RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533877.1

FAM220A-204, Transcript of family with sequence similarity 220 member A, humanhuman

TSL 4

Gene FAM220A, Length 579 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM220A-204ENST00000533877 SULT6B1Q6IMI4 303 aa37.27■■■■□ 3.56
FAM220A-204ENST00000533877 TRIM37O94972 964 aa37.26■■■■□ 3.56
FAM220A-204ENST00000533877 AEBP1Q8IUX7 1158 aa37.24■■■■□ 3.55
FAM220A-204ENST00000533877 SPG7Q9UQ90 795 aa37.23■■■■□ 3.55
FAM220A-204ENST00000533877 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP37.22■■■■□ 3.55
FAM220A-204ENST00000533877 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP37.21■■■■□ 3.55
FAM220A-204ENST00000533877 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP37.2■■■■□ 3.55
FAM220A-204ENST00000533877 BCL9O00512 1426 aa37.2■■■■□ 3.55
FAM220A-204ENST00000533877 NUDCQ9Y266 331 aa37.2■■■■□ 3.55
FAM220A-204ENST00000533877 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP37.19■■■■□ 3.54
FAM220A-204ENST00000533877 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa37.18■■■■□ 3.54
FAM220A-204ENST00000533877 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa37.18■■■■□ 3.54
FAM220A-204ENST00000533877 HMOX1P09601 288 aa37.18■■■■□ 3.54
FAM220A-204ENST00000533877 KDRP35968 1356 aa37.17■■■■□ 3.54
FAM220A-204ENST00000533877 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP37.16■■■■□ 3.54
FAM220A-204ENST00000533877 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP37.16■■■■□ 3.54
FAM220A-204ENST00000533877 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP37.15■■■■□ 3.54
FAM220A-204ENST00000533877 RGPD1P0DJD0 1748 aa37.14■■■■□ 3.54
FAM220A-204ENST00000533877 CYP27B1O15528 508 aa37.14■■■■□ 3.54
FAM220A-204ENST00000533877 APBA3O96018 575 aa37.13■■■■□ 3.53
FAM220A-204ENST00000533877 AMOTQ4VCS5 1084 aa37.13■■■■□ 3.53
FAM220A-204ENST00000533877 ACSBG1Q96GR2 724 aa37.13■■■■□ 3.53
FAM220A-204ENST00000533877 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa37.13■■■■□ 3.53
FAM220A-204ENST00000533877 BAG6P46379 1132 aa37.12■■■■□ 3.53
FAM220A-204ENST00000533877 DEFB132Q7Z7B7 95 aa37.12■■■■□ 3.53
FAM220A-204ENST00000533877 KCNQ2O43526 872 aa37.09■■■■□ 3.53
FAM220A-204ENST00000533877 PTF1AQ7RTS3 328 aa37.09■■■■□ 3.53
FAM220A-204ENST00000533877 IFNL2Q8IZJ0 200 aa37.09■■■■□ 3.53
FAM220A-204ENST00000533877 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP37.08■■■■□ 3.53
FAM220A-204ENST00000533877 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP37.08■■■■□ 3.53
FAM220A-204ENST00000533877 PHKG2P15735 406 aa37.06■■■■□ 3.52
FAM220A-204ENST00000533877 SHANK3Q9BYB0 1731 aa37.05■■■■□ 3.52
FAM220A-204ENST00000533877 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP37.05■■■■□ 3.52
FAM220A-204ENST00000533877 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP37.05■■■■□ 3.52
FAM220A-204ENST00000533877 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP37.04■■■■□ 3.52
FAM220A-204ENST00000533877 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP37.04■■■■□ 3.52
FAM220A-204ENST00000533877 PKD1L3Q7Z443 1732 aa37.04■■■■□ 3.52
FAM220A-204ENST00000533877 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP37.02■■■■□ 3.52
FAM220A-204ENST00000533877 ANP32CO43423 234 aa37.01■■■■□ 3.52
FAM220A-204ENST00000533877 SBF2Q86WG5 1849 aa37.01■■■■□ 3.51
FAM220A-204ENST00000533877 FCHSD2O94868 740 aa36.99■■■■□ 3.51
FAM220A-204ENST00000533877 C1orf141Q5JVX7 400 aa36.99■■■■□ 3.51
FAM220A-204ENST00000533877 RSPH6AQ9H0K4 717 aa36.99■■■■□ 3.51
FAM220A-204ENST00000533877 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP36.98■■■■□ 3.51
FAM220A-204ENST00000533877 CAMKK2Q96RR4 588 aa36.98■■■■□ 3.51
FAM220A-204ENST00000533877 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP36.98■■■■□ 3.51
FAM220A-204ENST00000533877 PLSCR1O15162 318 aa36.97■■■■□ 3.51
FAM220A-204ENST00000533877 PRKAR2BP31323 418 aa36.97■■■■□ 3.51
FAM220A-204ENST00000533877 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP36.96■■■■□ 3.51
FAM220A-204ENST00000533877 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP36.96■■■■□ 3.51
FAM220A-204ENST00000533877 DCAF5Q96JK2 942 aa36.93■■■■□ 3.5
FAM220A-204ENST00000533877 AKAP4Q5JQC9 854 aa36.92■■■■□ 3.5
FAM220A-204ENST00000533877 NHSQ6T4R5 1651 aa36.92■■■■□ 3.5
FAM220A-204ENST00000533877 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa36.91■■■■□ 3.5
FAM220A-204ENST00000533877 PHACTR3Q96KR7 559 aa36.91■■■■□ 3.5
FAM220A-204ENST00000533877 KAT6BQ8WYB5 2073 aa36.89■■■■□ 3.5
FAM220A-204ENST00000533877 GAS2L2Q8NHY3 880 aa36.89■■■■□ 3.5
FAM220A-204ENST00000533877 ERVV-2B6SEH9 535 aa36.87■■■■□ 3.49
FAM220A-204ENST00000533877 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP36.87■■■■□ 3.49
FAM220A-204ENST00000533877 DOT1LQ8TEK3 1739 aa36.86■■■■□ 3.49
FAM220A-204ENST00000533877 TMOD3Q9NYL9 352 aa36.85■■■■□ 3.49
FAM220A-204ENST00000533877 NEFMP07197 916 aa36.84■■■■□ 3.49
FAM220A-204ENST00000533877 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP36.84■■■■□ 3.49
FAM220A-204ENST00000533877 PIGBQ92521 554 aa36.84■■■■□ 3.49
FAM220A-204ENST00000533877 PROM2Q8N271 834 aa36.83■■■■□ 3.49
FAM220A-204ENST00000533877 CABP4P57796 275 aa36.81■■■■□ 3.48
FAM220A-204ENST00000533877 TXNRD1Q16881 649 aa36.81■■■■□ 3.48
FAM220A-204ENST00000533877 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP36.8■■■■□ 3.48
FAM220A-204ENST00000533877 PLEKHF1Q96S99 279 aa36.8■■■■□ 3.48
FAM220A-204ENST00000533877 LGR6Q9HBX8 967 aa36.8■■■■□ 3.48
FAM220A-204ENST00000533877 GNAT3A8MTJ3 354 aa36.79■■■■□ 3.48
FAM220A-204ENST00000533877 BTAF1O14981 1849 aa36.79■■■■□ 3.48
FAM220A-204ENST00000533877 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa36.77■■■■□ 3.48
FAM220A-204ENST00000533877 RNMTO43148 476 aaKnown RBP36.77■■■■□ 3.48
FAM220A-204ENST00000533877 CCDC184Q52MB2 194 aa36.76■■■■□ 3.48
FAM220A-204ENST00000533877 ADAMTS8Q9UP79 889 aa36.76■■■■□ 3.48
FAM220A-204ENST00000533877 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa36.75■■■■□ 3.47
FAM220A-204ENST00000533877 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP36.75■■■■□ 3.47
FAM220A-204ENST00000533877 MAP3K5Q99683 1374 aa36.75■■■■□ 3.47
FAM220A-204ENST00000533877 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa36.74■■■■□ 3.47
FAM220A-204ENST00000533877 NBPF14Q5TI25 921 aa36.72■■■■□ 3.47
FAM220A-204ENST00000533877 SLC27A3Q5K4L6 730 aa36.71■■■■□ 3.47
FAM220A-204ENST00000533877 IL17REQ8NFR9 667 aa36.71■■■■□ 3.47
FAM220A-204ENST00000533877 ASAP1Q9ULH1 1129 aa36.71■■■■□ 3.47
FAM220A-204ENST00000533877 ITGB4P16144 1822 aa36.71■■■■□ 3.47
FAM220A-204ENST00000533877 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP36.71■■■■□ 3.47
FAM220A-204ENST00000533877 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa36.71■■■■□ 3.47
FAM220A-204ENST00000533877 SLC52A2Q9HAB3 445 aa36.7■■■■□ 3.47
FAM220A-204ENST00000533877 MRS2Q9HD23 443 aa36.7■■■■□ 3.47
FAM220A-204ENST00000533877 ATG3Q9NT62 314 aa36.69■■■■□ 3.46
FAM220A-204ENST00000533877 PALLDQ8WX93 1383 aa36.68■■■■□ 3.46
FAM220A-204ENST00000533877 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP36.68■■■■□ 3.46
FAM220A-204ENST00000533877 NFE2L2Q16236 605 aa36.67■■■■□ 3.46
FAM220A-204ENST00000533877 LRRC4BQ9NT99 713 aa36.67■■■■□ 3.46
FAM220A-204ENST00000533877 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP36.66■■■■□ 3.46
FAM220A-204ENST00000533877 CCDC146Q8IYE0 955 aa36.66■■■■□ 3.46
FAM220A-204ENST00000533877 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP36.66■■■■□ 3.46
FAM220A-204ENST00000533877 RUNDC1Q96C34 613 aa36.65■■■■□ 3.46
FAM220A-204ENST00000533877 RREB1Q92766 1687 aa36.64■■■■□ 3.46
FAM220A-204ENST00000533877 KCNQ4P56696 695 aa36.64■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms