RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524699.5

BRMS1-203, Transcript of BRMS1, transcriptional repressor and anoikis regulator, humanhuman

TSL 3

Gene BRMS1, Length 1,131 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1-203ENST00000524699 NBPF6Q5VWK0 638 aa21■□□□□ 0.95
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BRMS1-203ENST00000524699 NBPF4Q96M43 638 aa21■□□□□ 0.95
BRMS1-203ENST00000524699 UTRNP46939 3433 aa21■□□□□ 0.95
BRMS1-203ENST00000524699 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
BRMS1-203ENST00000524699 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
BRMS1-203ENST00000524699 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
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BRMS1-203ENST00000524699 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa20.81■□□□□ 0.92
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BRMS1-203ENST00000524699 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
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BRMS1-203ENST00000524699 WASHC2AQ641Q2 1341 aa20.75■□□□□ 0.91
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BRMS1-203ENST00000524699 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
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BRMS1-203ENST00000524699 SPG7Q9UQ90 795 aa20.67■□□□□ 0.9
BRMS1-203ENST00000524699 PHKG2P15735 406 aa20.66■□□□□ 0.9
BRMS1-203ENST00000524699 ITPK1Q13572 414 aa20.66■□□□□ 0.9
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BRMS1-203ENST00000524699 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa20.64■□□□□ 0.89
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BRMS1-203ENST00000524699 IGSF1Q8N6C5 1336 aa20.63■□□□□ 0.89
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BRMS1-203ENST00000524699 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
BRMS1-203ENST00000524699 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
BRMS1-203ENST00000524699 AEBP1Q8IUX7 1158 aa20.62■□□□□ 0.89
BRMS1-203ENST00000524699 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
BRMS1-203ENST00000524699 IFNL2Q8IZJ0 200 aa20.61■□□□□ 0.89
BRMS1-203ENST00000524699 SLC4A9Q96Q91 983 aa20.61■□□□□ 0.89
BRMS1-203ENST00000524699 ATG3Q9NT62 314 aa20.61■□□□□ 0.89
BRMS1-203ENST00000524699 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP20.61■□□□□ 0.89
BRMS1-203ENST00000524699 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
BRMS1-203ENST00000524699 KDRP35968 1356 aa20.6■□□□□ 0.89
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