RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527375.5

BRMS1-205, Transcript of BRMS1, transcriptional repressor and anoikis regulator, humanhuman

TSL 3

Gene BRMS1, Length 913 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1-205ENST00000527375 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
BRMS1-205ENST00000527375 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
BRMS1-205ENST00000527375 DOT1LQ8TEK3 1739 aa20.59■□□□□ 0.89
BRMS1-205ENST00000527375 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
BRMS1-205ENST00000527375 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.89
BRMS1-205ENST00000527375 ITGB4P16144 1822 aa20.58■□□□□ 0.89
BRMS1-205ENST00000527375 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
BRMS1-205ENST00000527375 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
BRMS1-205ENST00000527375 NUDCQ9Y266 331 aa20.58■□□□□ 0.89
BRMS1-205ENST00000527375 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
BRMS1-205ENST00000527375 SULT6B1Q6IMI4 303 aa20.57■□□□□ 0.88
BRMS1-205ENST00000527375 CCDC125Q86Z20 511 aa20.57■□□□□ 0.88
BRMS1-205ENST00000527375 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
BRMS1-205ENST00000527375 SPG7Q9UQ90 795 aa20.56■□□□□ 0.88
BRMS1-205ENST00000527375 NHSQ6T4R5 1651 aa20.56■□□□□ 0.88
BRMS1-205ENST00000527375 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa20.55■□□□□ 0.88
BRMS1-205ENST00000527375 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa20.55■□□□□ 0.88
BRMS1-205ENST00000527375 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
BRMS1-205ENST00000527375 BTAF1O14981 1849 aa20.55■□□□□ 0.88
BRMS1-205ENST00000527375 TRIM37O94972 964 aa20.53■□□□□ 0.88
BRMS1-205ENST00000527375 HMOX1P09601 288 aa20.53■□□□□ 0.88
BRMS1-205ENST00000527375 AEBP1Q8IUX7 1158 aa20.53■□□□□ 0.88
BRMS1-205ENST00000527375 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa20.53■□□□□ 0.88
BRMS1-205ENST00000527375 EP400Q96L91 3159 aa20.53■□□□□ 0.88
BRMS1-205ENST00000527375 KDRP35968 1356 aa20.52■□□□□ 0.88
BRMS1-205ENST00000527375 ANP32CO43423 234 aa20.52■□□□□ 0.88
BRMS1-205ENST00000527375 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
BRMS1-205ENST00000527375 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP20.52■□□□□ 0.88
BRMS1-205ENST00000527375 SCN11AQ9UI33 1791 aa20.51■□□□□ 0.87
BRMS1-205ENST00000527375 BCL9O00512 1426 aa20.51■□□□□ 0.87
BRMS1-205ENST00000527375 DLG5Q8TDM6 1919 aa20.51■□□□□ 0.87
BRMS1-205ENST00000527375 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
BRMS1-205ENST00000527375 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.87
BRMS1-205ENST00000527375 AMOTQ4VCS5 1084 aa20.49■□□□□ 0.87
BRMS1-205ENST00000527375 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
BRMS1-205ENST00000527375 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa20.49■□□□□ 0.87
BRMS1-205ENST00000527375 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa20.48■□□□□ 0.87
BRMS1-205ENST00000527375 BAG6P46379 1132 aa20.48■□□□□ 0.87
BRMS1-205ENST00000527375 ACSBG1Q96GR2 724 aa20.48■□□□□ 0.87
BRMS1-205ENST00000527375 IFNL2Q8IZJ0 200 aa20.47■□□□□ 0.87
BRMS1-205ENST00000527375 CYP27B1O15528 508 aa20.46■□□□□ 0.87
BRMS1-205ENST00000527375 C1orf141Q5JVX7 400 aa20.46■□□□□ 0.87
BRMS1-205ENST00000527375 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
BRMS1-205ENST00000527375 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
BRMS1-205ENST00000527375 APBA3O96018 575 aa20.45■□□□□ 0.86
BRMS1-205ENST00000527375 NEFMP07197 916 aa20.45■□□□□ 0.86
BRMS1-205ENST00000527375 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
BRMS1-205ENST00000527375 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
