RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543656.1

RUSC1-AS1-204, RUSC1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RUSC1-AS1, Length 1,357 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ABCC6O95255 1503 aa23.23■■□□□ 1.31
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CGNL1Q0VF96 1302 aa23.23■■□□□ 1.31
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 NFAT5O94916 1531 aa23.22■■□□□ 1.31
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 FYB1O15117 783 aa23.22■■□□□ 1.31
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 KLHL34Q8N239 644 aa23.22■■□□□ 1.31
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 KCNH5Q8NCM2 988 aa23.2■■□□□ 1.3
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 LRRC4BQ9NT99 713 aa23.19■■□□□ 1.3
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 COL24A1Q17RW2 1714 aa23.19■■□□□ 1.3
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 NSD2O96028 1365 aa23.18■■□□□ 1.3
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 QSER1Q2KHR3 1735 aa23.18■■□□□ 1.3
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP23.17■■□□□ 1.3
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 USP31Q70CQ4 1352 aa23.16■■□□□ 1.3
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 KAT6BQ8WYB5 2073 aa23.16■■□□□ 1.3
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa23.16■■□□□ 1.3
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 NLGN2Q8NFZ4 835 aa23.14■■□□□ 1.3
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 AKT1S1Q96B36 256 aa23.14■■□□□ 1.29
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 NME9Q86XW9 330 aa23.13■■□□□ 1.29
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa23.12■■□□□ 1.29
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 POLD1P28340 1107 aa23.12■■□□□ 1.29
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 RALBP1Q15311 655 aa23.12■■□□□ 1.29
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 GGNBP2Q9H3C7 697 aa23.12■■□□□ 1.29
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ERBB3P21860 1342 aa23.1■■□□□ 1.29
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 LTN1O94822 1766 aa23.1■■□□□ 1.29
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ANP32CO43423 234 aa23.1■■□□□ 1.29
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 IL2RBP14784 551 aa23.1■■□□□ 1.29
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 SLC16A10Q8TF71 515 aa23.1■■□□□ 1.29
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 COG3Q96JB2 828 aa23.1■■□□□ 1.29
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 NLRP2Q9NX02 1062 aa23.1■■□□□ 1.29
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP23.09■■□□□ 1.29
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 KIF20BQ96Q89 1820 aa23.08■■□□□ 1.29
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 MORC1Q86VD1 984 aa23.08■■□□□ 1.29
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 USP54Q70EL1 1684 aa23.07■■□□□ 1.28
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 KCNQ4P56696 695 aa23.07■■□□□ 1.28
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa23.05■■□□□ 1.28
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 SLC27A3Q5K4L6 730 aa23.04■■□□□ 1.28
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa23.04■■□□□ 1.28
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ATP10DQ9P241 1426 aa23.04■■□□□ 1.28
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 LY75O60449 1722 aa23.01■■□□□ 1.27
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 DOT1LQ8TEK3 1739 aa23.01■■□□□ 1.27
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ANKRD24Q8TF21 1146 aa23.01■■□□□ 1.27
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 GRIN3BO60391 1043 aa23.01■■□□□ 1.27
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 PPP2R1AP30153 589 aa22.97■■□□□ 1.27
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 POLKQ9UBT6 870 aa22.95■■□□□ 1.26
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 MSL1Q68DK7 614 aa22.94■■□□□ 1.26
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 MIER1Q8N108 512 aa22.94■■□□□ 1.26
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 MSH5O43196 834 aa22.93■■□□□ 1.26
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 HSPA6P17066 643 aa22.93■■□□□ 1.26
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 FBLN1P23142 703 aa22.93■■□□□ 1.26
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ADCY9O60503 1353 aa22.92■■□□□ 1.26
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.91■■□□□ 1.26
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CCER2I3L3R5 266 aa22.91■■□□□ 1.26
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 MTHFSP49914 203 aa22.9■■□□□ 1.26
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 INSRP06213 1382 aa22.9■■□□□ 1.26
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.89■■□□□ 1.25
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 RGPD2P0DJD1 1756 aa22.88■■□□□ 1.25
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 C5P01031 1676 aa22.87■■□□□ 1.25
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.87■■□□□ 1.25
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 IP6K1Q92551 441 aa22.86■■□□□ 1.25
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.85■■□□□ 1.25
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 MEGF6O75095 1541 aa22.85■■□□□ 1.25
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 AMPHP49418 695 aa22.84■■□□□ 1.25
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.83■■□□□ 1.25
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 RTL1A6NKG5 1358 aa22.83■■□□□ 1.25
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 HOXC9P31274 260 aa22.82■■□□□ 1.24
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CFAP53Q96M91 514 aa22.82■■□□□ 1.24
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 FLT4P35916 1363 aa22.82■■□□□ 1.24
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.82■■□□□ 1.24
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CCDC184Q52MB2 194 aa22.79■■□□□ 1.24
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 KIF3CO14782 793 aa22.78■■□□□ 1.24
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.78■■□□□ 1.24
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.78■■□□□ 1.24
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.77■■□□□ 1.24
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 MRS2Q9HD23 443 aa22.76■■□□□ 1.23
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 C4BP0C0L5 1744 aa22.75■■□□□ 1.23
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 IL13P35225 146 aa22.75■■□□□ 1.23
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.75■■□□□ 1.23
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms