RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533012.1

TRAPPC4-211, Transcript of trafficking protein particle complex 4, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC4, Length 817 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4-211ENST00000533012 NCAPD2Q15021 1401 aa14.98□□□□□ -0.01
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TRAPPC4-211ENST00000533012 IL17REQ8NFR9 667 aa14.8□□□□□ -0.04
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TRAPPC4-211ENST00000533012 PTF1AQ7RTS3 328 aa14.78□□□□□ -0.04
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TRAPPC4-211ENST00000533012 EP400Q96L91 3159 aa14.77□□□□□ -0.05
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TRAPPC4-211ENST00000533012 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC4-211ENST00000533012 TRIM35Q9UPQ4 493 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC4-211ENST00000533012 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC4-211ENST00000533012 DEFB132Q7Z7B7 95 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC4-211ENST00000533012 NGEFQ8N5V2 710 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC4-211ENST00000533012 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC4-211ENST00000533012 ATG3Q9NT62 314 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC4-211ENST00000533012 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC4-211ENST00000533012 BTBD11A6QL63 1104 aa14.72□□□□□ -0.05
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