RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496887.6

KCNQ1-205, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 5

Gene KCNQ1, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-205ENST00000496887 KAT6BQ8WYB5 2073 aa23.01■■□□□ 1.27
KCNQ1-205ENST00000496887 TATP17735 454 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
KCNQ1-205ENST00000496887 ACSBG1Q96GR2 724 aa23.01■■□□□ 1.27
KCNQ1-205ENST00000496887 EYA1Q99502 592 aa23.01■■□□□ 1.27
KCNQ1-205ENST00000496887 PARD3Q8TEW0 1356 aa23.01■■□□□ 1.27
KCNQ1-205ENST00000496887 NCAPD2Q15021 1401 aa23■■□□□ 1.27
KCNQ1-205ENST00000496887 KCNQ2O43526 872 aa23■■□□□ 1.27
KCNQ1-205ENST00000496887 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
KCNQ1-205ENST00000496887 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa22.99■■□□□ 1.27
KCNQ1-205ENST00000496887 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
KCNQ1-205ENST00000496887 NUP188Q5SRE5 1749 aa22.98■■□□□ 1.27
KCNQ1-205ENST00000496887 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.97■■□□□ 1.27
KCNQ1-205ENST00000496887 BTAF1O14981 1849 aa22.96■■□□□ 1.27
KCNQ1-205ENST00000496887 PLSCR1O15162 318 aa22.96■■□□□ 1.27
KCNQ1-205ENST00000496887 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.96■■□□□ 1.27
KCNQ1-205ENST00000496887 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.96■■□□□ 1.27
KCNQ1-205ENST00000496887 MTHFSP49914 203 aa22.93■■□□□ 1.26
KCNQ1-205ENST00000496887 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.92■■□□□ 1.26
KCNQ1-205ENST00000496887 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
KCNQ1-205ENST00000496887 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.91■■□□□ 1.26
KCNQ1-205ENST00000496887 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.91■■□□□ 1.26
KCNQ1-205ENST00000496887 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
KCNQ1-205ENST00000496887 CYP27B1O15528 508 aa22.89■■□□□ 1.25
KCNQ1-205ENST00000496887 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
KCNQ1-205ENST00000496887 PROM2Q8N271 834 aa22.89■■□□□ 1.25
KCNQ1-205ENST00000496887 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
KCNQ1-205ENST00000496887 SPG7Q9UQ90 795 aa22.89■■□□□ 1.25
KCNQ1-205ENST00000496887 IL13P35225 146 aa22.88■■□□□ 1.25
KCNQ1-205ENST00000496887 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa22.87■■□□□ 1.25
KCNQ1-205ENST00000496887 NBPF14Q5TI25 921 aa22.87■■□□□ 1.25
KCNQ1-205ENST00000496887 TXNRD1Q16881 649 aa22.86■■□□□ 1.25
KCNQ1-205ENST00000496887 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.86■■□□□ 1.25
KCNQ1-205ENST00000496887 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.85■■□□□ 1.25
KCNQ1-205ENST00000496887 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.85■■□□□ 1.25
KCNQ1-205ENST00000496887 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.84■■□□□ 1.25
KCNQ1-205ENST00000496887 ITGB4P16144 1822 aa22.84■■□□□ 1.25
KCNQ1-205ENST00000496887 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
KCNQ1-205ENST00000496887 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.82■■□□□ 1.24
KCNQ1-205ENST00000496887 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
KCNQ1-205ENST00000496887 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
KCNQ1-205ENST00000496887 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.81■■□□□ 1.24
KCNQ1-205ENST00000496887 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
KCNQ1-205ENST00000496887 LY75O60449 1722 aa22.8■■□□□ 1.24
KCNQ1-205ENST00000496887 KDRP35968 1356 aa22.8■■□□□ 1.24
KCNQ1-205ENST00000496887 PHKG2P15735 406 aa22.8■■□□□ 1.24
KCNQ1-205ENST00000496887 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
KCNQ1-205ENST00000496887 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
KCNQ1-205ENST00000496887 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.78■■□□□ 1.24
