RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 EYA1Q99502 592 aa28.62■■■□□ 2.17
SH3BP2-210ENST00000505941 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
SH3BP2-210ENST00000505941 KAT6BQ8WYB5 2073 aa28.6■■■□□ 2.17
SH3BP2-210ENST00000505941 MEGF6O75095 1541 aa28.6■■■□□ 2.17
SH3BP2-210ENST00000505941 KCNQ2O43526 872 aa28.59■■■□□ 2.17
SH3BP2-210ENST00000505941 SPG7Q9UQ90 795 aa28.58■■■□□ 2.17
SH3BP2-210ENST00000505941 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa28.58■■■□□ 2.17
SH3BP2-210ENST00000505941 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa28.58■■■□□ 2.17
SH3BP2-210ENST00000505941 PTF1AQ7RTS3 328 aa28.57■■■□□ 2.16
SH3BP2-210ENST00000505941 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
SH3BP2-210ENST00000505941 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa28.56■■■□□ 2.16
SH3BP2-210ENST00000505941 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
SH3BP2-210ENST00000505941 MTHFSP49914 203 aa28.54■■■□□ 2.16
SH3BP2-210ENST00000505941 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
SH3BP2-210ENST00000505941 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
SH3BP2-210ENST00000505941 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP28.52■■■□□ 2.16
SH3BP2-210ENST00000505941 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
SH3BP2-210ENST00000505941 NHSQ6T4R5 1651 aa28.51■■■□□ 2.15
SH3BP2-210ENST00000505941 NCAPD2Q15021 1401 aa28.5■■■□□ 2.15
SH3BP2-210ENST00000505941 IGSF1Q8N6C5 1336 aa28.49■■■□□ 2.15
SH3BP2-210ENST00000505941 TXNRD1Q16881 649 aa28.49■■■□□ 2.15
SH3BP2-210ENST00000505941 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
SH3BP2-210ENST00000505941 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa28.47■■■□□ 2.15
SH3BP2-210ENST00000505941 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
SH3BP2-210ENST00000505941 RREB1Q92766 1687 aa28.45■■■□□ 2.15
SH3BP2-210ENST00000505941 CYP27B1O15528 508 aa28.45■■■□□ 2.14
SH3BP2-210ENST00000505941 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
SH3BP2-210ENST00000505941 IL13P35225 146 aa28.45■■■□□ 2.14
SH3BP2-210ENST00000505941 IFNL2Q8IZJ0 200 aa28.45■■■□□ 2.14
SH3BP2-210ENST00000505941 AMOTQ4VCS5 1084 aa28.44■■■□□ 2.14
SH3BP2-210ENST00000505941 SULT6B1Q6IMI4 303 aa28.44■■■□□ 2.14
SH3BP2-210ENST00000505941 PROM2Q8N271 834 aa28.44■■■□□ 2.14
SH3BP2-210ENST00000505941 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa28.44■■■□□ 2.14
SH3BP2-210ENST00000505941 SHANK3Q9BYB0 1731 aa28.43■■■□□ 2.14
SH3BP2-210ENST00000505941 CFAP53Q96M91 514 aa28.42■■■□□ 2.14
SH3BP2-210ENST00000505941 NUP188Q5SRE5 1749 aa28.41■■■□□ 2.14
SH3BP2-210ENST00000505941 STK32BQ9NY57 414 aa28.41■■■□□ 2.14
SH3BP2-210ENST00000505941 BTAF1O14981 1849 aa28.41■■■□□ 2.14
SH3BP2-210ENST00000505941 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa28.4■■■□□ 2.14
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SH3BP2-210ENST00000505941 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC27A3Q5K4L6 730 aa28.39■■■□□ 2.14
SH3BP2-210ENST00000505941 PKD1L3Q7Z443 1732 aa28.38■■■□□ 2.13
SH3BP2-210ENST00000505941 DOT1LQ8TEK3 1739 aa28.38■■■□□ 2.13
SH3BP2-210ENST00000505941 PHKG2P15735 406 aa28.38■■■□□ 2.13
SH3BP2-210ENST00000505941 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
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SH3BP2-210ENST00000505941 C1orf141Q5JVX7 400 aa28.36■■■□□ 2.13
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
SH3BP2-210ENST00000505941 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
SH3BP2-210ENST00000505941 HMOX1P09601 288 aa28.33■■■□□ 2.13
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC15A2Q16348 729 aa28.33■■■□□ 2.13
SH3BP2-210ENST00000505941 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
SH3BP2-210ENST00000505941 TMOD3Q9NYL9 352 aa28.33■■■□□ 2.13
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SH3BP2-210ENST00000505941 LRRC4BQ9NT99 713 aa28.28■■■□□ 2.12
SH3BP2-210ENST00000505941 CABP4P57796 275 aa28.25■■■□□ 2.11
SH3BP2-210ENST00000505941 PALLDQ8WX93 1383 aa28.24■■■□□ 2.11
SH3BP2-210ENST00000505941 SPON1Q9HCB6 807 aa28.24■■■□□ 2.11
SH3BP2-210ENST00000505941 KCNQ4P56696 695 aa28.23■■■□□ 2.11
SH3BP2-210ENST00000505941 AKAP4Q5JQC9 854 aa28.23■■■□□ 2.11
SH3BP2-210ENST00000505941 ITGB4P16144 1822 aa28.22■■■□□ 2.11
SH3BP2-210ENST00000505941 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa28.22■■■□□ 2.11
SH3BP2-210ENST00000505941 RALBP1Q15311 655 aa28.2■■■□□ 2.1
SH3BP2-210ENST00000505941 LY75O60449 1722 aa28.2■■■□□ 2.1
SH3BP2-210ENST00000505941 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
SH3BP2-210ENST00000505941 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa28.19■■■□□ 2.1
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SH3BP2-210ENST00000505941 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP28.19■■■□□ 2.1
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SH3BP2-210ENST00000505941 AKT1S1Q96B36 256 aa28.18■■■□□ 2.1
SH3BP2-210ENST00000505941 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF827Q17R98 1081 aa28.17■■■□□ 2.1
SH3BP2-210ENST00000505941 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
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SH3BP2-210ENST00000505941 GAS2L2Q8NHY3 880 aa28.16■■■□□ 2.1
SH3BP2-210ENST00000505941 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa28.15■■■□□ 2.1
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SH3BP2-210ENST00000505941 SIK1P57059 783 aa28.15■■■□□ 2.1
SH3BP2-210ENST00000505941 ATG3Q9NT62 314 aa28.15■■■□□ 2.1
SH3BP2-210ENST00000505941 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa28.15■■■□□ 2.1
SH3BP2-210ENST00000505941 NEFMP07197 916 aa28.14■■■□□ 2.1
SH3BP2-210ENST00000505941 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa28.14■■■□□ 2.1
SH3BP2-210ENST00000505941 ATP6V1AP38606 617 aa28.13■■■□□ 2.09
SH3BP2-210ENST00000505941 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
SH3BP2-210ENST00000505941 PAPPAQ13219 1627 aa28.13■■■□□ 2.09
SH3BP2-210ENST00000505941 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
SH3BP2-210ENST00000505941 MSH5O43196 834 aa28.12■■■□□ 2.09
SH3BP2-210ENST00000505941 FCHSD2O94868 740 aa28.12■■■□□ 2.09
SH3BP2-210ENST00000505941 PRKAR2BP31323 418 aa28.12■■■□□ 2.09
SH3BP2-210ENST00000505941 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
SH3BP2-210ENST00000505941 MTFR1LQ9H019 292 aa28.12■■■□□ 2.09
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