RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496553.5

NDUFS2-215, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S2, human

TSL 2

Gene NDUFS2, Length 888 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NDUFS2-215	ENST00000496553	NBPF4	Q96M43	638 aa		29.17	■■■□□ 2.26
NDUFS2-215	ENST00000496553	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		29.17	■■■□□ 2.26
NDUFS2-215	ENST00000496553	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		29.16	■■■□□ 2.26
NDUFS2-215	ENST00000496553	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	29.15	■■■□□ 2.26
NDUFS2-215	ENST00000496553	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	29.15	■■■□□ 2.26
NDUFS2-215	ENST00000496553	ZBTB7A	O95365	584 aa		29.14	■■■□□ 2.26
NDUFS2-215	ENST00000496553	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		29.14	■■■□□ 2.26
NDUFS2-215	ENST00000496553	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		29.14	■■■□□ 2.26
NDUFS2-215	ENST00000496553	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		29.14	■■■□□ 2.25
NDUFS2-215	ENST00000496553	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		29.12	■■■□□ 2.25
NDUFS2-215	ENST00000496553	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		29.11	■■■□□ 2.25
NDUFS2-215	ENST00000496553	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	29.11	■■■□□ 2.25
NDUFS2-215	ENST00000496553	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	29.11	■■■□□ 2.25
NDUFS2-215	ENST00000496553	PAPPA	Q13219	1627 aa		29.11	■■■□□ 2.25
NDUFS2-215	ENST00000496553	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	29.1	■■■□□ 2.25
NDUFS2-215	ENST00000496553	MTFR1L	Q9H019	292 aa		29.1	■■■□□ 2.25
NDUFS2-215	ENST00000496553	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		29.09	■■■□□ 2.25
NDUFS2-215	ENST00000496553	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	29.08	■■■□□ 2.25
NDUFS2-215	ENST00000496553	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		29.08	■■■□□ 2.25
NDUFS2-215	ENST00000496553	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		29.08	■■■□□ 2.25
NDUFS2-215	ENST00000496553	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	29.05	■■■□□ 2.24
NDUFS2-215	ENST00000496553	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		29.05	■■■□□ 2.24
NDUFS2-215	ENST00000496553	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		29.04	■■■□□ 2.24
NDUFS2-215	ENST00000496553	PTGER2	P43116	358 aa		29.03	■■■□□ 2.24
NDUFS2-215	ENST00000496553	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		29.02	■■■□□ 2.24
NDUFS2-215	ENST00000496553	ZNF827	Q17R98	1081 aa		29.02	■■■□□ 2.24
NDUFS2-215	ENST00000496553	NSD2	O96028	1365 aa		29.01	■■■□□ 2.24
NDUFS2-215	ENST00000496553	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	29.01	■■■□□ 2.23
NDUFS2-215	ENST00000496553	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	29	■■■□□ 2.23
NDUFS2-215	ENST00000496553	LY75	O60449	1722 aa		29	■■■□□ 2.23
NDUFS2-215	ENST00000496553	AKT1S1	Q96B36	256 aa		28.99	■■■□□ 2.23
NDUFS2-215	ENST00000496553	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	28.99	■■■□□ 2.23
NDUFS2-215	ENST00000496553	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		28.98	■■■□□ 2.23
NDUFS2-215	ENST00000496553	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		28.98	■■■□□ 2.23
NDUFS2-215	ENST00000496553	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		28.97	■■■□□ 2.23
NDUFS2-215	ENST00000496553	SPG7	Q9UQ90	795 aa		28.97	■■■□□ 2.23
NDUFS2-215	ENST00000496553	POLK	Q9UBT6	870 aa		28.96	■■■□□ 2.23
NDUFS2-215	ENST00000496553	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		28.95	■■■□□ 2.23
NDUFS2-215	ENST00000496553	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	28.95	■■■□□ 2.22
NDUFS2-215	ENST00000496553	PANK3	Q9H999	370 aa		28.95	■■■□□ 2.22
NDUFS2-215	ENST00000496553	NCAPD2	Q15021	1401 aa		28.94	■■■□□ 2.22
NDUFS2-215	ENST00000496553	KCNQ4	P56696	695 aa		28.93	■■■□□ 2.22
NDUFS2-215	ENST00000496553	ARX	Q96QS3	562 aa		28.93	■■■□□ 2.22
NDUFS2-215	ENST00000496553	CYP27B1	O15528	508 aa		28.92	■■■□□ 2.22
NDUFS2-215	ENST00000496553	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		28.92	■■■□□ 2.22
NDUFS2-215	ENST00000496553	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		28.92	■■■□□ 2.22
NDUFS2-215	ENST00000496553	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	28.92	■■■□□ 2.22
NDUFS2-215	ENST00000496553	YY1	P25490	414 aa		28.91	■■■□□ 2.22
NDUFS2-215	ENST00000496553	POLD1	P28340	1107 aa		28.91	■■■□□ 2.22
NDUFS2-215	ENST00000496553	EYA1	Q99502	592 aa		28.91	■■■□□ 2.22
NDUFS2-215	ENST00000496553	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		28.91	■■■□□ 2.22
NDUFS2-215	ENST00000496553	SYT17	Q9BSW7	474 aa		28.9	■■■□□ 2.22
NDUFS2-215	ENST00000496553	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	28.9	■■■□□ 2.22	2e-7	■■■□□ 16.7
NDUFS2-215	ENST00000496553	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.22
NDUFS2-215	ENST00000496553	PALLD	Q8WX93	1383 aa		28.88	■■■□□ 2.21
NDUFS2-215	ENST00000496553	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		28.87	■■■□□ 2.21
NDUFS2-215	ENST00000496553	MSH5	O43196	834 aa		28.86	■■■□□ 2.21
NDUFS2-215	ENST00000496553	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
NDUFS2-215	ENST00000496553	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		28.86	■■■□□ 2.21
NDUFS2-215	ENST00000496553	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
NDUFS2-215	ENST00000496553	MORC1	Q86VD1	984 aa		28.85	■■■□□ 2.21
NDUFS2-215	ENST00000496553	C5	P01031	1676 aa		28.85	■■■□□ 2.21
NDUFS2-215	ENST00000496553	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		28.85	■■■□□ 2.21
NDUFS2-215	ENST00000496553	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		28.85	■■■□□ 2.21
NDUFS2-215	ENST00000496553	ITGB4	P16144	1822 aa		28.85	■■■□□ 2.21
NDUFS2-215	ENST00000496553	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		28.84	■■■□□ 2.21
NDUFS2-215	ENST00000496553	MAP3K5	Q99683	1374 aa		28.84	■■■□□ 2.21
NDUFS2-215	ENST00000496553	KLHL34	Q8N239	644 aa		28.81	■■■□□ 2.2
NDUFS2-215	ENST00000496553	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		28.81	■■■□□ 2.2
NDUFS2-215	ENST00000496553	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		28.81	■■■□□ 2.2
NDUFS2-215	ENST00000496553	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		28.79	■■■□□ 2.2
NDUFS2-215	ENST00000496553	PHKG2	P15735	406 aa		28.79	■■■□□ 2.2
NDUFS2-215	ENST00000496553	PIGB	Q92521	554 aa		28.79	■■■□□ 2.2
NDUFS2-215	ENST00000496553	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		28.79	■■■□□ 2.2
NDUFS2-215	ENST00000496553	AK7	Q96M32	723 aa		28.77	■■■□□ 2.2
NDUFS2-215	ENST00000496553	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		28.77	■■■□□ 2.2
NDUFS2-215	ENST00000496553	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	28.76	■■■□□ 2.19
NDUFS2-215	ENST00000496553	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	28.75	■■■□□ 2.19
NDUFS2-215	ENST00000496553	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	28.74	■■■□□ 2.19
NDUFS2-215	ENST00000496553	C4B	P0C0L5	1744 aa		28.74	■■■□□ 2.19
NDUFS2-215	ENST00000496553	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		28.72	■■■□□ 2.19
NDUFS2-215	ENST00000496553	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		28.72	■■■□□ 2.19
NDUFS2-215	ENST00000496553	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		28.71	■■■□□ 2.19
NDUFS2-215	ENST00000496553	SIK1	P57059	783 aa		28.71	■■■□□ 2.19
NDUFS2-215	ENST00000496553	GPR162	Q16538	588 aa		28.7	■■■□□ 2.18
NDUFS2-215	ENST00000496553	DCAF5	Q96JK2	942 aa		28.69	■■■□□ 2.18
NDUFS2-215	ENST00000496553	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		28.68	■■■□□ 2.18
NDUFS2-215	ENST00000496553	MSL1	Q68DK7	614 aa		28.68	■■■□□ 2.18
NDUFS2-215	ENST00000496553	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	28.68	■■■□□ 2.18
NDUFS2-215	ENST00000496553	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		28.67	■■■□□ 2.18
NDUFS2-215	ENST00000496553	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		28.67	■■■□□ 2.18
NDUFS2-215	ENST00000496553	ATP6V1A	P38606	617 aa		28.66	■■■□□ 2.18
NDUFS2-215	ENST00000496553	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	28.66	■■■□□ 2.18
NDUFS2-215	ENST00000496553	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	28.65	■■■□□ 2.18
NDUFS2-215	ENST00000496553	PHF14	O94880	888 aa		28.64	■■■□□ 2.18
NDUFS2-215	ENST00000496553	SSFA2	P28290	1259 aa		28.64	■■■□□ 2.18
NDUFS2-215	ENST00000496553	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		28.64	■■■□□ 2.18
NDUFS2-215	ENST00000496553	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		28.63	■■■□□ 2.17
NDUFS2-215	ENST00000496553	CHD4	Q14839	1912 aa		28.63	■■■□□ 2.17
NDUFS2-215	ENST00000496553	ATG3	Q9NT62	314 aa		28.63	■■■□□ 2.17

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms