1336 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-224ENST00000551155 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-224ENST00000551155 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
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CS-224ENST00000551155 MEGF6O75095 1541 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-224ENST00000551155 BCL9O00512 1426 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-224ENST00000551155 EP400Q96L91 3159 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-224ENST00000551155 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
CS-224ENST00000551155 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP12.56□□□□□ -0.43e-6■□□□□ 8.1
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CS-224ENST00000551155 PKD1L3Q7Z443 1732 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-224ENST00000551155 SHANK3Q9BYB0 1731 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-224ENST00000551155 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
CS-224ENST00000551155 SULT6B1Q6IMI4 303 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-224ENST00000551155 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-224ENST00000551155 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-224ENST00000551155 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
CS-224ENST00000551155 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
CS-224ENST00000551155 TRIM37O94972 964 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-224ENST00000551155 AMOTQ4VCS5 1084 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-224ENST00000551155 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
CS-224ENST00000551155 KDRP35968 1356 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-224ENST00000551155 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.41
CS-224ENST00000551155 BAG6P46379 1132 aa12.52□□□□□ -0.41
CS-224ENST00000551155 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.41
CS-224ENST00000551155 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.41
CS-224ENST00000551155 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.41
CS-224ENST00000551155 KAT6BQ8WYB5 2073 aa12.52□□□□□ -0.41
CS-224ENST00000551155 IFNL2Q8IZJ0 200 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-224ENST00000551155 NHSQ6T4R5 1651 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-224ENST00000551155 APBA3O96018 575 aa12.5□□□□□ -0.41
CS-224ENST00000551155 HMOX1P09601 288 aa12.5□□□□□ -0.41
CS-224ENST00000551155 AEBP1Q8IUX7 1158 aa12.5□□□□□ -0.41
CS-224ENST00000551155 DOT1LQ8TEK3 1739 aa12.49□□□□□ -0.41
CS-224ENST00000551155 ANP32CO43423 234 aa12.49□□□□□ -0.41
CS-224ENST00000551155 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
CS-224ENST00000551155 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
CS-224ENST00000551155 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP12.49□□□□□ -0.41
CS-224ENST00000551155 CYP27B1O15528 508 aa12.48□□□□□ -0.41
CS-224ENST00000551155 FCHSD2O94868 740 aa12.48□□□□□ -0.41
CS-224ENST00000551155 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
CS-224ENST00000551155 C1orf141Q5JVX7 400 aa12.48□□□□□ -0.41
CS-224ENST00000551155 ACSBG1Q96GR2 724 aa12.48□□□□□ -0.41
CS-224ENST00000551155 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
CS-224ENST00000551155 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
CS-224ENST00000551155 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa12.48□□□□□ -0.41
CS-224ENST00000551155 PLSCR1O15162 318 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-224ENST00000551155 NEFMP07197 916 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-224ENST00000551155 PHKG2P15735 406 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-224ENST00000551155 BTAF1O14981 1849 aa12.46□□□□□ -0.41
CS-224ENST00000551155 KCNQ2O43526 872 aa12.46□□□□□ -0.41
CS-224ENST00000551155 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
CS-224ENST00000551155 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.41
CS-224ENST00000551155 DEFB132Q7Z7B7 95 aa12.46□□□□□ -0.41
CS-224ENST00000551155 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.41
CS-224ENST00000551155 ITGB4P16144 1822 aa12.46□□□□□ -0.42
CS-224ENST00000551155 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
CS-224ENST00000551155 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
CS-224ENST00000551155 AKAP4Q5JQC9 854 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-224ENST00000551155 DCAF5Q96JK2 942 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-224ENST00000551155 RSPH6AQ9H0K4 717 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-224ENST00000551155 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
CS-224ENST00000551155 PRKAR2BP31323 418 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-224ENST00000551155 GAS2L2Q8NHY3 880 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-224ENST00000551155 CAMKK2Q96RR4 588 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-224ENST00000551155 SCN11AQ9UI33 1791 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-224ENST00000551155 ERVV-2B6SEH9 535 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-224ENST00000551155 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP12.43□□□□□ -0.42
CS-224ENST00000551155 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
CS-224ENST00000551155 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
CS-224ENST00000551155 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-224ENST00000551155 RREB1Q92766 1687 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-224ENST00000551155 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
CS-224ENST00000551155 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-224ENST00000551155 PTF1AQ7RTS3 328 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-224ENST00000551155 TMOD3Q9NYL9 352 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-224ENST00000551155 LY75O60449 1722 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-224ENST00000551155 GNAT3A8MTJ3 354 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-224ENST00000551155 CABP4P57796 275 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-224ENST00000551155 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
CS-224ENST00000551155 PHACTR3Q96KR7 559 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-224ENST00000551155 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa12.39□□□□□ -0.43
CS-224ENST00000551155 TXNRD1Q16881 649 aa12.39□□□□□ -0.43
CS-224ENST00000551155 NBPF14Q5TI25 921 aa12.39□□□□□ -0.43
CS-224ENST00000551155 PIGBQ92521 554 aa12.39□□□□□ -0.43
CS-224ENST00000551155 MAP3K5Q99683 1374 aa12.39□□□□□ -0.43
CS-224ENST00000551155 NUP188Q5SRE5 1749 aa12.39□□□□□ -0.43
CS-224ENST00000551155 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa12.38□□□□□ -0.43
CS-224ENST00000551155 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
CS-224ENST00000551155 SLC27A3Q5K4L6 730 aa12.38□□□□□ -0.43
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