RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506437.1

ITGA3-208, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 2

Gene ITGA3, Length 3,055 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-208ENST00000506437 TMPOP42166 694 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
ITGA3-208ENST00000506437 MCM10Q7L590 875 aa14.77□□□□□ -0.04
ITGA3-208ENST00000506437 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
ITGA3-208ENST00000506437 ERBB3P21860 1342 aa14.77□□□□□ -0.04
ITGA3-208ENST00000506437 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
ITGA3-208ENST00000506437 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
ITGA3-208ENST00000506437 FCHSD2O94868 740 aa14.76□□□□□ -0.05
ITGA3-208ENST00000506437 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
ITGA3-208ENST00000506437 MIS18AQ9NYP9 233 aa14.76□□□□□ -0.05
ITGA3-208ENST00000506437 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
ITGA3-208ENST00000506437 SLIT3O75094 1523 aa14.76□□□□□ -0.05
ITGA3-208ENST00000506437 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
ITGA3-208ENST00000506437 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
ITGA3-208ENST00000506437 KAT6BQ8WYB5 2073 aa14.76□□□□□ -0.05
ITGA3-208ENST00000506437 WWC1Q8IX03 1113 aa14.75□□□□□ -0.05
ITGA3-208ENST00000506437 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
ITGA3-208ENST00000506437 TRIM35Q9UPQ4 493 aa14.74□□□□□ -0.05
ITGA3-208ENST00000506437 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa14.74□□□□□ -0.05
ITGA3-208ENST00000506437 IGSF1Q8N6C5 1336 aa14.73□□□□□ -0.05
ITGA3-208ENST00000506437 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
ITGA3-208ENST00000506437 NGLY1Q96IV0 654 aa14.72□□□□□ -0.05
ITGA3-208ENST00000506437 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
ITGA3-208ENST00000506437 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ITGA3-208ENST00000506437 RGS3P49796 1198 aa14.7□□□□□ -0.06
ITGA3-208ENST00000506437 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa14.7□□□□□ -0.06
ITGA3-208ENST00000506437 NFE2L2Q16236 605 aa14.7□□□□□ -0.06
ITGA3-208ENST00000506437 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ITGA3-208ENST00000506437 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa14.7□□□□□ -0.06
ITGA3-208ENST00000506437 A0A0G2JS52 829 aa14.69□□□□□ -0.06
ITGA3-208ENST00000506437 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ITGA3-208ENST00000506437 SLC4A3P48751 1232 aa14.69□□□□□ -0.06
ITGA3-208ENST00000506437 GOLGA2Q08379 1002 aa14.69□□□□□ -0.06
ITGA3-208ENST00000506437 NFKBIBQ15653 356 aa14.69□□□□□ -0.06
ITGA3-208ENST00000506437 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa14.69□□□□□ -0.06
ITGA3-208ENST00000506437 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ITGA3-208ENST00000506437 LGR6Q9HBX8 967 aa14.69□□□□□ -0.06
ITGA3-208ENST00000506437 KRT24Q2M2I5 525 aa14.69□□□□□ -0.06
ITGA3-208ENST00000506437 BCL2L13Q9BXK5 485 aa14.69□□□□□ -0.06
ITGA3-208ENST00000506437 ABCA3Q99758 1704 aa14.68□□□□□ -0.06
ITGA3-208ENST00000506437 RTL1A6NKG5 1358 aa14.68□□□□□ -0.06
ITGA3-208ENST00000506437 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
ITGA3-208ENST00000506437 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa14.68□□□□□ -0.06
ITGA3-208ENST00000506437 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
ITGA3-208ENST00000506437 USP54Q70EL1 1684 aa14.67□□□□□ -0.06
ITGA3-208ENST00000506437 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ITGA3-208ENST00000506437 RRP9O43818 475 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ITGA3-208ENST00000506437 PLIN1O60240 522 aa14.67□□□□□ -0.06
