RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533170.1

AP003555.2-202, humanhuman

TSL 3

Gene AP003555.2, Length 369 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP003555.2-202ENST00000533170 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
AP003555.2-202ENST00000533170 SLC52A1Q9NWF4 448 aa7.32□□□□□ -1.24
AP003555.2-202ENST00000533170 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
AP003555.2-202ENST00000533170 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
AP003555.2-202ENST00000533170 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
AP003555.2-202ENST00000533170 IGBP1P78318 339 aa7.31□□□□□ -1.24
AP003555.2-202ENST00000533170 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
AP003555.2-202ENST00000533170 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
AP003555.2-202ENST00000533170 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
AP003555.2-202ENST00000533170 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
AP003555.2-202ENST00000533170 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
AP003555.2-202ENST00000533170 CEP126Q9P2H0 1117 aa7.31□□□□□ -1.24
AP003555.2-202ENST00000533170 WWC3Q9ULE0 1092 aa7.31□□□□□ -1.24
AP003555.2-202ENST00000533170 PPFIA4O75335 1185 aa7.3□□□□□ -1.24
AP003555.2-202ENST00000533170 KIF4AO95239 1232 aa7.3□□□□□ -1.24
AP003555.2-202ENST00000533170 POLD1P28340 1107 aa7.3□□□□□ -1.24
AP003555.2-202ENST00000533170 NBPF6Q5VWK0 638 aa7.3□□□□□ -1.24
AP003555.2-202ENST00000533170 DESI1Q6ICB0 168 aa7.3□□□□□ -1.24
AP003555.2-202ENST00000533170 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
AP003555.2-202ENST00000533170 SIRT1Q96EB6 747 aa7.3□□□□□ -1.24
AP003555.2-202ENST00000533170 NBPF4Q96M43 638 aa7.3□□□□□ -1.24
AP003555.2-202ENST00000533170 SPOCK3Q9BQ16 436 aa7.3□□□□□ -1.24
AP003555.2-202ENST00000533170 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
AP003555.2-202ENST00000533170 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa7.3□□□□□ -1.24
AP003555.2-202ENST00000533170 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa7.29□□□□□ -1.24
AP003555.2-202ENST00000533170 DXOO77932 396 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
AP003555.2-202ENST00000533170 MMP16P51512 607 aa7.29□□□□□ -1.24
AP003555.2-202ENST00000533170 KCNC4Q03721 635 aa7.29□□□□□ -1.24
AP003555.2-202ENST00000533170 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
AP003555.2-202ENST00000533170 AMOTL1Q8IY63 956 aa7.29□□□□□ -1.24
AP003555.2-202ENST00000533170 PNMA2Q9UL42 364 aa7.29□□□□□ -1.24
AP003555.2-202ENST00000533170 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
AP003555.2-202ENST00000533170 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
AP003555.2-202ENST00000533170 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
AP003555.2-202ENST00000533170 CTDSPL2Q05D32 466 aa7.28□□□□□ -1.24
AP003555.2-202ENST00000533170 NEUROD1Q13562 356 aa7.28□□□□□ -1.24
AP003555.2-202ENST00000533170 CLEC4GQ6UXB4 293 aa7.28□□□□□ -1.24
AP003555.2-202ENST00000533170 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
AP003555.2-202ENST00000533170 EGFL6Q8IUX8 553 aa7.28□□□□□ -1.24
AP003555.2-202ENST00000533170 PCGF6Q9BYE7 350 aa7.28□□□□□ -1.24
AP003555.2-202ENST00000533170 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
AP003555.2-202ENST00000533170 ABCF2Q9UG63 623 aa7.28□□□□□ -1.24
AP003555.2-202ENST00000533170 SWAP70Q9UH65 585 aa7.28□□□□□ -1.24
AP003555.2-202ENST00000533170 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 AP1G2O75843 785 aa7.27□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 S1PR4O95977 384 aa7.27□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 USP17L8P0C7I0 530 aa7.27□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 JUNDP17535 347 aa7.27□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 MCM6Q14566 821 aa7.27□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 TMEM259Q4ZIN3 620 aa7.27□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 IFFO2Q5TF58 517 aa7.27□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa7.27□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 CARD10Q9BWT7 1032 aa7.27□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 MAF1Q9H063 256 aa7.27□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa7.26□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 STK10O94804 968 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 SSFA2P28290 1259 aa7.26□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 LYPD8Q6UX82 237 aa7.26□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 MTMR14Q8NCE2 650 aa7.26□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 BANK1Q8NDB2 785 aa7.26□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 SENP7Q9BQF6 1050 aa7.26□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 SLC6A16Q9GZN6 736 aa7.26□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 SNRKQ9NRH2 765 aa7.26□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 USTQ9Y2C2 406 aa7.26□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 PAX3P23760 479 aa7.25□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 LRRN4Q8WUT4 740 aa7.25□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 RAI14Q9P0K7 980 aa7.25□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 MRVI1Q9Y6F6 885 aa7.25□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 GOLGA6CA6NDK9 693 aa7.24□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 GOLGA6BA6NDN3 693 aa7.24□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 SOCS7O14512 581 aa7.24□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 F12P00748 615 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 GOLGA6DP0CG33 693 aa7.24□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa7.24□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 PTPRNQ16849 979 aa7.24□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 TSC1Q92574 1164 aa7.24□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa7.24□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa7.24□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa7.24□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 PEX19P40855 299 aa7.23□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 MTA1Q13330 715 aa7.23□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 GIMAP6Q6P9H5 292 aa7.23□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 CREBRFQ8IUR6 639 aa7.23□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 SCYL1Q96KG9 808 aa7.23□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 TRIM34Q9BYJ4 488 aa7.23□□□□□ -1.25
AP003555.2-202ENST00000533170 YY1AP1Q9H869 796 aa7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms