RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517351.5

TCEA1-202, Transcript of transcription elongation factor A1, humanhuman

TSL 4

Gene TCEA1, Length 539 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1-202ENST00000517351 KCNQ2O43526 872 aa34.93■■■■□ 3.18
TCEA1-202ENST00000517351 NHSQ6T4R5 1651 aa34.92■■■■□ 3.18
TCEA1-202ENST00000517351 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP34.92■■■■□ 3.18
TCEA1-202ENST00000517351 EYA1Q99502 592 aa34.92■■■■□ 3.18
TCEA1-202ENST00000517351 SHANK3Q9BYB0 1731 aa34.92■■■■□ 3.18
TCEA1-202ENST00000517351 NCAPD2Q15021 1401 aa34.91■■■■□ 3.18
TCEA1-202ENST00000517351 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP34.9■■■■□ 3.18
TCEA1-202ENST00000517351 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP34.9■■■■□ 3.18
TCEA1-202ENST00000517351 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa34.9■■■■□ 3.18
TCEA1-202ENST00000517351 NUP188Q5SRE5 1749 aa34.87■■■■□ 3.17
TCEA1-202ENST00000517351 KAT6BQ8WYB5 2073 aa34.87■■■■□ 3.17
TCEA1-202ENST00000517351 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP34.87■■■■□ 3.17
TCEA1-202ENST00000517351 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa34.84■■■■□ 3.17
TCEA1-202ENST00000517351 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP34.83■■■■□ 3.17
TCEA1-202ENST00000517351 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa34.82■■■■□ 3.17
TCEA1-202ENST00000517351 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa34.82■■■■□ 3.17
TCEA1-202ENST00000517351 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP34.81■■■■□ 3.16
TCEA1-202ENST00000517351 NBPF14Q5TI25 921 aa34.81■■■■□ 3.16
TCEA1-202ENST00000517351 BTAF1O14981 1849 aa34.8■■■■□ 3.16
TCEA1-202ENST00000517351 DOT1LQ8TEK3 1739 aa34.8■■■■□ 3.16
TCEA1-202ENST00000517351 IGSF1Q8N6C5 1336 aa34.8■■■■□ 3.16
TCEA1-202ENST00000517351 PKD1L3Q7Z443 1732 aa34.79■■■■□ 3.16
TCEA1-202ENST00000517351 PROM2Q8N271 834 aa34.78■■■■□ 3.16
TCEA1-202ENST00000517351 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP34.78■■■■□ 3.16
TCEA1-202ENST00000517351 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP34.77■■■■□ 3.16
TCEA1-202ENST00000517351 MTHFSP49914 203 aa34.77■■■■□ 3.16
TCEA1-202ENST00000517351 TXNRD1Q16881 649 aa34.77■■■■□ 3.16
TCEA1-202ENST00000517351 SPG7Q9UQ90 795 aa34.77■■■■□ 3.16
TCEA1-202ENST00000517351 CYP27B1O15528 508 aa34.75■■■■□ 3.15
TCEA1-202ENST00000517351 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP34.73■■■■□ 3.153e-6■■■□□ 15.5
TCEA1-202ENST00000517351 IL13P35225 146 aa34.71■■■■□ 3.15
TCEA1-202ENST00000517351 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa34.68■■■■□ 3.14
TCEA1-202ENST00000517351 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP34.67■■■■□ 3.14
TCEA1-202ENST00000517351 AEBP1Q8IUX7 1158 aa34.66■■■■□ 3.14
TCEA1-202ENST00000517351 SULT6B1Q6IMI4 303 aa34.65■■■■□ 3.14
TCEA1-202ENST00000517351 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP34.64■■■■□ 3.14
TCEA1-202ENST00000517351 IFNL2Q8IZJ0 200 aa34.64■■■■□ 3.14
TCEA1-202ENST00000517351 PHKG2P15735 406 aa34.62■■■■□ 3.13
TCEA1-202ENST00000517351 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa34.61■■■■□ 3.13
TCEA1-202ENST00000517351 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP34.61■■■■□ 3.13
TCEA1-202ENST00000517351 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP34.61■■■■□ 3.13
TCEA1-202ENST00000517351 STK32BQ9NY57 414 aa34.61■■■■□ 3.13
TCEA1-202ENST00000517351 KDRP35968 1356 aa34.61■■■■□ 3.13
TCEA1-202ENST00000517351 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa34.59■■■■□ 3.13
TCEA1-202ENST00000517351 LRP5O75197 1615 aa34.59■■■■□ 3.13
TCEA1-202ENST00000517351 AMOTQ4VCS5 1084 aa34.58■■■■□ 3.13
TCEA1-202ENST00000517351 SLC27A3Q5K4L6 730 aa34.58■■■■□ 3.13
TCEA1-202ENST00000517351 LRRC4BQ9NT99 713 aa34.58■■■■□ 3.13
TCEA1-202ENST00000517351 ITGB4P16144 1822 aa34.57■■■■□ 3.12
