RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512716.1

RASGEF1B-210, Transcript of RasGEF domain family member 1B, humanhuman

TSL 3

Gene RASGEF1B, Length 516 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1B-210ENST00000512716 PTF1AQ7RTS3 328 aa32.73■■■□□ 2.83
RASGEF1B-210ENST00000512716 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP32.73■■■□□ 2.83
RASGEF1B-210ENST00000512716 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa32.73■■■□□ 2.83
RASGEF1B-210ENST00000512716 ACSBG1Q96GR2 724 aa32.71■■■□□ 2.83
RASGEF1B-210ENST00000512716 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP32.7■■■□□ 2.83
RASGEF1B-210ENST00000512716 NUP188Q5SRE5 1749 aa32.69■■■□□ 2.82
RASGEF1B-210ENST00000512716 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP32.69■■■□□ 2.82
RASGEF1B-210ENST00000512716 EYA1Q99502 592 aa32.69■■■□□ 2.82
RASGEF1B-210ENST00000512716 NCAPD2Q15021 1401 aa32.68■■■□□ 2.82
RASGEF1B-210ENST00000512716 KCNQ2O43526 872 aa32.67■■■□□ 2.82
RASGEF1B-210ENST00000512716 PLSCR1O15162 318 aa32.66■■■□□ 2.82
RASGEF1B-210ENST00000512716 BTAF1O14981 1849 aa32.65■■■□□ 2.82
RASGEF1B-210ENST00000512716 DOT1LQ8TEK3 1739 aa32.65■■■□□ 2.82
RASGEF1B-210ENST00000512716 PKD1L3Q7Z443 1732 aa32.64■■■□□ 2.82
RASGEF1B-210ENST00000512716 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa32.64■■■□□ 2.82
RASGEF1B-210ENST00000512716 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP32.63■■■□□ 2.81
RASGEF1B-210ENST00000512716 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa32.61■■■□□ 2.81
RASGEF1B-210ENST00000512716 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa32.61■■■□□ 2.81
RASGEF1B-210ENST00000512716 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP32.6■■■□□ 2.81
RASGEF1B-210ENST00000512716 IGSF1Q8N6C5 1336 aa32.58■■■□□ 2.81
RASGEF1B-210ENST00000512716 MTHFSP49914 203 aa32.57■■■□□ 2.8
RASGEF1B-210ENST00000512716 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP32.57■■■□□ 2.8
RASGEF1B-210ENST00000512716 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP32.56■■■□□ 2.8
RASGEF1B-210ENST00000512716 NBPF14Q5TI25 921 aa32.56■■■□□ 2.8
RASGEF1B-210ENST00000512716 SPG7Q9UQ90 795 aa32.55■■■□□ 2.8
RASGEF1B-210ENST00000512716 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP32.53■■■□□ 2.8
RASGEF1B-210ENST00000512716 CYP27B1O15528 508 aa32.52■■■□□ 2.8
RASGEF1B-210ENST00000512716 TXNRD1Q16881 649 aa32.52■■■□□ 2.8
RASGEF1B-210ENST00000512716 PROM2Q8N271 834 aa32.51■■■□□ 2.79
RASGEF1B-210ENST00000512716 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP32.51■■■□□ 2.79
RASGEF1B-210ENST00000512716 IL13P35225 146 aa32.5■■■□□ 2.79
RASGEF1B-210ENST00000512716 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa32.48■■■□□ 2.79
RASGEF1B-210ENST00000512716 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa32.47■■■□□ 2.79
RASGEF1B-210ENST00000512716 ITGB4P16144 1822 aa32.47■■■□□ 2.79
RASGEF1B-210ENST00000512716 SULT6B1Q6IMI4 303 aa32.45■■■□□ 2.79
RASGEF1B-210ENST00000512716 AEBP1Q8IUX7 1158 aa32.45■■■□□ 2.79
RASGEF1B-210ENST00000512716 IFNL2Q8IZJ0 200 aa32.43■■■□□ 2.78
RASGEF1B-210ENST00000512716 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP32.42■■■□□ 2.78
RASGEF1B-210ENST00000512716 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP32.42■■■□□ 2.78
RASGEF1B-210ENST00000512716 LY75O60449 1722 aa32.42■■■□□ 2.78
RASGEF1B-210ENST00000512716 PHKG2P15735 406 aa32.41■■■□□ 2.78
RASGEF1B-210ENST00000512716 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP32.41■■■□□ 2.78
RASGEF1B-210ENST00000512716 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP32.41■■■□□ 2.78
RASGEF1B-210ENST00000512716 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP32.41■■■□□ 2.78
RASGEF1B-210ENST00000512716 KDRP35968 1356 aa32.41■■■□□ 2.78
RASGEF1B-210ENST00000512716 LRP5O75197 1615 aa32.39■■■□□ 2.78
RASGEF1B-210ENST00000512716 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP32.38■■■□□ 2.77
RASGEF1B-210ENST00000512716 AMOTQ4VCS5 1084 aa32.38■■■□□ 2.77
