RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, human

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4D-222	ENST00000514552	PRR20B	P86481	221 aa		11.5	□□□□□ -0.57
PDE4D-222	ENST00000514552	PRR20A	P86496	221 aa		11.5	□□□□□ -0.57
PDE4D-222	ENST00000514552	PRX	Q9BXM0	1461 aa		11.5	□□□□□ -0.57
PDE4D-222	ENST00000514552	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
PDE4D-222	ENST00000514552	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PDE4D-222	ENST00000514552	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
PDE4D-222	ENST00000514552	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PDE4D-222	ENST00000514552	CDK15	Q96Q40	435 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PDE4D-222	ENST00000514552	MAP4K5	Q9Y4K4	846 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PDE4D-222	ENST00000514552	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PDE4D-222	ENST00000514552	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PDE4D-222	ENST00000514552	POM121C	A8CG34	1229 aa		11.47	□□□□□ -0.57
PDE4D-222	ENST00000514552	ABCA8	O94911	1581 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PDE4D-222	ENST00000514552	SNIP1	Q8TAD8	396 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
PDE4D-222	ENST00000514552	TNFRSF10A	O00220	468 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PDE4D-222	ENST00000514552	ALG2	Q9H553	416 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PDE4D-222	ENST00000514552	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PDE4D-222	ENST00000514552	SEMA3F	Q13275	785 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PDE4D-222	ENST00000514552	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PDE4D-222	ENST00000514552	CYP4X1	Q8N118	509 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PDE4D-222	ENST00000514552	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PDE4D-222	ENST00000514552	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PDE4D-222	ENST00000514552	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
PDE4D-222	ENST00000514552	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
PDE4D-222	ENST00000514552	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PDE4D-222	ENST00000514552	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PDE4D-222	ENST00000514552	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
PDE4D-222	ENST00000514552	ARID5B	Q14865	1188 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
PDE4D-222	ENST00000514552	ADH1C	P00326	375 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PDE4D-222	ENST00000514552	ALDH1A1	P00352	501 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PDE4D-222	ENST00000514552	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PDE4D-222	ENST00000514552	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PDE4D-222	ENST00000514552	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
PDE4D-222	ENST00000514552	GRM5	P41594	1212 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PDE4D-222	ENST00000514552	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PDE4D-222	ENST00000514552	GLMN	Q92990	594 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PDE4D-222	ENST00000514552	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
PDE4D-222	ENST00000514552	SAMD9	Q5K651	1589 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PDE4D-222	ENST00000514552	ESPN	B1AK53	854 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PDE4D-222	ENST00000514552	NR5A1	Q13285	461 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PDE4D-222	ENST00000514552	EEA1	Q15075	1411 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PDE4D-222	ENST00000514552	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PDE4D-222	ENST00000514552	ADGRL1	O94910	1474 aa		11.38	□□□□□ -0.59
PDE4D-222	ENST00000514552	CCDC125	Q86Z20	511 aa		11.38	□□□□□ -0.59
PDE4D-222	ENST00000514552	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
PDE4D-222	ENST00000514552	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		11.38	□□□□□ -0.59
PDE4D-222	ENST00000514552	RNF20	Q5VTR2	975 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PDE4D-222	ENST00000514552	CD109	Q6YHK3	1445 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PDE4D-222	ENST00000514552		J3QL48	77 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PDE4D-222	ENST00000514552	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
PDE4D-222	ENST00000514552	SMPD1	P17405	629 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PDE4D-222	ENST00000514552	FSHR	P23945	695 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PDE4D-222	ENST00000514552	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
PDE4D-222	ENST00000514552	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
PDE4D-222	ENST00000514552	GFRA3	O60609	400 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PDE4D-222	ENST00000514552	LAPTM4A	Q15012	233 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PDE4D-222	ENST00000514552	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PDE4D-222	ENST00000514552	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
PDE4D-222	ENST00000514552	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PDE4D-222	ENST00000514552	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PDE4D-222	ENST00000514552	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PDE4D-222	ENST00000514552	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PDE4D-222	ENST00000514552	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
PDE4D-222	ENST00000514552	NNT	Q13423	1086 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PDE4D-222	ENST00000514552	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PDE4D-222	ENST00000514552	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PDE4D-222	ENST00000514552	ARID3C	A6NKF2	412 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PDE4D-222	ENST00000514552	RNF135	Q8IUD6	432 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PDE4D-222	ENST00000514552	CCDC116	Q8IYX3	515 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PDE4D-222	ENST00000514552	ATP10B	O94823	1461 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PDE4D-222	ENST00000514552	NR3C2	P08235	984 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PDE4D-222	ENST00000514552	TRIM52	Q96A61	297 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PDE4D-222	ENST00000514552	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PDE4D-222	ENST00000514552	UCN2	Q96RP3	112 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PDE4D-222	ENST00000514552	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
PDE4D-222	ENST00000514552	NEO1	Q92859	1461 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PDE4D-222	ENST00000514552	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PDE4D-222	ENST00000514552	FAM187A	A6NFU0	413 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PDE4D-222	ENST00000514552	ERVH48-1	M5A8F1	160 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PDE4D-222	ENST00000514552	DGAT1	O75907	488 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PDE4D-222	ENST00000514552	RAB15	P59190	212 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PDE4D-222	ENST00000514552	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PDE4D-222	ENST00000514552	KIF21B	O75037	1637 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PDE4D-222	ENST00000514552	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
PDE4D-222	ENST00000514552	PIK3CD	O00329	1044 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PDE4D-222	ENST00000514552	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PDE4D-222	ENST00000514552	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
PDE4D-222	ENST00000514552	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PDE4D-222	ENST00000514552	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PDE4D-222	ENST00000514552	HPS1	Q92902	700 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PDE4D-222	ENST00000514552	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
PDE4D-222	ENST00000514552	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PDE4D-222	ENST00000514552	AVP	P01185	164 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PDE4D-222	ENST00000514552	SKI	P12755	728 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PDE4D-222	ENST00000514552	PKDCC	Q504Y2	493 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PDE4D-222	ENST00000514552	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PDE4D-222	ENST00000514552	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
PDE4D-222	ENST00000514552	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
PDE4D-222	ENST00000514552	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		11.26	□□□□□ -0.61

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