RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527622.5

CTTN-211, Transcript of cortactin, humanhuman

TSL 4

Gene CTTN, Length 597 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTN-211ENST00000527622 PKD1L3Q7Z443 1732 aa26.22■■□□□ 1.79
CTTN-211ENST00000527622 NCAPD2Q15021 1401 aa26.22■■□□□ 1.79
CTTN-211ENST00000527622 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa26.21■■□□□ 1.79
CTTN-211ENST00000527622 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
CTTN-211ENST00000527622 SPON1Q9HCB6 807 aa26.2■■□□□ 1.78
CTTN-211ENST00000527622 SLC15A2Q16348 729 aa26.19■■□□□ 1.78
CTTN-211ENST00000527622 USHBP1Q8N6Y0 703 aa26.19■■□□□ 1.78
CTTN-211ENST00000527622 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
CTTN-211ENST00000527622 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa26.19■■□□□ 1.78
CTTN-211ENST00000527622 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa26.18■■□□□ 1.78
CTTN-211ENST00000527622 LRRC4BQ9NT99 713 aa26.17■■□□□ 1.78
CTTN-211ENST00000527622 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
CTTN-211ENST00000527622 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
CTTN-211ENST00000527622 STK32BQ9NY57 414 aa26.16■■□□□ 1.78
CTTN-211ENST00000527622 CGNL1Q0VF96 1302 aa26.14■■□□□ 1.78
CTTN-211ENST00000527622 ITGB4P16144 1822 aa26.14■■□□□ 1.78
CTTN-211ENST00000527622 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
CTTN-211ENST00000527622 UTRNP46939 3433 aa26.14■■□□□ 1.77
CTTN-211ENST00000527622 COL24A1Q17RW2 1714 aa26.14■■□□□ 1.77
CTTN-211ENST00000527622 PTGER2P43116 358 aa26.13■■□□□ 1.77
CTTN-211ENST00000527622 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.13■■□□□ 1.77
CTTN-211ENST00000527622 ZNF827Q17R98 1081 aa26.13■■□□□ 1.77
CTTN-211ENST00000527622 ZBTB7AO95365 584 aa26.11■■□□□ 1.77
CTTN-211ENST00000527622 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
CTTN-211ENST00000527622 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa26.09■■□□□ 1.77
CTTN-211ENST00000527622 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.09■■□□□ 1.77
CTTN-211ENST00000527622 AKT1S1Q96B36 256 aa26.08■■□□□ 1.77
CTTN-211ENST00000527622 SGIP1Q9BQI5 828 aa26.08■■□□□ 1.77
CTTN-211ENST00000527622 TAF1LQ8IZX4 1826 aa26.08■■□□□ 1.77
CTTN-211ENST00000527622 TATP17735 454 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
CTTN-211ENST00000527622 POLKQ9UBT6 870 aa26.07■■□□□ 1.76
CTTN-211ENST00000527622 SLC27A3Q5K4L6 730 aa26.06■■□□□ 1.76
CTTN-211ENST00000527622 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.06■■□□□ 1.76
CTTN-211ENST00000527622 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
CTTN-211ENST00000527622 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa26.06■■□□□ 1.76
CTTN-211ENST00000527622 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa26.06■■□□□ 1.76
CTTN-211ENST00000527622 C5P01031 1676 aa26.06■■□□□ 1.76
CTTN-211ENST00000527622 CYP27B1O15528 508 aa26.05■■□□□ 1.76
CTTN-211ENST00000527622 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
CTTN-211ENST00000527622 MTFR1LQ9H019 292 aa26.04■■□□□ 1.76
CTTN-211ENST00000527622 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
CTTN-211ENST00000527622 KCNQ4P56696 695 aa26.03■■□□□ 1.76
CTTN-211ENST00000527622 PANK3Q9H999 370 aa26.02■■□□□ 1.76
CTTN-211ENST00000527622 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
CTTN-211ENST00000527622 EYA1Q99502 592 aa26.01■■□□□ 1.75
CTTN-211ENST00000527622 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa26■■□□□ 1.75
CTTN-211ENST00000527622 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
CTTN-211ENST00000527622 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