RASGEF1B-210ENST00000512716 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa32.38■■■□□ 2.77
RASGEF1B-210ENST00000512716 STK32BQ9NY57 414 aa32.38■■■□□ 2.77
RASGEF1B-210ENST00000512716 PAPPAQ13219 1627 aa32.37■■■□□ 2.77
RASGEF1B-210ENST00000512716 SLC27A3Q5K4L6 730 aa32.35■■■□□ 2.77
RASGEF1B-210ENST00000512716 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP32.35■■■□□ 2.77
RASGEF1B-210ENST00000512716 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa32.34■■■□□ 2.77
RASGEF1B-210ENST00000512716 HMOX1P09601 288 aa32.34■■■□□ 2.77
RASGEF1B-210ENST00000512716 LRRC4BQ9NT99 713 aa32.34■■■□□ 2.77
RASGEF1B-210ENST00000512716 PPP2R1AP30153 589 aa32.33■■■□□ 2.77
RASGEF1B-210ENST00000512716 CFAP53Q96M91 514 aa32.33■■■□□ 2.77
RASGEF1B-210ENST00000512716 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP32.32■■■□□ 2.76
RASGEF1B-210ENST00000512716 SLC15A2Q16348 729 aa32.32■■■□□ 2.76
RASGEF1B-210ENST00000512716 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP32.3■■■□□ 2.76
RASGEF1B-210ENST00000512716 C1orf141Q5JVX7 400 aa32.3■■■□□ 2.76
RASGEF1B-210ENST00000512716 TMOD3Q9NYL9 352 aa32.3■■■□□ 2.76
RASGEF1B-210ENST00000512716 CASZ1Q86V15 1759 aa32.3■■■□□ 2.76
RASGEF1B-210ENST00000512716 KCNQ4P56696 695 aa32.29■■■□□ 2.76
RASGEF1B-210ENST00000512716 PIGBQ92521 554 aa32.29■■■□□ 2.76
RASGEF1B-210ENST00000512716 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP32.29■■■□□ 2.76
RASGEF1B-210ENST00000512716 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP32.28■■■□□ 2.76
RASGEF1B-210ENST00000512716 DCAF5Q96JK2 942 aa32.28■■■□□ 2.76
RASGEF1B-210ENST00000512716 PALLDQ8WX93 1383 aa32.28■■■□□ 2.76
RASGEF1B-210ENST00000512716 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP32.26■■■□□ 2.75
RASGEF1B-210ENST00000512716 ZNF827Q17R98 1081 aa32.24■■■□□ 2.75
RASGEF1B-210ENST00000512716 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP32.24■■■□□ 2.75
RASGEF1B-210ENST00000512716 C5P01031 1676 aa32.24■■■□□ 2.75
RASGEF1B-210ENST00000512716 ERVV-2B6SEH9 535 aa32.23■■■□□ 2.75
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RASGEF1B-210ENST00000512716 TAF1LQ8IZX4 1826 aa32.23■■■□□ 2.75
RASGEF1B-210ENST00000512716 SCN11AQ9UI33 1791 aa32.22■■■□□ 2.75
RASGEF1B-210ENST00000512716 QSER1Q2KHR3 1735 aa32.21■■■□□ 2.75
RASGEF1B-210ENST00000512716 AKT1S1Q96B36 256 aa32.21■■■□□ 2.75
RASGEF1B-210ENST00000512716 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP32.21■■■□□ 2.75
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RASGEF1B-210ENST00000512716 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa32.21■■■□□ 2.75
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RASGEF1B-210ENST00000512716 SPON1Q9HCB6 807 aa32.19■■■□□ 2.74
RASGEF1B-210ENST00000512716 CABP4P57796 275 aa32.18■■■□□ 2.74
RASGEF1B-210ENST00000512716 ASAP1Q9ULH1 1129 aa32.18■■■□□ 2.74
RASGEF1B-210ENST00000512716 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP32.16■■■□□ 2.74
RASGEF1B-210ENST00000512716 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP32.16■■■□□ 2.74
RASGEF1B-210ENST00000512716 ZBTB7AO95365 584 aa32.15■■■□□ 2.74
RASGEF1B-210ENST00000512716 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa32.15■■■□□ 2.74
RASGEF1B-210ENST00000512716 ATG3Q9NT62 314 aa32.14■■■□□ 2.74
RASGEF1B-210ENST00000512716 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa32.13■■■□□ 2.73
RASGEF1B-210ENST00000512716 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP32.13■■■□□ 2.73
RASGEF1B-210ENST00000512716 SIK1P57059 783 aa32.13■■■□□ 2.73
RASGEF1B-210ENST00000512716 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP32.13■■■□□ 2.73
RASGEF1B-210ENST00000512716 RALBP1Q15311 655 aa32.12■■■□□ 2.73
RASGEF1B-210ENST00000512716 C4BP0C0L5 1744 aa32.12■■■□□ 2.73
RASGEF1B-210ENST00000512716 PRKAR2BP31323 418 aa32.1■■■□□ 2.73
RASGEF1B-210ENST00000512716 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa32.1■■■□□ 2.73
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