RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543088.5

TM7SF3-212, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 4

Gene TM7SF3, Length 601 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-212ENST00000543088 TATP17735 454 aaPredicted RBP34.17■■■■□ 3.06
TM7SF3-212ENST00000543088 NBPF14Q5TI25 921 aa34.17■■■■□ 3.06
TM7SF3-212ENST00000543088 PTF1AQ7RTS3 328 aa34.16■■■■□ 3.06
TM7SF3-212ENST00000543088 ACSBG1Q96GR2 724 aa34.15■■■■□ 3.06
TM7SF3-212ENST00000543088 SHANK3Q9BYB0 1731 aa34.15■■■■□ 3.06
TM7SF3-212ENST00000543088 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP34.14■■■■□ 3.06
TM7SF3-212ENST00000543088 KCNQ2O43526 872 aa34.12■■■■□ 3.05
TM7SF3-212ENST00000543088 NCAPD2Q15021 1401 aa34.11■■■■□ 3.05
TM7SF3-212ENST00000543088 KAT6BQ8WYB5 2073 aa34.1■■■■□ 3.05
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TM7SF3-212ENST00000543088 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa34.09■■■■□ 3.05
TM7SF3-212ENST00000543088 BTAF1O14981 1849 aa34.09■■■■□ 3.05
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TM7SF3-212ENST00000543088 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa34.08■■■■□ 3.05
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TM7SF3-212ENST00000543088 LRP5O75197 1615 aa34.05■■■■□ 3.04
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TM7SF3-212ENST00000543088 EYA1Q99502 592 aa34.05■■■■□ 3.04
TM7SF3-212ENST00000543088 PKD1L3Q7Z443 1732 aa34.04■■■■□ 3.04
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TM7SF3-212ENST00000543088 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP34.02■■■■□ 3.04
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TM7SF3-212ENST00000543088 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa33.99■■■■□ 3.03
TM7SF3-212ENST00000543088 PROM2Q8N271 834 aa33.99■■■■□ 3.03
TM7SF3-212ENST00000543088 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP33.97■■■■□ 3.03
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TM7SF3-212ENST00000543088 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa33.97■■■■□ 3.03
TM7SF3-212ENST00000543088 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP33.96■■■■□ 3.03
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TM7SF3-212ENST00000543088 STK32BQ9NY57 414 aa33.93■■■■□ 3.02
TM7SF3-212ENST00000543088 CYP27B1O15528 508 aa33.92■■■■□ 3.02
TM7SF3-212ENST00000543088 SLC27A3Q5K4L6 730 aa33.89■■■■□ 3.02
TM7SF3-212ENST00000543088 PAPPAQ13219 1627 aa33.86■■■■□ 3.01
TM7SF3-212ENST00000543088 MTHFSP49914 203 aa33.86■■■■□ 3.01
TM7SF3-212ENST00000543088 SLC15A2Q16348 729 aa33.86■■■■□ 3.01
TM7SF3-212ENST00000543088 LY75O60449 1722 aa33.85■■■■□ 3.01
TM7SF3-212ENST00000543088 IFNL2Q8IZJ0 200 aa33.85■■■■□ 3.01
TM7SF3-212ENST00000543088 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa33.84■■■■□ 3.01
TM7SF3-212ENST00000543088 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP33.84■■■■□ 3.01
TM7SF3-212ENST00000543088 IL13P35225 146 aa33.82■■■■□ 3
TM7SF3-212ENST00000543088 CASZ1Q86V15 1759 aa33.82■■■■□ 3
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TM7SF3-212ENST00000543088 ITGB4P16144 1822 aa33.81■■■■□ 3
TM7SF3-212ENST00000543088 AMOTQ4VCS5 1084 aa33.8■■■■□ 3
TM7SF3-212ENST00000543088 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa33.8■■■■□ 3
TM7SF3-212ENST00000543088 LRRC4BQ9NT99 713 aa33.8■■■■□ 3
TM7SF3-212ENST00000543088 SPON1Q9HCB6 807 aa33.79■■■■□ 3
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TM7SF3-212ENST00000543088 SULT6B1Q6IMI4 303 aa33.78■■■■□ 3
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TM7SF3-212ENST00000543088 ZNF827Q17R98 1081 aa33.71■■■□□ 2.99
TM7SF3-212ENST00000543088 QSER1Q2KHR3 1735 aa33.7■■■□□ 2.99
TM7SF3-212ENST00000543088 C1orf141Q5JVX7 400 aa33.7■■■□□ 2.99
TM7SF3-212ENST00000543088 PIGBQ92521 554 aa33.69■■■□□ 2.98
TM7SF3-212ENST00000543088 AKT1S1Q96B36 256 aa33.69■■■□□ 2.98
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TM7SF3-212ENST00000543088 KCNQ4P56696 695 aa33.68■■■□□ 2.98
TM7SF3-212ENST00000543088 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP33.68■■■□□ 2.98
TM7SF3-212ENST00000543088 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP33.68■■■□□ 2.98
TM7SF3-212ENST00000543088 CFAP53Q96M91 514 aa33.67■■■□□ 2.98
TM7SF3-212ENST00000543088 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP33.67■■■□□ 2.98
TM7SF3-212ENST00000543088 C5P01031 1676 aa33.67■■■□□ 2.98
TM7SF3-212ENST00000543088 ERVV-2B6SEH9 535 aa33.66■■■□□ 2.98
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TM7SF3-212ENST00000543088 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa33.65■■■□□ 2.98
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TM7SF3-212ENST00000543088 MTFR1LQ9H019 292 aa33.64■■■□□ 2.98
TM7SF3-212ENST00000543088 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP33.62■■■□□ 2.97
TM7SF3-212ENST00000543088 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa33.61■■■□□ 2.97
TM7SF3-212ENST00000543088 TAF1LQ8IZX4 1826 aa33.6■■■□□ 2.97
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TM7SF3-212ENST00000543088 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP33.58■■■□□ 2.97
TM7SF3-212ENST00000543088 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa33.57■■■□□ 2.97
TM7SF3-212ENST00000543088 PPP2R1AP30153 589 aa33.57■■■□□ 2.96
TM7SF3-212ENST00000543088 AKAP4Q5JQC9 854 aa33.57■■■□□ 2.96
TM7SF3-212ENST00000543088 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa33.56■■■□□ 2.96
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TM7SF3-212ENST00000543088 ASAP1Q9ULH1 1129 aa33.56■■■□□ 2.96
TM7SF3-212ENST00000543088 NUDCQ9Y266 331 aa33.55■■■□□ 2.96
TM7SF3-212ENST00000543088 C4BP0C0L5 1744 aa33.55■■■□□ 2.96
TM7SF3-212ENST00000543088 SCN11AQ9UI33 1791 aa33.54■■■□□ 2.96
TM7SF3-212ENST00000543088 PTGER2P43116 358 aa33.53■■■□□ 2.96
TM7SF3-212ENST00000543088 ATG3Q9NT62 314 aa33.53■■■□□ 2.96
TM7SF3-212ENST00000543088 FLAD1Q8NFF5 587 aa33.51■■■□□ 2.95
TM7SF3-212ENST00000543088 AK7Q96M32 723 aa33.51■■■□□ 2.95
TM7SF3-212ENST00000543088 MSH5O43196 834 aa33.49■■■□□ 2.95
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