CTTN-211ENST00000527622 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
CTTN-211ENST00000527622 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
CTTN-211ENST00000527622 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
CTTN-211ENST00000527622 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa25.95■■□□□ 1.74
CTTN-211ENST00000527622 IGSF1Q8N6C5 1336 aa25.93■■□□□ 1.74
CTTN-211ENST00000527622 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
CTTN-211ENST00000527622 UBR3Q6ZT12 1888 aa25.93■■□□□ 1.74
CTTN-211ENST00000527622 PALLDQ8WX93 1383 aa25.93■■□□□ 1.74
CTTN-211ENST00000527622 MAP3K5Q99683 1374 aa25.93■■□□□ 1.74
CTTN-211ENST00000527622 C4BP0C0L5 1744 aa25.92■■□□□ 1.74
CTTN-211ENST00000527622 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP25.92■■□□□ 1.744e-28■□□□□ 9.1
CTTN-211ENST00000527622 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.9■■□□□ 1.74
CTTN-211ENST00000527622 SLC16A10Q8TF71 515 aa25.9■■□□□ 1.74
CTTN-211ENST00000527622 SYT17Q9BSW7 474 aa25.9■■□□□ 1.74
CTTN-211ENST00000527622 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa25.89■■□□□ 1.74
CTTN-211ENST00000527622 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa25.89■■□□□ 1.74
CTTN-211ENST00000527622 SPG7Q9UQ90 795 aa25.89■■□□□ 1.74
CTTN-211ENST00000527622 ARXQ96QS3 562 aa25.88■■□□□ 1.73
CTTN-211ENST00000527622 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
CTTN-211ENST00000527622 PIGBQ92521 554 aa25.87■■□□□ 1.73
CTTN-211ENST00000527622 CHD4Q14839 1912 aa25.86■■□□□ 1.73
CTTN-211ENST00000527622 PHKG2P15735 406 aa25.86■■□□□ 1.73
CTTN-211ENST00000527622 MORC1Q86VD1 984 aa25.83■■□□□ 1.73
CTTN-211ENST00000527622 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
CTTN-211ENST00000527622 IFNL2Q8IZJ0 200 aa25.82■■□□□ 1.72
CTTN-211ENST00000527622 ZNF831Q5JPB2 1677 aa25.82■■□□□ 1.72
CTTN-211ENST00000527622 AMIGO3Q86WK7 504 aa25.81■■□□□ 1.72
CTTN-211ENST00000527622 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
CTTN-211ENST00000527622 KNSTRNQ9Y448 316 aa25.81■■□□□ 1.72
CTTN-211ENST00000527622 KDRP35968 1356 aa25.81■■□□□ 1.72
CTTN-211ENST00000527622 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
CTTN-211ENST00000527622 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
CTTN-211ENST00000527622 AEBP1Q8IUX7 1158 aa25.8■■□□□ 1.72
CTTN-211ENST00000527622 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
CTTN-211ENST00000527622 YY1P25490 414 aa25.79■■□□□ 1.72
CTTN-211ENST00000527622 SCN11AQ9UI33 1791 aa25.78■■□□□ 1.72
CTTN-211ENST00000527622 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
CTTN-211ENST00000527622 TMOD3Q9NYL9 352 aa25.77■■□□□ 1.72
CTTN-211ENST00000527622 ASAP1Q9ULH1 1129 aa25.77■■□□□ 1.72
CTTN-211ENST00000527622 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa25.76■■□□□ 1.71
CTTN-211ENST00000527622 POLD1P28340 1107 aa25.76■■□□□ 1.71
CTTN-211ENST00000527622 SIK1P57059 783 aa25.76■■□□□ 1.71
CTTN-211ENST00000527622 DCAF8L1A6NGE4 600 aa25.75■■□□□ 1.71
CTTN-211ENST00000527622 IL13P35225 146 aa25.75■■□□□ 1.71
CTTN-211ENST00000527622 LINC00116Q8NCU8 138 aa25.75■■□□□ 1.71
CTTN-211ENST00000527622 ITPK1Q13572 414 aa25.74■■□□□ 1.71
CTTN-211ENST00000527622 ATG3Q9NT62 314 aa25.74■■□□□ 1.71
CTTN-211ENST00000527622 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
CTTN-211ENST00000527622 MSL1Q68DK7 614 aa25.72■■□□□ 1.71
CTTN-211ENST00000527622 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
CTTN-211ENST00000527622 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
CTTN-211ENST00000527622 SMIM5Q71RC9 77 aa25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.2 ms