RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544999.2

HOXD8-204, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,235 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-204ENST00000544999 POLKQ9UBT6 870 aa23.24■■□□□ 1.31
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HOXD8-204ENST00000544999 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
HOXD8-204ENST00000544999 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
HOXD8-204ENST00000544999 ACSBG1Q96GR2 724 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD8-204ENST00000544999 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa23.22■■□□□ 1.31
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HOXD8-204ENST00000544999 DOT1LQ8TEK3 1739 aa23.16■■□□□ 1.3
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HOXD8-204ENST00000544999 IL13P35225 146 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXD8-204ENST00000544999 MTHFSP49914 203 aa22.98■■□□□ 1.27
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HOXD8-204ENST00000544999 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
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HOXD8-204ENST00000544999 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.9■■□□□ 1.26
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HOXD8-204ENST00000544999 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXD8-204ENST00000544999 SIK1P57059 783 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXD8-204ENST00000544999 ATG3Q9NT62 314 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXD8-204ENST00000544999 C4BP0C0L5 1744 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXD8-204ENST00000544999 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXD8-204ENST00000544999 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.79■■□□□ 1.24
HOXD8-204ENST00000544999 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.79■■□□□ 1.24
HOXD8-204ENST00000544999 CABP4P57796 275 aa22.79■■□□□ 1.24
HOXD8-204ENST00000544999 CFAP53Q96M91 514 aa22.79■■□□□ 1.24
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