RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514472.1

FGFR4-216, Transcript of fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

TSL 4

Gene FGFR4, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4-216ENST00000514472 LY75O60449 1722 aa31.1■■■□□ 2.57
FGFR4-216ENST00000514472 QSER1Q2KHR3 1735 aa31.1■■■□□ 2.57
FGFR4-216ENST00000514472 ZNF827Q17R98 1081 aa31.09■■■□□ 2.57
FGFR4-216ENST00000514472 CARD14Q9BXL6 1004 aa31.09■■■□□ 2.57
FGFR4-216ENST00000514472 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
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FGFR4-216ENST00000514472 INSRP06213 1382 aa31.07■■■□□ 2.56
FGFR4-216ENST00000514472 SLC27A3Q5K4L6 730 aa31.07■■■□□ 2.56
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FGFR4-216ENST00000514472 COL24A1Q17RW2 1714 aa31.01■■■□□ 2.56
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FGFR4-216ENST00000514472 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa31■■■□□ 2.55
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FGFR4-216ENST00000514472 SLC16A10Q8TF71 515 aa30.95■■■□□ 2.55
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FGFR4-216ENST00000514472 ITGB4P16144 1822 aa30.94■■■□□ 2.54
FGFR4-216ENST00000514472 PKD1L3Q7Z443 1732 aa30.93■■■□□ 2.54
FGFR4-216ENST00000514472 CHD4Q14839 1912 aa30.92■■■□□ 2.54
FGFR4-216ENST00000514472 MAP3K5Q99683 1374 aa30.92■■■□□ 2.54
FGFR4-216ENST00000514472 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa30.92■■■□□ 2.54
FGFR4-216ENST00000514472 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa30.92■■■□□ 2.54
FGFR4-216ENST00000514472 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa30.92■■■□□ 2.54
FGFR4-216ENST00000514472 NCAPD2Q15021 1401 aa30.91■■■□□ 2.54
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FGFR4-216ENST00000514472 POLD1P28340 1107 aa30.82■■■□□ 2.52
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FGFR4-216ENST00000514472 EYA1Q99502 592 aa30.81■■■□□ 2.52
FGFR4-216ENST00000514472 PALLDQ8WX93 1383 aa30.79■■■□□ 2.52
FGFR4-216ENST00000514472 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP30.79■■■□□ 2.52
FGFR4-216ENST00000514472 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP30.79■■■□□ 2.52
FGFR4-216ENST00000514472 POLR3GLQ9BT43 218 aa30.79■■■□□ 2.52
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FGFR4-216ENST00000514472 C4BP0C0L5 1744 aa30.73■■■□□ 2.51
FGFR4-216ENST00000514472 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP30.73■■■□□ 2.51
FGFR4-216ENST00000514472 UBR3Q6ZT12 1888 aa30.72■■■□□ 2.51
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FGFR4-216ENST00000514472 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP30.72■■■□□ 2.51
FGFR4-216ENST00000514472 MSH5O43196 834 aa30.71■■■□□ 2.51
FGFR4-216ENST00000514472 KLHL34Q8N239 644 aa30.71■■■□□ 2.51
FGFR4-216ENST00000514472 PANK3Q9H999 370 aa30.71■■■□□ 2.51
FGFR4-216ENST00000514472 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP30.7■■■□□ 2.51
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FGFR4-216ENST00000514472 NLGN2Q8NFZ4 835 aa30.68■■■□□ 2.5
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FGFR4-216ENST00000514472 IFNL2Q8IZJ0 200 aa30.67■■■□□ 2.5
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FGFR4-216ENST00000514472 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP30.65■■■□□ 2.5
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FGFR4-216ENST00000514472 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa30.62■■■□□ 2.49
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FGFR4-216ENST00000514472 AK7Q96M32 723 aa30.61■■■□□ 2.49
FGFR4-216ENST00000514472 ASAP1Q9ULH1 1129 aa30.61■■■□□ 2.49
FGFR4-216ENST00000514472 LINC00116Q8NCU8 138 aa30.59■■■□□ 2.49
FGFR4-216ENST00000514472 SMIM5Q71RC9 77 aa30.57■■■□□ 2.48
FGFR4-216ENST00000514472 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
FGFR4-216ENST00000514472 ITPK1Q13572 414 aa30.56■■■□□ 2.48
FGFR4-216ENST00000514472 ATG3Q9NT62 314 aa30.56■■■□□ 2.48
FGFR4-216ENST00000514472 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
FGFR4-216ENST00000514472 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP30.55■■■□□ 2.48
FGFR4-216ENST00000514472 MORC1Q86VD1 984 aa30.55■■■□□ 2.48
FGFR4-216ENST00000514472 CD2APQ9Y5K6 639 aa30.55■■■□□ 2.48
FGFR4-216ENST00000514472 SSFA2P28290 1259 aa30.54■■■□□ 2.48
FGFR4-216ENST00000514472 ZNF831Q5JPB2 1677 aa30.53■■■□□ 2.48
FGFR4-216ENST00000514472 ERVV-2B6SEH9 535 aa30.53■■■□□ 2.48
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