TCEA1-202ENST00000517351 SLC15A2Q16348 729 aa34.56■■■■□ 3.12
TCEA1-202ENST00000517351 LY75O60449 1722 aa34.55■■■■□ 3.12
TCEA1-202ENST00000517351 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP34.55■■■■□ 3.12
TCEA1-202ENST00000517351 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP34.55■■■■□ 3.12
TCEA1-202ENST00000517351 PAPPAQ13219 1627 aa34.55■■■■□ 3.12
TCEA1-202ENST00000517351 HMOX1P09601 288 aa34.53■■■■□ 3.12
TCEA1-202ENST00000517351 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP34.52■■■■□ 3.12
TCEA1-202ENST00000517351 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP34.51■■■■□ 3.12
TCEA1-202ENST00000517351 PPP2R1AP30153 589 aa34.51■■■■□ 3.12
TCEA1-202ENST00000517351 KCNQ4P56696 695 aa34.51■■■■□ 3.12
TCEA1-202ENST00000517351 PIGBQ92521 554 aa34.51■■■■□ 3.12
TCEA1-202ENST00000517351 CFAP53Q96M91 514 aa34.5■■■■□ 3.11
TCEA1-202ENST00000517351 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP34.5■■■■□ 3.11
TCEA1-202ENST00000517351 C1orf141Q5JVX7 400 aa34.49■■■■□ 3.11
TCEA1-202ENST00000517351 TMOD3Q9NYL9 352 aa34.49■■■■□ 3.11
TCEA1-202ENST00000517351 PALLDQ8WX93 1383 aa34.49■■■■□ 3.11
TCEA1-202ENST00000517351 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP34.47■■■■□ 3.11
TCEA1-202ENST00000517351 ZNF827Q17R98 1081 aa34.47■■■■□ 3.11
TCEA1-202ENST00000517351 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP34.47■■■■□ 3.11
TCEA1-202ENST00000517351 DCAF5Q96JK2 942 aa34.47■■■■□ 3.11
TCEA1-202ENST00000517351 CASZ1Q86V15 1759 aa34.46■■■■□ 3.11
TCEA1-202ENST00000517351 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP34.46■■■■□ 3.11
TCEA1-202ENST00000517351 AKT1S1Q96B36 256 aa34.44■■■■□ 3.1
TCEA1-202ENST00000517351 ERVV-2B6SEH9 535 aa34.43■■■■□ 3.1
TCEA1-202ENST00000517351 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP34.43■■■■□ 3.1
TCEA1-202ENST00000517351 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP34.43■■■■□ 3.1
TCEA1-202ENST00000517351 SPON1Q9HCB6 807 aa34.42■■■■□ 3.1
TCEA1-202ENST00000517351 AKAP4Q5JQC9 854 aa34.38■■■■□ 3.09
TCEA1-202ENST00000517351 ASAP1Q9ULH1 1129 aa34.38■■■■□ 3.09
TCEA1-202ENST00000517351 NUDCQ9Y266 331 aa34.38■■■■□ 3.09
TCEA1-202ENST00000517351 ZBTB7AO95365 584 aa34.37■■■■□ 3.09
TCEA1-202ENST00000517351 CABP4P57796 275 aa34.37■■■■□ 3.09
TCEA1-202ENST00000517351 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa34.36■■■■□ 3.09
TCEA1-202ENST00000517351 C5P01031 1676 aa34.35■■■■□ 3.09
TCEA1-202ENST00000517351 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP34.35■■■■□ 3.09
TCEA1-202ENST00000517351 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP34.35■■■■□ 3.09
TCEA1-202ENST00000517351 ATG3Q9NT62 314 aa34.35■■■■□ 3.09
TCEA1-202ENST00000517351 QSER1Q2KHR3 1735 aa34.33■■■■□ 3.09
TCEA1-202ENST00000517351 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa34.33■■■■□ 3.09
TCEA1-202ENST00000517351 SIK1P57059 783 aa34.33■■■■□ 3.09
TCEA1-202ENST00000517351 TAF1LQ8IZX4 1826 aa34.32■■■■□ 3.09
TCEA1-202ENST00000517351 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa34.32■■■■□ 3.08
TCEA1-202ENST00000517351 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa34.31■■■■□ 3.08
TCEA1-202ENST00000517351 SCN11AQ9UI33 1791 aa34.31■■■■□ 3.08
TCEA1-202ENST00000517351 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP34.31■■■■□ 3.08
TCEA1-202ENST00000517351 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa34.31■■■■□ 3.08
TCEA1-202ENST00000517351 MTFR1LQ9H019 292 aa34.3■■■■□ 3.08
TCEA1-202ENST00000517351 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP34.29■■■■□ 3.08
TCEA1-202ENST00000517351 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP34.29■■■■□ 3.08
TCEA1-202ENST00000517351 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa34.29■■■■□ 3.08
TCEA1-202ENST00000517351 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP34.29■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.1 ms