RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495428.5

CMC1-211, Transcript of C-X9-C motif containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene CMC1, Length 608 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1-211ENST00000495428 DNMT3LQ9UJW3 386 aa6.99□□□□□ -1.29
CMC1-211ENST00000495428 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa6.98□□□□□ -1.29
CMC1-211ENST00000495428 SCTRP47872 440 aa6.98□□□□□ -1.29
CMC1-211ENST00000495428 NPAS3Q8IXF0 933 aa6.98□□□□□ -1.29
CMC1-211ENST00000495428 TRAK2O60296 914 aa6.97□□□□□ -1.29
CMC1-211ENST00000495428 MYCP01106 439 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CMC1-211ENST00000495428 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CMC1-211ENST00000495428 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP6.97□□□□□ -1.29
CMC1-211ENST00000495428 CYP2U1Q7Z449 544 aa6.97□□□□□ -1.29
CMC1-211ENST00000495428 SLC16A10Q8TF71 515 aa6.97□□□□□ -1.29
CMC1-211ENST00000495428 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CMC1-211ENST00000495428 CHIC2Q9UKJ5 165 aa6.97□□□□□ -1.29
CMC1-211ENST00000495428 DOLKQ9UPQ8 538 aa6.97□□□□□ -1.29
CMC1-211ENST00000495428 FIGNL2A6NMB9 653 aa6.96□□□□□ -1.3
CMC1-211ENST00000495428 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CMC1-211ENST00000495428 OSBPL3Q9H4L5 887 aa6.96□□□□□ -1.3
CMC1-211ENST00000495428 ALG2Q9H553 416 aa6.96□□□□□ -1.3
CMC1-211ENST00000495428 A0A1W2PRU2 124 aa6.95□□□□□ -1.3
CMC1-211ENST00000495428 USP4Q13107 963 aa6.95□□□□□ -1.3
CMC1-211ENST00000495428 MAP7D1Q3KQU3 841 aa6.95□□□□□ -1.3
CMC1-211ENST00000495428 TSGA10IPQ3SY00 556 aa6.95□□□□□ -1.3
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CMC1-211ENST00000495428 H3BM21 787 aa6.94□□□□□ -1.3
CMC1-211ENST00000495428 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CMC1-211ENST00000495428 CLUAP1Q96AJ1 413 aa6.94□□□□□ -1.3
CMC1-211ENST00000495428 SIRT1Q96EB6 747 aa6.94□□□□□ -1.3
CMC1-211ENST00000495428 POM121CA8CG34 1229 aa6.93□□□□□ -1.3
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CMC1-211ENST00000495428 GNRH1P01148 92 aa6.93□□□□□ -1.3
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CMC1-211ENST00000495428 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CMC1-211ENST00000495428 CLN3Q13286 438 aa6.93□□□□□ -1.3
CMC1-211ENST00000495428 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.93□□□□□ -1.3
CMC1-211ENST00000495428 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CMC1-211ENST00000495428 PLPP7Q8NBV4 271 aa6.93□□□□□ -1.3
CMC1-211ENST00000495428 A6NJR5 290 aa6.92□□□□□ -1.3
CMC1-211ENST00000495428 VEGFBP49765 207 aa6.92□□□□□ -1.3
CMC1-211ENST00000495428 PTSQ03393 145 aa6.92□□□□□ -1.3
CMC1-211ENST00000495428 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CMC1-211ENST00000495428 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CMC1-211ENST00000495428 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa6.92□□□□□ -1.3
CMC1-211ENST00000495428 NLRP3Q96P20 1036 aa6.92□□□□□ -1.3
CMC1-211ENST00000495428 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa6.92□□□□□ -1.3
CMC1-211ENST00000495428 PIK3CDO00329 1044 aa6.91□□□□□ -1.3
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CMC1-211ENST00000495428 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa6.91□□□□□ -1.3
CMC1-211ENST00000495428 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa6.91□□□□□ -1.3
CMC1-211ENST00000495428 IRF7Q92985 503 aa6.91□□□□□ -1.3
CMC1-211ENST00000495428 SKIP12755 728 aa6.9□□□□□ -1.3
CMC1-211ENST00000495428 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa6.9□□□□□ -1.3
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CMC1-211ENST00000495428 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CMC1-211ENST00000495428 VSIG8P0DPA2 414 aa6.89□□□□□ -1.31
CMC1-211ENST00000495428 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CMC1-211ENST00000495428 GMPRP36959 345 aa6.89□□□□□ -1.31
CMC1-211ENST00000495428 ESCO1Q5FWF5 840 aa6.89□□□□□ -1.31
CMC1-211ENST00000495428 SLC27A3Q5K4L6 730 aa6.89□□□□□ -1.31
CMC1-211ENST00000495428 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa6.89□□□□□ -1.31
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CMC1-211ENST00000495428 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa6.89□□□□□ -1.31
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CMC1-211ENST00000495428 ERBB4Q15303 1308 aa6.88□□□□□ -1.31
CMC1-211ENST00000495428 IL2RAP01589 272 aa6.88□□□□□ -1.31
CMC1-211ENST00000495428 XAGE2Q96GT9 111 aa6.88□□□□□ -1.31
CMC1-211ENST00000495428 GRIP2Q9C0E4 1043 aa6.88□□□□□ -1.31
CMC1-211ENST00000495428 HRH3Q9Y5N1 445 aa6.88□□□□□ -1.31
CMC1-211ENST00000495428 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa6.87□□□□□ -1.31
CMC1-211ENST00000495428 USP17L5A8MUK1 530 aa6.87□□□□□ -1.31
CMC1-211ENST00000495428 EML3Q32P44 896 aa6.87□□□□□ -1.31
CMC1-211ENST00000495428 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa6.86□□□□□ -1.31
CMC1-211ENST00000495428 RHOQP17081 205 aa6.86□□□□□ -1.31
CMC1-211ENST00000495428 CENPCQ03188 943 aa6.86□□□□□ -1.31
CMC1-211ENST00000495428 GLMNQ92990 594 aa6.86□□□□□ -1.31
CMC1-211ENST00000495428 UCN2Q96RP3 112 aa6.86□□□□□ -1.31
CMC1-211ENST00000495428 ETNK1Q9HBU6 452 aa6.86□□□□□ -1.31
CMC1-211ENST00000495428 NOD1Q9Y239 953 aa6.86□□□□□ -1.31
CMC1-211ENST00000495428 ITGA6P23229 1130 aa6.85□□□□□ -1.31
CMC1-211ENST00000495428 SCNN1DP51172 638 aa6.85□□□□□ -1.31
CMC1-211ENST00000495428 POU4F2Q12837 409 aa6.85□□□□□ -1.31
CMC1-211ENST00000495428 NCOA4Q13772 614 aa6.85□□□□□ -1.31
CMC1-211ENST00000495428 WDR44Q5JSH3 913 aa6.85□□□□□ -1.31
CMC1-211ENST00000495428 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CMC1-211ENST00000495428 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa6.85□□□□□ -1.31
CMC1-211ENST00000495428 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa6.85□□□□□ -1.31
CMC1-211ENST00000495428 NBPF15Q8N660 670 aa6.85□□□□□ -1.31
CMC1-211ENST00000495428 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CMC1-211ENST00000495428 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa6.85□□□□□ -1.31
CMC1-211ENST00000495428 WASLO00401 505 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CMC1-211ENST00000495428 ATP9BO43861 1147 aa6.84□□□□□ -1.31
CMC1-211ENST00000495428 STAU1O95793 577 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CMC1-211ENST00000495428 INHAP05111 366 aa6.84□□□□□ -1.31
CMC1-211ENST00000495428 GDF10P55107 478 aa6.84□□□□□ -1.31
CMC1-211ENST00000495428 TAS1R3Q7RTX0 852 aa6.84□□□□□ -1.31
CMC1-211ENST00000495428 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CMC1-211ENST00000495428 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CMC1-211ENST00000495428 USP17L3A6NCW0 530 aa6.83□□□□□ -1.32
CMC1-211ENST00000495428 USP17L4A6NCW7 530 aa6.83□□□□□ -1.32
CMC1-211ENST00000495428 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
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