RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511237.5

SH3BP2-219, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 517 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-219ENST00000511237 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP2-219ENST00000511237 HOXC9P31274 260 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP2-219ENST00000511237 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
SH3BP2-219ENST00000511237 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SH3BP2-219ENST00000511237 A0A1W2PP64 1363 aa22.39■■□□□ 1.18
SH3BP2-219ENST00000511237 USP47Q96K76 1375 aa22.39■■□□□ 1.18
SH3BP2-219ENST00000511237 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP22.39■■□□□ 1.17
SH3BP2-219ENST00000511237 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
SH3BP2-219ENST00000511237 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP2-219ENST00000511237 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
SH3BP2-219ENST00000511237 IFFO2Q5TF58 517 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP2-219ENST00000511237 USP54Q70EL1 1684 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP2-219ENST00000511237 FBLN1P23142 703 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP2-219ENST00000511237 MSL1Q68DK7 614 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP2-219ENST00000511237 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-219ENST00000511237 QSER1Q2KHR3 1735 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-219ENST00000511237 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-219ENST00000511237 NSD2O96028 1365 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-219ENST00000511237 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-219ENST00000511237 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-219ENST00000511237 SLC24A1O60721 1099 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-219ENST00000511237 NBPF6Q5VWK0 638 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-219ENST00000511237 NBPF4Q96M43 638 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-219ENST00000511237 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-219ENST00000511237 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-219ENST00000511237 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-219ENST00000511237 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-219ENST00000511237 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-219ENST00000511237 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-219ENST00000511237 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-219ENST00000511237 MEGF6O75095 1541 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-219ENST00000511237 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-219ENST00000511237 LY75O60449 1722 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-219ENST00000511237 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-219ENST00000511237 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-219ENST00000511237 SHANK3Q9BYB0 1731 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-219ENST00000511237 ATP10DQ9P241 1426 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-219ENST00000511237 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-219ENST00000511237 CEP350Q5VT06 3117 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-219ENST00000511237 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-219ENST00000511237 AK7Q96M32 723 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-219ENST00000511237 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-219ENST00000511237 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-219ENST00000511237 RTL1A6NKG5 1358 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-219ENST00000511237 TONSLQ96HA7 1378 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-219ENST00000511237 FYB1O15117 783 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-219ENST00000511237 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-219ENST00000511237 TESK2Q96S53 571 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-219ENST00000511237 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-219ENST00000511237 PALLDQ8WX93 1383 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-219ENST00000511237 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-219ENST00000511237 PHF14O94880 888 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-219ENST00000511237 HSPA6P17066 643 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-219ENST00000511237 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-219ENST00000511237 RGPD2P0DJD1 1756 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2-219ENST00000511237 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.18■■□□□ 1.14
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SH3BP2-219ENST00000511237 CYP27B1O15528 508 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-219ENST00000511237 INSRP06213 1382 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-219ENST00000511237 TMF1P82094 1093 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-219ENST00000511237 PIGBQ92521 554 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-219ENST00000511237 SMIM5Q71RC9 77 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-219ENST00000511237 SPG7Q9UQ90 795 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-219ENST00000511237 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-219ENST00000511237 C5P01031 1676 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-219ENST00000511237 FLT4P35916 1363 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-219ENST00000511237 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-219ENST00000511237 SSFA2P28290 1259 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-219ENST00000511237 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-219ENST00000511237 ADCY9O60503 1353 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP2-219ENST00000511237 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP2-219ENST00000511237 SIK1P57059 783 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP2-219ENST00000511237 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP2-219ENST00000511237 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP2-219ENST00000511237 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-219ENST00000511237 CDCA8Q53HL2 280 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-219ENST00000511237 GNPATO15228 680 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-219ENST00000511237 ATP6V1AP38606 617 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-219ENST00000511237 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-219ENST00000511237 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-219ENST00000511237 C4BP0C0L5 1744 aa22.08■■□□□ 1.12
SH3BP2-219ENST00000511237 KIF3CO14782 793 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP2-219ENST00000511237 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-219ENST00000511237 MMP10P09238 476 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-219ENST00000511237 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-219ENST00000511237 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.12
SH3BP2-219ENST00000511237 APLP1P51693 650 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-219ENST00000511237 ITPK1Q13572 414 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-219ENST00000511237 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-219ENST00000511237 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-219ENST00000511237 BCS1LQ9Y276 419 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-219ENST00000511237 TGFB2P61812 414 aa22.03■■□□□ 1.12
SH3BP2-219ENST00000511237 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa22.03■■□□□ 1.12
SH3BP2-219ENST00000511237 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.03■■□□□ 1.12
SH3BP2-219ENST00000511237 A0A0G2JLW4 131 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2-219ENST00000511237 TOMM70O94826 608 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2-219ENST00000511237 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2-219ENST00000511237 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2-219ENST00000511237 EYA1Q99502 592 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2-219ENST00000511237 ATG3Q9NT62 314 aa22.01■■□□□ 1.11
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