BRMS1-205ENST00000527375 PHKG2P15735 406 aa20.43■□□□□ 0.86
BRMS1-205ENST00000527375 RREB1Q92766 1687 aa20.42■□□□□ 0.86
BRMS1-205ENST00000527375 FCHSD2O94868 740 aa20.42■□□□□ 0.86
BRMS1-205ENST00000527375 PRKAR2BP31323 418 aa20.42■□□□□ 0.86
BRMS1-205ENST00000527375 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP20.42■□□□□ 0.86
BRMS1-205ENST00000527375 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
BRMS1-205ENST00000527375 KCNQ2O43526 872 aa20.41■□□□□ 0.86
BRMS1-205ENST00000527375 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
BRMS1-205ENST00000527375 DEFB132Q7Z7B7 95 aa20.41■□□□□ 0.86
BRMS1-205ENST00000527375 RSPH6AQ9H0K4 717 aa20.41■□□□□ 0.86
BRMS1-205ENST00000527375 LY75O60449 1722 aa20.4■□□□□ 0.86
BRMS1-205ENST00000527375 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
BRMS1-205ENST00000527375 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
BRMS1-205ENST00000527375 NUP188Q5SRE5 1749 aa20.39■□□□□ 0.85
BRMS1-205ENST00000527375 AKAP4Q5JQC9 854 aa20.38■□□□□ 0.85
BRMS1-205ENST00000527375 GAS2L2Q8NHY3 880 aa20.38■□□□□ 0.85
BRMS1-205ENST00000527375 DCAF5Q96JK2 942 aa20.38■□□□□ 0.85
BRMS1-205ENST00000527375 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
BRMS1-205ENST00000527375 PTF1AQ7RTS3 328 aa20.37■□□□□ 0.85
BRMS1-205ENST00000527375 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa20.36■□□□□ 0.85
BRMS1-205ENST00000527375 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa20.36■□□□□ 0.85
BRMS1-205ENST00000527375 TAF1LQ8IZX4 1826 aa20.35■□□□□ 0.85
BRMS1-205ENST00000527375 PLSCR1O15162 318 aa20.35■□□□□ 0.85
BRMS1-205ENST00000527375 TMOD3Q9NYL9 352 aa20.35■□□□□ 0.85
BRMS1-205ENST00000527375 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa20.35■□□□□ 0.85
BRMS1-205ENST00000527375 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
BRMS1-205ENST00000527375 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
BRMS1-205ENST00000527375 PHACTR3Q96KR7 559 aa20.34■□□□□ 0.85
BRMS1-205ENST00000527375 MAP3K5Q99683 1374 aa20.34■□□□□ 0.85
BRMS1-205ENST00000527375 GNAT3A8MTJ3 354 aa20.33■□□□□ 0.85
BRMS1-205ENST00000527375 ERVV-2B6SEH9 535 aa20.33■□□□□ 0.85
BRMS1-205ENST00000527375 MRS2Q9HD23 443 aa20.33■□□□□ 0.85
BRMS1-205ENST00000527375 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
BRMS1-205ENST00000527375 CABP4P57796 275 aa20.32■□□□□ 0.84
BRMS1-205ENST00000527375 CAMKK2Q96RR4 588 aa20.32■□□□□ 0.84
BRMS1-205ENST00000527375 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
BRMS1-205ENST00000527375 C5P01031 1676 aa20.29■□□□□ 0.84
BRMS1-205ENST00000527375 RNMTO43148 476 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
BRMS1-205ENST00000527375 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
BRMS1-205ENST00000527375 PIGBQ92521 554 aa20.29■□□□□ 0.84
BRMS1-205ENST00000527375 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
BRMS1-205ENST00000527375 ADAMTS8Q9UP79 889 aa20.29■□□□□ 0.84
BRMS1-205ENST00000527375 CCDC184Q52MB2 194 aa20.28■□□□□ 0.84
BRMS1-205ENST00000527375 PLEKHF1Q96S99 279 aa20.28■□□□□ 0.84
BRMS1-205ENST00000527375 TXNRD1Q16881 649 aa20.27■□□□□ 0.84
BRMS1-205ENST00000527375 CCDC146Q8IYE0 955 aa20.27■□□□□ 0.84
BRMS1-205ENST00000527375 LGR6Q9HBX8 967 aa20.27■□□□□ 0.84
BRMS1-205ENST00000527375 MRC1P22897 1456 aa20.26■□□□□ 0.83
BRMS1-205ENST00000527375 TEFQ10587 303 aa20.26■□□□□ 0.83
BRMS1-205ENST00000527375 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa20.26■□□□□ 0.83
BRMS1-205ENST00000527375 RUNDC1Q96C34 613 aa20.26■□□□□ 0.83
BRMS1-205ENST00000527375 PAPPAQ13219 1627 aa20.26■□□□□ 0.83
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