KCNQ1-205ENST00000496887 PPP2R1AP30153 589 aa22.77■■□□□ 1.24
KCNQ1-205ENST00000496887 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.77■■□□□ 1.24
KCNQ1-205ENST00000496887 PAPPAQ13219 1627 aa22.76■■□□□ 1.23
KCNQ1-205ENST00000496887 HMOX1P09601 288 aa22.76■■□□□ 1.23
KCNQ1-205ENST00000496887 LRRC4BQ9NT99 713 aa22.76■■□□□ 1.23
KCNQ1-205ENST00000496887 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
KCNQ1-205ENST00000496887 CFAP53Q96M91 514 aa22.74■■□□□ 1.23
KCNQ1-205ENST00000496887 STK32BQ9NY57 414 aa22.74■■□□□ 1.23
KCNQ1-205ENST00000496887 LRP5O75197 1615 aa22.74■■□□□ 1.23
KCNQ1-205ENST00000496887 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
KCNQ1-205ENST00000496887 KCNQ4P56696 695 aa22.73■■□□□ 1.23
KCNQ1-205ENST00000496887 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.73■■□□□ 1.23
KCNQ1-205ENST00000496887 PIGBQ92521 554 aa22.73■■□□□ 1.23
KCNQ1-205ENST00000496887 SLC15A2Q16348 729 aa22.72■■□□□ 1.23
KCNQ1-205ENST00000496887 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
KCNQ1-205ENST00000496887 CASZ1Q86V15 1759 aa22.71■■□□□ 1.23
KCNQ1-205ENST00000496887 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.7■■□□□ 1.22
KCNQ1-205ENST00000496887 DCAF5Q96JK2 942 aa22.7■■□□□ 1.22
KCNQ1-205ENST00000496887 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.7■■□□□ 1.22
KCNQ1-205ENST00000496887 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
KCNQ1-205ENST00000496887 PALLDQ8WX93 1383 aa22.69■■□□□ 1.22
KCNQ1-205ENST00000496887 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
KCNQ1-205ENST00000496887 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF827Q17R98 1081 aa22.68■■□□□ 1.22
KCNQ1-205ENST00000496887 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
KCNQ1-205ENST00000496887 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.68■■□□□ 1.22
KCNQ1-205ENST00000496887 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.67■■□□□ 1.22
KCNQ1-205ENST00000496887 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
KCNQ1-205ENST00000496887 C5P01031 1676 aa22.67■■□□□ 1.22
KCNQ1-205ENST00000496887 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.66■■□□□ 1.22
KCNQ1-205ENST00000496887 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.66■■□□□ 1.22
KCNQ1-205ENST00000496887 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
KCNQ1-205ENST00000496887 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.65■■□□□ 1.22
KCNQ1-205ENST00000496887 AKT1S1Q96B36 256 aa22.65■■□□□ 1.22
KCNQ1-205ENST00000496887 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.65■■□□□ 1.22
KCNQ1-205ENST00000496887 NUDCQ9Y266 331 aa22.65■■□□□ 1.22
KCNQ1-205ENST00000496887 QSER1Q2KHR3 1735 aa22.64■■□□□ 1.21
KCNQ1-205ENST00000496887 CABP4P57796 275 aa22.63■■□□□ 1.21
KCNQ1-205ENST00000496887 ATG3Q9NT62 314 aa22.62■■□□□ 1.21
KCNQ1-205ENST00000496887 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
KCNQ1-205ENST00000496887 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.61■■□□□ 1.21
KCNQ1-205ENST00000496887 RALBP1Q15311 655 aa22.61■■□□□ 1.21
KCNQ1-205ENST00000496887 ZBTB7AO95365 584 aa22.6■■□□□ 1.21
KCNQ1-205ENST00000496887 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.6■■□□□ 1.21
KCNQ1-205ENST00000496887 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.6■■□□□ 1.21
KCNQ1-205ENST00000496887 LGR6Q9HBX8 967 aa22.6■■□□□ 1.21
KCNQ1-205ENST00000496887 SPON1Q9HCB6 807 aa22.6■■□□□ 1.21
KCNQ1-205ENST00000496887 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.6■■□□□ 1.21
KCNQ1-205ENST00000496887 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.59■■□□□ 1.21
KCNQ1-205ENST00000496887 PRKAR2BP31323 418 aa22.59■■□□□ 1.21
KCNQ1-205ENST00000496887 SIK1P57059 783 aa22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 165.3 ms