RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498834.5

VSTM2A-208, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 2A, humanhuman

TSL 2

Gene VSTM2A, Length 803 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2A-208ENST00000498834 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa9.88□□□□□ -0.83
VSTM2A-208ENST00000498834 PTCH1Q13635 1447 aa9.88□□□□□ -0.83
VSTM2A-208ENST00000498834 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa9.88□□□□□ -0.83
VSTM2A-208ENST00000498834 LRRC7Q96NW7 1537 aa9.87□□□□□ -0.83
VSTM2A-208ENST00000498834 RALGAPBQ86X10 1494 aa9.87□□□□□ -0.83
VSTM2A-208ENST00000498834 WASLO00401 505 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
VSTM2A-208ENST00000498834 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
VSTM2A-208ENST00000498834 BCAMP50895 628 aa9.87□□□□□ -0.83
VSTM2A-208ENST00000498834 NYAP1Q6ZVC0 841 aa9.87□□□□□ -0.83
VSTM2A-208ENST00000498834 CDK19Q9BWU1 502 aa9.87□□□□□ -0.83
VSTM2A-208ENST00000498834 ADGRB1O14514 1584 aa9.87□□□□□ -0.83
VSTM2A-208ENST00000498834 IFT172Q9UG01 1749 aa9.87□□□□□ -0.83
VSTM2A-208ENST00000498834 LTBP4Q8N2S1 1624 aa9.86□□□□□ -0.83
VSTM2A-208ENST00000498834 SMYD5Q6GMV2 418 aa9.86□□□□□ -0.83
VSTM2A-208ENST00000498834 TATDN2Q93075 761 aa9.86□□□□□ -0.83
VSTM2A-208ENST00000498834 CDHR5Q9HBB8 845 aa9.86□□□□□ -0.83
VSTM2A-208ENST00000498834 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
VSTM2A-208ENST00000498834 EVC2Q86UK5 1308 aa9.85□□□□□ -0.83
VSTM2A-208ENST00000498834 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
VSTM2A-208ENST00000498834 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
VSTM2A-208ENST00000498834 CDCA8Q53HL2 280 aa9.85□□□□□ -0.83
VSTM2A-208ENST00000498834 USP47Q96K76 1375 aa9.85□□□□□ -0.83
VSTM2A-208ENST00000498834 DLC1Q96QB1 1528 aa9.84□□□□□ -0.83
VSTM2A-208ENST00000498834 NUTM2FA1L443 756 aa9.84□□□□□ -0.83
VSTM2A-208ENST00000498834 SMAPO00193 183 aa9.84□□□□□ -0.83
VSTM2A-208ENST00000498834 PIP4K2BP78356 416 aa9.84□□□□□ -0.83
VSTM2A-208ENST00000498834 TMF1P82094 1093 aa9.84□□□□□ -0.83
VSTM2A-208ENST00000498834 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
VSTM2A-208ENST00000498834 LAMC1P11047 1609 aa9.84□□□□□ -0.83
VSTM2A-208ENST00000498834 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa9.83□□□□□ -0.84
VSTM2A-208ENST00000498834 SLC4A3P48751 1232 aa9.83□□□□□ -0.84
VSTM2A-208ENST00000498834 PPP4CP60510 307 aa9.83□□□□□ -0.84
VSTM2A-208ENST00000498834 ESCO1Q5FWF5 840 aa9.83□□□□□ -0.84
VSTM2A-208ENST00000498834 NUDT18Q6ZVK8 323 aa9.83□□□□□ -0.84
VSTM2A-208ENST00000498834 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
VSTM2A-208ENST00000498834 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
VSTM2A-208ENST00000498834 TESK2Q96S53 571 aa9.83□□□□□ -0.84
VSTM2A-208ENST00000498834 HPS5Q9UPZ3 1129 aa9.83□□□□□ -0.84
VSTM2A-208ENST00000498834 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
VSTM2A-208ENST00000498834 IQSEC2Q5JU85 1478 aa9.83□□□□□ -0.84
VSTM2A-208ENST00000498834 NWD1Q149M9 1564 aa9.83□□□□□ -0.84
VSTM2A-208ENST00000498834 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa9.82□□□□□ -0.84
VSTM2A-208ENST00000498834 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa9.82□□□□□ -0.84
VSTM2A-208ENST00000498834 SEMA3EO15041 775 aa9.82□□□□□ -0.84
VSTM2A-208ENST00000498834 PADI6Q6TGC4 694 aa9.81□□□□□ -0.84
VSTM2A-208ENST00000498834 FBXO41Q8TF61 875 aa9.81□□□□□ -0.84
VSTM2A-208ENST00000498834 WBP1LQ9NX94 342 aa9.81□□□□□ -0.84
VSTM2A-208ENST00000498834 DCCP43146 1447 aa9.81□□□□□ -0.84
VSTM2A-208ENST00000498834 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa9.8□□□□□ -0.84
VSTM2A-208ENST00000498834 ORAI2Q96SN7 254 aa9.8□□□□□ -0.84
VSTM2A-208ENST00000498834 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
VSTM2A-208ENST00000498834 FAM198AQ9UFP1 575 aa9.8□□□□□ -0.84
VSTM2A-208ENST00000498834 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa9.8□□□□□ -0.84
VSTM2A-208ENST00000498834 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
VSTM2A-208ENST00000498834 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
VSTM2A-208ENST00000498834 RNF40O75150 1001 aa9.79□□□□□ -0.84
VSTM2A-208ENST00000498834 SAMD7Q7Z3H4 446 aa9.79□□□□□ -0.84
VSTM2A-208ENST00000498834 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
VSTM2A-208ENST00000498834 TMC1Q8TDI8 760 aa9.79□□□□□ -0.84
VSTM2A-208ENST00000498834 CABP1Q9NZU7 370 aa9.79□□□□□ -0.84
VSTM2A-208ENST00000498834 PLEKHG3A1L390 1219 aa9.78□□□□□ -0.84
VSTM2A-208ENST00000498834 FOXO3O43524 673 aa9.78□□□□□ -0.84
VSTM2A-208ENST00000498834 PSME1Q06323 249 aa9.78□□□□□ -0.84
VSTM2A-208ENST00000498834 BRINP3Q76B58 766 aa9.78□□□□□ -0.84
VSTM2A-208ENST00000498834 VSIG10Q8N0Z9 540 aa9.78□□□□□ -0.84
VSTM2A-208ENST00000498834 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa9.78□□□□□ -0.84
VSTM2A-208ENST00000498834 NECTIN2Q92692 538 aa9.78□□□□□ -0.84
VSTM2A-208ENST00000498834 POLR3GLQ9BT43 218 aa9.78□□□□□ -0.84
VSTM2A-208ENST00000498834 STRCP1A6NGW2 1772 aa9.78□□□□□ -0.84
VSTM2A-208ENST00000498834 PTGDRQ13258 359 aa9.77□□□□□ -0.85
VSTM2A-208ENST00000498834 C1orf167Q5SNV9 1468 aa9.77□□□□□ -0.85
VSTM2A-208ENST00000498834 ATAD2Q6PL18 1390 aa9.76□□□□□ -0.85
VSTM2A-208ENST00000498834 FCHSD2O94868 740 aa9.76□□□□□ -0.85
VSTM2A-208ENST00000498834 IFFO2Q5TF58 517 aa9.76□□□□□ -0.85
VSTM2A-208ENST00000498834 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa9.76□□□□□ -0.85
VSTM2A-208ENST00000498834 TERF2IPQ9NYB0 399 aa9.76□□□□□ -0.85
VSTM2A-208ENST00000498834 NPHP3Q7Z494 1330 aa9.76□□□□□ -0.85
VSTM2A-208ENST00000498834 PRR36Q9H6K5 1346 aa9.76□□□□□ -0.85
VSTM2A-208ENST00000498834 MST1RQ04912 1400 aa9.75□□□□□ -0.85
VSTM2A-208ENST00000498834 ANKARQ7Z5J8 1434 aa9.75□□□□□ -0.85
VSTM2A-208ENST00000498834 KRT28Q7Z3Y7 464 aa9.75□□□□□ -0.85
VSTM2A-208ENST00000498834 TTC13Q8NBP0 860 aa9.75□□□□□ -0.85
VSTM2A-208ENST00000498834 KNDC1Q76NI1 1749 aa9.74□□□□□ -0.85
VSTM2A-208ENST00000498834 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
VSTM2A-208ENST00000498834 KCNC4Q03721 635 aa9.74□□□□□ -0.85
VSTM2A-208ENST00000498834 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
VSTM2A-208ENST00000498834 SLF2Q8IX21 1173 aa9.74□□□□□ -0.85
VSTM2A-208ENST00000498834 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
VSTM2A-208ENST00000498834 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
VSTM2A-208ENST00000498834 ACEP12821 1306 aa9.74□□□□□ -0.85
VSTM2A-208ENST00000498834 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
VSTM2A-208ENST00000498834 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
VSTM2A-208ENST00000498834 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
VSTM2A-208ENST00000498834 DISP3Q9P2K9 1392 aa9.73□□□□□ -0.85
VSTM2A-208ENST00000498834 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
VSTM2A-208ENST00000498834 C3orf80F5H4A9 247 aa9.72□□□□□ -0.85
VSTM2A-208ENST00000498834 HSPA1LP34931 641 aa9.72□□□□□ -0.85
VSTM2A-208ENST00000498834 NINLQ9Y2I6 1382 aa9.72□□□□□ -0.85
VSTM2A-208ENST00000498834 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa9.71□□□□□ -0.85
VSTM2A-208ENST00000498834 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms