RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523133.1

MSC-AS1-209, MSC antisense RNA 1, human

TSL 3

Gene MSC-AS1, Length 494 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSC-AS1-209	ENST00000523133	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	6.82	□□□□□ -1.32
MSC-AS1-209	ENST00000523133	AVP	P01185	164 aa		6.82	□□□□□ -1.32
MSC-AS1-209	ENST00000523133		Q3C1V9	767 aa		6.82	□□□□□ -1.32
MSC-AS1-209	ENST00000523133	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		6.82	□□□□□ -1.32
MSC-AS1-209	ENST00000523133	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	6.82	□□□□□ -1.32
MSC-AS1-209	ENST00000523133	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	6.82	□□□□□ -1.32
MSC-AS1-209	ENST00000523133	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		6.82	□□□□□ -1.32
MSC-AS1-209	ENST00000523133	IQGAP2	Q13576	1575 aa		6.82	□□□□□ -1.32
MSC-AS1-209	ENST00000523133	TRIM32	Q13049	653 aa		6.81	□□□□□ -1.32
MSC-AS1-209	ENST00000523133	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	6.81	□□□□□ -1.32
MSC-AS1-209	ENST00000523133	CYP4X1	Q8N118	509 aa		6.81	□□□□□ -1.32
MSC-AS1-209	ENST00000523133	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	6.81	□□□□□ -1.32
MSC-AS1-209	ENST00000523133	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		6.81	□□□□□ -1.32
MSC-AS1-209	ENST00000523133	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	6.8	□□□□□ -1.32
MSC-AS1-209	ENST00000523133	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		6.8	□□□□□ -1.32
MSC-AS1-209	ENST00000523133	MROH2A	A6NES4	1674 aa		6.8	□□□□□ -1.32
MSC-AS1-209	ENST00000523133	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		6.79	□□□□□ -1.32
MSC-AS1-209	ENST00000523133	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		6.79	□□□□□ -1.32
MSC-AS1-209	ENST00000523133	WNT7A	O00755	349 aa		6.79	□□□□□ -1.32
MSC-AS1-209	ENST00000523133	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	6.79	□□□□□ -1.32
MSC-AS1-209	ENST00000523133	BAG6	P46379	1132 aa		6.79	□□□□□ -1.32
MSC-AS1-209	ENST00000523133	USP46	P62068	366 aa		6.79	□□□□□ -1.32
MSC-AS1-209	ENST00000523133	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		6.79	□□□□□ -1.32
MSC-AS1-209	ENST00000523133	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		6.79	□□□□□ -1.32
MSC-AS1-209	ENST00000523133	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		6.78	□□□□□ -1.32
MSC-AS1-209	ENST00000523133	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	6.78	□□□□□ -1.32
MSC-AS1-209	ENST00000523133	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	6.78	□□□□□ -1.32
MSC-AS1-209	ENST00000523133	SMPD1	P17405	629 aa		6.78	□□□□□ -1.32
MSC-AS1-209	ENST00000523133	CLCN1	P35523	988 aa		6.78	□□□□□ -1.32
MSC-AS1-209	ENST00000523133	SKOR1	P84550	965 aa		6.78	□□□□□ -1.32
MSC-AS1-209	ENST00000523133	LCE2A	Q5TA79	106 aa	Predicted RBP	6.78	□□□□□ -1.32
MSC-AS1-209	ENST00000523133	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		6.78	□□□□□ -1.32
MSC-AS1-209	ENST00000523133		J3QL48	77 aa		6.77	□□□□□ -1.33
MSC-AS1-209	ENST00000523133	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	6.77	□□□□□ -1.33
MSC-AS1-209	ENST00000523133	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		6.77	□□□□□ -1.33
MSC-AS1-209	ENST00000523133	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	6.77	□□□□□ -1.33
MSC-AS1-209	ENST00000523133	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		6.77	□□□□□ -1.33
MSC-AS1-209	ENST00000523133	UNC13B	O14795	1591 aa		6.77	□□□□□ -1.33
MSC-AS1-209	ENST00000523133	ABCC1	P33527	1531 aa		6.76	□□□□□ -1.33
MSC-AS1-209	ENST00000523133	AGL	P35573	1532 aa		6.76	□□□□□ -1.33
MSC-AS1-209	ENST00000523133	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	6.76	□□□□□ -1.33
MSC-AS1-209	ENST00000523133	AXIN1	O15169	862 aa		6.76	□□□□□ -1.33
MSC-AS1-209	ENST00000523133	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	6.76	□□□□□ -1.33
MSC-AS1-209	ENST00000523133	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		6.76	□□□□□ -1.33
MSC-AS1-209	ENST00000523133	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	6.76	□□□□□ -1.33
MSC-AS1-209	ENST00000523133	KIF14	Q15058	1648 aa		6.76	□□□□□ -1.33
MSC-AS1-209	ENST00000523133	ATP10B	O94823	1461 aa		6.75	□□□□□ -1.33
MSC-AS1-209	ENST00000523133	ZMYM3	Q14202	1370 aa		6.75	□□□□□ -1.33
MSC-AS1-209	ENST00000523133	JUND	P17535	347 aa		6.75	□□□□□ -1.33
MSC-AS1-209	ENST00000523133	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		6.75	□□□□□ -1.33
MSC-AS1-209	ENST00000523133	SNIP1	Q8TAD8	396 aa	Known RBP	6.75	□□□□□ -1.33
MSC-AS1-209	ENST00000523133	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		6.75	□□□□□ -1.33
MSC-AS1-209	ENST00000523133	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		6.75	□□□□□ -1.33
MSC-AS1-209	ENST00000523133	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		6.75	□□□□□ -1.33
MSC-AS1-209	ENST00000523133	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	6.74	□□□□□ -1.33
MSC-AS1-209	ENST00000523133	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		6.74	□□□□□ -1.33
MSC-AS1-209	ENST00000523133	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	6.74	□□□□□ -1.33
MSC-AS1-209	ENST00000523133	SPON1	Q9HCB6	807 aa		6.74	□□□□□ -1.33
MSC-AS1-209	ENST00000523133	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	6.74	□□□□□ -1.33
MSC-AS1-209	ENST00000523133	PCNT	O95613	3336 aa		6.73	□□□□□ -1.33
MSC-AS1-209	ENST00000523133	DEPDC5	O75140	1603 aa		6.73	□□□□□ -1.33
MSC-AS1-209	ENST00000523133	TMEM94	Q12767	1356 aa		6.73	□□□□□ -1.33
MSC-AS1-209	ENST00000523133	ZMYND10	O75800	440 aa		6.73	□□□□□ -1.33
MSC-AS1-209	ENST00000523133	ADAMTS2	O95450	1211 aa		6.73	□□□□□ -1.33
MSC-AS1-209	ENST00000523133	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	6.73	□□□□□ -1.33
MSC-AS1-209	ENST00000523133	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	6.73	□□□□□ -1.33
MSC-AS1-209	ENST00000523133	RETREG3	Q86VR2	466 aa		6.73	□□□□□ -1.33
MSC-AS1-209	ENST00000523133	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		6.73	□□□□□ -1.33
MSC-AS1-209	ENST00000523133	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		6.73	□□□□□ -1.33
MSC-AS1-209	ENST00000523133	HPS1	Q92902	700 aa		6.73	□□□□□ -1.33
MSC-AS1-209	ENST00000523133	USP21	Q9UK80	565 aa		6.73	□□□□□ -1.33
MSC-AS1-209	ENST00000523133	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		6.73	□□□□□ -1.33
MSC-AS1-209	ENST00000523133	FAM83G	A6ND36	823 aa		6.72	□□□□□ -1.33
MSC-AS1-209	ENST00000523133	DLL1	O00548	723 aa		6.72	□□□□□ -1.33
MSC-AS1-209	ENST00000523133	FDX1	P10109	184 aa		6.72	□□□□□ -1.33
MSC-AS1-209	ENST00000523133	NDUFV2	P19404	249 aa		6.72	□□□□□ -1.33
MSC-AS1-209	ENST00000523133	TREML4	Q6UXN2	200 aa		6.72	□□□□□ -1.33
MSC-AS1-209	ENST00000523133	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		6.72	□□□□□ -1.33
MSC-AS1-209	ENST00000523133	BCL11A	Q9H165	835 aa		6.72	□□□□□ -1.33
MSC-AS1-209	ENST00000523133	CLIP1	P30622	1438 aa		6.72	□□□□□ -1.33
MSC-AS1-209	ENST00000523133	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		6.72	□□□□□ -1.33
MSC-AS1-209	ENST00000523133	MED14	O60244	1454 aa		6.72	□□□□□ -1.33
MSC-AS1-209	ENST00000523133	ABCA6	Q8N139	1617 aa		6.72	□□□□□ -1.33
MSC-AS1-209	ENST00000523133	WNT7B	P56706	349 aa		6.71	□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209	ENST00000523133	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		6.71	□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209	ENST00000523133	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	6.71	□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209	ENST00000523133	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		6.71	□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209	ENST00000523133	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		6.71	□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209	ENST00000523133	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		6.71	□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209	ENST00000523133	MAP3K1	Q13233	1512 aa		6.71	□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209	ENST00000523133	PLCH2	O75038	1416 aa		6.7	□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209	ENST00000523133	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	6.7	□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209	ENST00000523133	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		6.7	□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209	ENST00000523133	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	6.7	□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209	ENST00000523133	AMHR2	Q16671	573 aa		6.7	□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209	ENST00000523133	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	6.7	□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209	ENST00000523133	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	6.7	□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209	ENST00000523133	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	6.7	□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209	ENST00000523133	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	6.7	□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209	ENST00000523133	USP19	O94966	1318 aa		6.7	□□□□□ -1.34

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