ITGA3-208ENST00000506437 FAM182BQ5T319 152 aa14.67□□□□□ -0.06
ITGA3-208ENST00000506437 COL18A1P39060 1754 aa14.67□□□□□ -0.06
ITGA3-208ENST00000506437 CPDO75976 1380 aa14.66□□□□□ -0.06
ITGA3-208ENST00000506437 WDR17Q8IZU2 1322 aa14.66□□□□□ -0.06
ITGA3-208ENST00000506437 ZNF521Q96K83 1311 aa14.66□□□□□ -0.06
ITGA3-208ENST00000506437 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ITGA3-208ENST00000506437 IQSEC2Q5JU85 1478 aa14.66□□□□□ -0.06
ITGA3-208ENST00000506437 MEGF6O75095 1541 aa14.65□□□□□ -0.06
ITGA3-208ENST00000506437 JCADQ9P266 1359 aa14.65□□□□□ -0.06
ITGA3-208ENST00000506437 DLG5Q8TDM6 1919 aa14.65□□□□□ -0.06
ITGA3-208ENST00000506437 LRP6O75581 1613 aa14.65□□□□□ -0.06
ITGA3-208ENST00000506437 DUSP27Q5VZP5 1158 aa14.65□□□□□ -0.06
ITGA3-208ENST00000506437 RGPD1P0DJD0 1748 aa14.65□□□□□ -0.06
ITGA3-208ENST00000506437 KDRP35968 1356 aa14.64□□□□□ -0.07
ITGA3-208ENST00000506437 SLFN5Q08AF3 891 aa14.64□□□□□ -0.07
ITGA3-208ENST00000506437 IL17REQ8NFR9 667 aa14.64□□□□□ -0.07
ITGA3-208ENST00000506437 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ITGA3-208ENST00000506437 ARXQ96QS3 562 aa14.64□□□□□ -0.07
ITGA3-208ENST00000506437 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ITGA3-208ENST00000506437 KIF24Q5T7B8 1368 aa14.63□□□□□ -0.07
ITGA3-208ENST00000506437 TATP17735 454 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ITGA3-208ENST00000506437 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ITGA3-208ENST00000506437 NECTIN2Q92692 538 aa14.63□□□□□ -0.07
ITGA3-208ENST00000506437 CYP27B1O15528 508 aa14.62□□□□□ -0.07
ITGA3-208ENST00000506437 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ITGA3-208ENST00000506437 USP21Q9UK80 565 aa14.62□□□□□ -0.07
ITGA3-208ENST00000506437 GNAT3A8MTJ3 354 aa14.61□□□□□ -0.07
ITGA3-208ENST00000506437 TSPYL6Q8N831 410 aa14.61□□□□□ -0.07
ITGA3-208ENST00000506437 KCNQ3O43525 872 aa14.61□□□□□ -0.07
ITGA3-208ENST00000506437 BCAR3O75815 825 aa14.61□□□□□ -0.07
ITGA3-208ENST00000506437 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ITGA3-208ENST00000506437 C1orf141Q5JVX7 400 aa14.6□□□□□ -0.07
ITGA3-208ENST00000506437 MBIPQ9NS73 344 aa14.6□□□□□ -0.07
ITGA3-208ENST00000506437 SLC39A6Q13433 755 aa14.6□□□□□ -0.07
ITGA3-208ENST00000506437 GAS2L2Q8NHY3 880 aa14.6□□□□□ -0.07
ITGA3-208ENST00000506437 PRDM4Q9UKN5 801 aa14.6□□□□□ -0.07
ITGA3-208ENST00000506437 IL2RBP14784 551 aa14.59□□□□□ -0.07
ITGA3-208ENST00000506437 AFF2P51816 1311 aa14.59□□□□□ -0.07
ITGA3-208ENST00000506437 LMO7Q8WWI1 1683 aa14.59□□□□□ -0.07
ITGA3-208ENST00000506437 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ITGA3-208ENST00000506437 CARD10Q9BWT7 1032 aa14.59□□□□□ -0.07
ITGA3-208ENST00000506437 E9PSI1 815 aa14.58□□□□□ -0.08
ITGA3-208ENST00000506437 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
ITGA3-208ENST00000506437 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
ITGA3-208ENST00000506437 RCAN3Q9UKA8 241 aa14.57□□□□□ -0.08
ITGA3-208ENST00000506437 C8orf58Q8NAV2 365 aa14.57□□□□□ -0.08
ITGA3-208ENST00000506437 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa14.57□□□□□ -0.08
ITGA3-208ENST00000506437 UNC5CLQ8IV45 518 aa14.57□□□□□ -0.08
ITGA3-208ENST00000506437 ACSBG1Q96GR2 724 aa14.57□□□□□ -0.08
ITGA3-208ENST00000506437 TSPYL4Q9UJ04 414 aa14.57□□□□□ -0.08
ITGA3-208ENST00000506437 TNNQ9UQP3 1299 aa14.57□□□□□ -0.08
ITGA3-208ENST00000506437 MAP3K5Q99683 1374 aa14.56□□□□□ -0.08
ITGA3-208ENST00000506437 CRB1P82279 1406 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms